RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495022.5

TRDMT1-211, Transcript of tRNA aspartic acid methyltransferase 1, humanhuman

TSL 2

Gene TRDMT1, Length 1,374 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDMT1-211ENST00000495022 IPPQ9Y573 584 aa25.11■■□□□ 1.61
TRDMT1-211ENST00000495022 NRP1O14786 923 aa25.1■■□□□ 1.61
TRDMT1-211ENST00000495022 LILRB3O75022 631 aa25.1■■□□□ 1.61
TRDMT1-211ENST00000495022 DGAT1O75907 488 aa25.1■■□□□ 1.61
TRDMT1-211ENST00000495022 AVPR2P30518 371 aa25.1■■□□□ 1.61
TRDMT1-211ENST00000495022 CLCN4P51793 760 aa25.1■■□□□ 1.61
TRDMT1-211ENST00000495022 VCPP55072 806 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
TRDMT1-211ENST00000495022 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
TRDMT1-211ENST00000495022 TCF15Q12870 199 aa25.1■■□□□ 1.61
TRDMT1-211ENST00000495022 ME3Q16798 604 aa25.1■■□□□ 1.61
TRDMT1-211ENST00000495022 NECAB1Q8N987 351 aa25.1■■□□□ 1.61
TRDMT1-211ENST00000495022 KLHL5Q96PQ7 755 aa25.1■■□□□ 1.61
TRDMT1-211ENST00000495022 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
TRDMT1-211ENST00000495022 DOCK8Q8NF50 2099 aa25.09■■□□□ 1.61
TRDMT1-211ENST00000495022 BRD1O95696 1058 aa25.09■■□□□ 1.61
TRDMT1-211ENST00000495022 SOD2P04179 222 aa25.09■■□□□ 1.61
TRDMT1-211ENST00000495022 CNPP09543 421 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
TRDMT1-211ENST00000495022 KLRC2P26717 231 aa25.09■■□□□ 1.61
TRDMT1-211ENST00000495022 KANK3Q6NY19 840 aa25.09■■□□□ 1.61
TRDMT1-211ENST00000495022 NFKBIZQ9BYH8 718 aa25.09■■□□□ 1.61
TRDMT1-211ENST00000495022 CSRNP2Q9H175 543 aa25.09■■□□□ 1.61
TRDMT1-211ENST00000495022 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
TRDMT1-211ENST00000495022 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
TRDMT1-211ENST00000495022 ARL5CA6NH57 179 aa25.08■■□□□ 1.61
TRDMT1-211ENST00000495022 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa25.08■■□□□ 1.61
TRDMT1-211ENST00000495022 NEMFO60524 1076 aa25.08■■□□□ 1.61
TRDMT1-211ENST00000495022 LARGE1O95461 756 aa25.08■■□□□ 1.61
TRDMT1-211ENST00000495022 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP25.08■■□□□ 1.61
TRDMT1-211ENST00000495022 NEFLP07196 543 aa25.08■■□□□ 1.61
TRDMT1-211ENST00000495022 NUBP1P53384 320 aa25.08■■□□□ 1.61
TRDMT1-211ENST00000495022 TMC5Q6UXY8 1006 aa25.08■■□□□ 1.61
TRDMT1-211ENST00000495022 GPR149Q86SP6 731 aa25.08■■□□□ 1.61
TRDMT1-211ENST00000495022 COLGALT2Q8IYK4 626 aa25.08■■□□□ 1.61
TRDMT1-211ENST00000495022 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
TRDMT1-211ENST00000495022 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
TRDMT1-211ENST00000495022 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
TRDMT1-211ENST00000495022 MARCH5Q9NX47 278 aa25.08■■□□□ 1.61
TRDMT1-211ENST00000495022 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa25.08■■□□□ 1.61
TRDMT1-211ENST00000495022 MYO15AQ9UKN7 3530 aa25.08■■□□□ 1.61
TRDMT1-211ENST00000495022 URODP06132 367 aa25.07■■□□□ 1.6
TRDMT1-211ENST00000495022 ARL2P36404 184 aa25.07■■□□□ 1.6
TRDMT1-211ENST00000495022 MBTD1Q05BQ5 628 aa25.07■■□□□ 1.6
TRDMT1-211ENST00000495022 DSC1Q08554 894 aa25.07■■□□□ 1.6
TRDMT1-211ENST00000495022 CAPSQ13938 189 aa25.07■■□□□ 1.6
TRDMT1-211ENST00000495022 ASAP3Q8TDY4 903 aa25.07■■□□□ 1.6
TRDMT1-211ENST00000495022 CPB2Q96IY4 423 aa25.07■■□□□ 1.6
TRDMT1-211ENST00000495022 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa25.07■■□□□ 1.6
TRDMT1-211ENST00000495022 CFAP54Q96N23 3096 aa25.07■■□□□ 1.6
TRDMT1-211ENST00000495022 SPDYE4A6NLX3 237 aa25.06■■□□□ 1.6
