RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489160.1

CCL20-204, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

TSL 3

Gene CCL20, Length 673 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-204ENST00000489160 NOMO1Q15155 1222 aa6.43□□□□□ -1.38
CCL20-204ENST00000489160 LILRA6Q6PI73 481 aa6.43□□□□□ -1.38
CCL20-204ENST00000489160 ABHD15Q6UXT9 468 aa6.43□□□□□ -1.38
CCL20-204ENST00000489160 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa6.43□□□□□ -1.38
CCL20-204ENST00000489160 USP45Q70EL2 814 aa6.43□□□□□ -1.38
CCL20-204ENST00000489160 MIGA2Q7L4E1 593 aa6.43□□□□□ -1.38
CCL20-204ENST00000489160 KBTBD2Q8IY47 623 aa6.43□□□□□ -1.38
CCL20-204ENST00000489160 LRGUKQ96M69 825 aa6.43□□□□□ -1.38
CCL20-204ENST00000489160 KCNC2Q96PR1 638 aa6.43□□□□□ -1.38
CCL20-204ENST00000489160 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
CCL20-204ENST00000489160 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa6.43□□□□□ -1.38
CCL20-204ENST00000489160 ANLNQ9NQW6 1124 aa6.43□□□□□ -1.38
CCL20-204ENST00000489160 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa6.43□□□□□ -1.38
CCL20-204ENST00000489160 IPPQ9Y573 584 aa6.43□□□□□ -1.38
CCL20-204ENST00000489160 ARHGAP6O43182 974 aa6.42□□□□□ -1.38
CCL20-204ENST00000489160 AP1G1O43747 822 aa6.42□□□□□ -1.38
CCL20-204ENST00000489160 NOBOXO60393 691 aa6.42□□□□□ -1.38
CCL20-204ENST00000489160 ENDOD1O94919 500 aa6.42□□□□□ -1.38
CCL20-204ENST00000489160 EDNRBP24530 442 aa6.42□□□□□ -1.38
CCL20-204ENST00000489160 ECHS1P30084 290 aa6.42□□□□□ -1.38
CCL20-204ENST00000489160 MST1LQ2TV78 715 aa6.42□□□□□ -1.38
CCL20-204ENST00000489160 ATAT1Q5SQI0 421 aa6.42□□□□□ -1.38
CCL20-204ENST00000489160 BORAQ6PGQ7 559 aa6.42□□□□□ -1.38
CCL20-204ENST00000489160 CATIPQ7Z7H3 387 aa6.42□□□□□ -1.38
CCL20-204ENST00000489160 PRR18Q8N4B5 295 aa6.42□□□□□ -1.38
CCL20-204ENST00000489160 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
CCL20-204ENST00000489160 DPF2Q92785 391 aa6.42□□□□□ -1.38
CCL20-204ENST00000489160 HPS3Q969F9 1004 aa6.42□□□□□ -1.38
CCL20-204ENST00000489160 MAP3K14Q99558 947 aa6.42□□□□□ -1.38
CCL20-204ENST00000489160 C7orf25Q9BPX7 421 aa6.42□□□□□ -1.38
CCL20-204ENST00000489160 SLC6A15Q9H2J7 730 aa6.42□□□□□ -1.38
CCL20-204ENST00000489160 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa6.42□□□□□ -1.38
CCL20-204ENST00000489160 PARD6AQ9NPB6 346 aa6.42□□□□□ -1.38
CCL20-204ENST00000489160 RCAN3Q9UKA8 241 aa6.42□□□□□ -1.38
CCL20-204ENST00000489160 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa6.42□□□□□ -1.38
CCL20-204ENST00000489160 VSTM5A8MXK1 200 aa6.41□□□□□ -1.38
CCL20-204ENST00000489160 PRC1O43663 620 aa6.41□□□□□ -1.38
CCL20-204ENST00000489160 TOX4O94842 621 aa6.41□□□□□ -1.38
CCL20-204ENST00000489160 JUNP05412 331 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
CCL20-204ENST00000489160 VSIG10L2P0DP72 767 aa6.41□□□□□ -1.38
CCL20-204ENST00000489160 ADCY7P51828 1080 aa6.41□□□□□ -1.38
CCL20-204ENST00000489160 BPIFB4P59827 614 aa6.41□□□□□ -1.38
CCL20-204ENST00000489160 HGFACQ04756 655 aa6.41□□□□□ -1.38
CCL20-204ENST00000489160 GAGE13Q4V321 117 aa6.41□□□□□ -1.38
CCL20-204ENST00000489160 FBLN7Q53RD9 439 aa6.41□□□□□ -1.38
