RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495350.5

CBX1-205, Transcript of chromobox 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CBX1, Length 550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1-205ENST00000495350 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 FGF14Q92915 247 aa6.92□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 TMEM87BQ96K49 555 aa6.92□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 NLRP4Q96MN2 994 aa6.92□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 MTA3Q9BTC8 594 aa6.92□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 OSBPL3Q9H4L5 887 aa6.92□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 RXFP1Q9HBX9 757 aa6.92□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 UBN1Q9NPG3 1134 aa6.92□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 DISC1Q9NRI5 854 aa6.92□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 SEMA4GQ9NTN9 838 aa6.92□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 POLIQ9UNA4 740 aa6.92□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 ZFHX4Q86UP3 3567 aa6.92□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 CEP295Q9C0D2 2601 aa6.91□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 CHMP2AO43633 222 aa6.91□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 B4GALT3O60512 393 aa6.91□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 ZMYND10O75800 440 aa6.91□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 DDHD2O94830 711 aa6.91□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP6.91□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 TGM1P22735 817 aa6.91□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 TARSP26639 723 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 SFNP31947 248 aa6.91□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 CCR3P51677 355 aa6.91□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 JAK3P52333 1124 aa6.91□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 MTAPQ13126 283 aa6.91□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 CSRP2Q16527 193 aa6.91□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 USP41Q3LFD5 358 aa6.91□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 MTERF2Q49AM1 385 aa6.91□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 PRR16Q569H4 304 aa6.91□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 PPM1LQ5SGD2 360 aa6.91□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa6.91□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 AGMOQ6ZNB7 445 aa6.91□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 CHD1LQ86WJ1 897 aa6.91□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 HACE1Q8IYU2 909 aa6.91□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 FANCBQ8NB91 859 aa6.91□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 CNNM3Q8NE01 707 aa6.91□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 NELL1Q92832 810 aa6.91□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 FGF13Q92913 245 aa6.91□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 CLDN23Q96B33 292 aa6.91□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 KXD1Q9BQD3 176 aa6.91□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 IER2Q9BTL4 223 aa6.91□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 COLEC11Q9BWP8 271 aa6.91□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 IL25Q9H293 177 aa6.91□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa6.91□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 MARCH5Q9NX47 278 aa6.91□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 PATJQ8NI35 1801 aa6.9□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa6.9□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 MAN2B1O00754 1011 aa6.9□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 ZNF862O60290 1169 aa6.9□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 GAS7O60861 476 aa6.9□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 ERLIN2O94905 339 aa6.9□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 CYP3A4P08684 503 aa6.9□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 ITGA4P13612 1032 aa6.9□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 PMLP29590 882 aa6.9□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 LIFRP42702 1097 aa6.9□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 SHC2P98077 582 aa6.9□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 PTH1RQ03431 593 aa6.9□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 DRP2Q13474 957 aa6.9□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 FUT10Q6P4F1 479 aa6.9□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 CEP68Q76N32 757 aa6.9□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 TAS1R1Q7RTX1 841 aa6.9□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 COLGALT2Q8IYK4 626 aa6.9□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 GPR65Q8IYL9 337 aa6.9□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 HEBP1Q9NRV9 189 aa6.9□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 BARHL2Q9NY43 387 aa6.9□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 FNIP2Q9P278 1114 aa6.9□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa6.9□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 F5P12259 2224 aa6.9□□□□□ -1.3
CBX1-205ENST00000495350 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa6.9□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 MYH15Q9Y2K3 1946 aa6.89□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 CCL16O15467 120 aa6.89□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 PAPLNO95428 1278 aa6.89□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 PROS1P07225 676 aa6.89□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 C8AP07357 584 aa6.89□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 RPL17P18621 184 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 NCLP19338 710 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 HOXA9P31269 272 aa6.89□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 MLH1P40692 756 aa6.89□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 CLK2P49760 499 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 SCNN1GP51170 649 aa6.89□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 NTHL1P78549 312 aa6.89□□□□□ -1.31
CBX1-205ENST00000495350 UGCGQ16739 394 aa6.89□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.7 ms