TRDMT1-211ENST00000495022 BTBD18B2RXH4 712 aa25.06■■□□□ 1.6
TRDMT1-211ENST00000495022 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
TRDMT1-211ENST00000495022 RARRES1P49788 294 aa25.06■■□□□ 1.6
TRDMT1-211ENST00000495022 AMHR2Q16671 573 aa25.06■■□□□ 1.6
TRDMT1-211ENST00000495022 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa25.06■■□□□ 1.6
TRDMT1-211ENST00000495022 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
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TRDMT1-211ENST00000495022 MTMR9Q96QG7 549 aa25.06■■□□□ 1.6
TRDMT1-211ENST00000495022 VPS13AQ96RL7 3174 aa25.06■■□□□ 1.6
TRDMT1-211ENST00000495022 GAD1Q99259 594 aa25.06■■□□□ 1.6
TRDMT1-211ENST00000495022 PHOX2BQ99453 314 aa25.06■■□□□ 1.6
TRDMT1-211ENST00000495022 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa25.06■■□□□ 1.6
TRDMT1-211ENST00000495022 RNF39Q9H2S5 420 aa25.06■■□□□ 1.6
TRDMT1-211ENST00000495022 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
TRDMT1-211ENST00000495022 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
TRDMT1-211ENST00000495022 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa25.06■■□□□ 1.6
TRDMT1-211ENST00000495022 EFEMP2O95967 443 aa25.05■■□□□ 1.6
TRDMT1-211ENST00000495022 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP25.05■■□□□ 1.6
TRDMT1-211ENST00000495022 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
TRDMT1-211ENST00000495022 MLH1P40692 756 aa25.05■■□□□ 1.6
TRDMT1-211ENST00000495022 TRIM29Q14134 588 aa25.05■■□□□ 1.6
TRDMT1-211ENST00000495022 CCDC149Q6ZUS6 474 aa25.05■■□□□ 1.6
TRDMT1-211ENST00000495022 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
TRDMT1-211ENST00000495022 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
TRDMT1-211ENST00000495022 RPS6KC1Q96S38 1066 aa25.05■■□□□ 1.6
TRDMT1-211ENST00000495022 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
TRDMT1-211ENST00000495022 LIMD1Q9UGP4 676 aa25.05■■□□□ 1.6
TRDMT1-211ENST00000495022 GIT1Q9Y2X7 761 aa25.05■■□□□ 1.6
TRDMT1-211ENST00000495022 HES2Q9Y543 173 aa25.05■■□□□ 1.6
TRDMT1-211ENST00000495022 WNT7AO00755 349 aa25.05■■□□□ 1.6
TRDMT1-211ENST00000495022 ASGR2P07307 311 aa25.05■■□□□ 1.6
TRDMT1-211ENST00000495022 ADH1AP07327 375 aa25.05■■□□□ 1.6
TRDMT1-211ENST00000495022 GLRA2P23416 452 aa25.05■■□□□ 1.6
TRDMT1-211ENST00000495022 TXKP42681 527 aa25.05■■□□□ 1.6
TRDMT1-211ENST00000495022 OR1G1P47890 313 aa25.05■■□□□ 1.6
TRDMT1-211ENST00000495022 OTOP3Q7RTS5 596 aa25.05■■□□□ 1.6
TRDMT1-211ENST00000495022 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
TRDMT1-211ENST00000495022 ZFP42Q96MM3 310 aa25.05■■□□□ 1.6
TRDMT1-211ENST00000495022 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
TRDMT1-211ENST00000495022 NR1I2O75469 434 aa25.04■■□□□ 1.6
TRDMT1-211ENST00000495022 GLUD2P49448 558 aa25.04■■□□□ 1.6
TRDMT1-211ENST00000495022 SCNN1GP51170 649 aa25.04■■□□□ 1.6
TRDMT1-211ENST00000495022 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa25.04■■□□□ 1.6
TRDMT1-211ENST00000495022 FEZF2Q8TBJ5 459 aa25.04■■□□□ 1.6
TRDMT1-211ENST00000495022 PIGOQ8TEQ8 1089 aa25.04■■□□□ 1.6
TRDMT1-211ENST00000495022 DPP7Q9UHL4 492 aa25.04■■□□□ 1.6
TRDMT1-211ENST00000495022 TRIP11Q15643 1979 aa25.03■■□□□ 1.6
TRDMT1-211ENST00000495022 C2CD2LO14523 706 aa25.03■■□□□ 1.6
TRDMT1-211ENST00000495022 JAK2O60674 1132 aa25.03■■□□□ 1.6
TRDMT1-211ENST00000495022 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
TRDMT1-211ENST00000495022 KIAA0319Q5VV43 1072 aa25.03■■□□□ 1.6
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