CCL20-204ENST00000489160 B3GNT9Q6UX72 402 aa6.41□□□□□ -1.38
CCL20-204ENST00000489160 PLEKHH3Q7Z736 793 aa6.41□□□□□ -1.38
CCL20-204ENST00000489160 OR14K1Q8NGZ2 314 aa6.41□□□□□ -1.38
CCL20-204ENST00000489160 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP6.41□□□□□ -1.38
CCL20-204ENST00000489160 SLC35G2Q8TBE7 412 aa6.41□□□□□ -1.38
CCL20-204ENST00000489160 ZNF480Q8WV37 535 aa6.41□□□□□ -1.38
CCL20-204ENST00000489160 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
CCL20-204ENST00000489160 MVB12AQ96EY5 273 aa6.41□□□□□ -1.38
CCL20-204ENST00000489160 TLR9Q9NR96 1032 aa6.41□□□□□ -1.38
CCL20-204ENST00000489160 ING3Q9NXR8 418 aa6.41□□□□□ -1.38
CCL20-204ENST00000489160 NR2E1Q9Y466 385 aa6.41□□□□□ -1.38
CCL20-204ENST00000489160 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
CCL20-204ENST00000489160 NRP1O14786 923 aa6.4□□□□□ -1.38
CCL20-204ENST00000489160 GASTP01350 101 aa6.4□□□□□ -1.38
CCL20-204ENST00000489160 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
CCL20-204ENST00000489160 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
CCL20-204ENST00000489160 TBX4P57082 545 aa6.4□□□□□ -1.38
CCL20-204ENST00000489160 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
CCL20-204ENST00000489160 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP6.4□□□□□ -1.38
CCL20-204ENST00000489160 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
CCL20-204ENST00000489160 SEPT2Q15019 361 aa6.4□□□□□ -1.38
CCL20-204ENST00000489160 TBR1Q16650 682 aa6.4□□□□□ -1.38
CCL20-204ENST00000489160 C3orf36Q3SXR2 165 aa6.4□□□□□ -1.38
CCL20-204ENST00000489160 NT5DC1Q5TFE4 455 aa6.4□□□□□ -1.38
CCL20-204ENST00000489160 KRT40Q6A162 431 aa6.4□□□□□ -1.38
CCL20-204ENST00000489160 PPP4R3AQ6IN85 833 aa6.4□□□□□ -1.38
CCL20-204ENST00000489160 OR2I1PQ8NGU4 316 aa6.4□□□□□ -1.38
CCL20-204ENST00000489160 RUNDC1Q96C34 613 aa6.4□□□□□ -1.38
CCL20-204ENST00000489160 TAAR9Q96RI9 348 aa6.4□□□□□ -1.38
CCL20-204ENST00000489160 BCO1Q9HAY6 547 aa6.4□□□□□ -1.38
CCL20-204ENST00000489160 PRDM11Q9NQV5 511 aa6.4□□□□□ -1.38
CCL20-204ENST00000489160 OBP2AQ9NY56 170 aa6.4□□□□□ -1.38
CCL20-204ENST00000489160 B4GALT3O60512 393 aa6.39□□□□□ -1.39
CCL20-204ENST00000489160 B4GALT4O60513 344 aa6.39□□□□□ -1.39
CCL20-204ENST00000489160 GYPEP15421 78 aa6.39□□□□□ -1.39
CCL20-204ENST00000489160 CRHR1P34998 444 aa6.39□□□□□ -1.39
CCL20-204ENST00000489160 GNALP38405 381 aa6.39□□□□□ -1.39
CCL20-204ENST00000489160 RNF151Q2KHN1 245 aa6.39□□□□□ -1.39
CCL20-204ENST00000489160 PGS1Q32NB8 556 aa6.39□□□□□ -1.39
CCL20-204ENST00000489160 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa6.39□□□□□ -1.39
CCL20-204ENST00000489160 Q6ZVL8 140 aa6.39□□□□□ -1.39
CCL20-204ENST00000489160 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa6.39□□□□□ -1.39
CCL20-204ENST00000489160 LGI4Q8N135 537 aa6.39□□□□□ -1.39
CCL20-204ENST00000489160 ANKRD53Q8N9V6 530 aa6.39□□□□□ -1.39
CCL20-204ENST00000489160 OR7D4Q8NG98 312 aa6.39□□□□□ -1.39
CCL20-204ENST00000489160 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
CCL20-204ENST00000489160 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa6.39□□□□□ -1.39
CCL20-204ENST00000489160 CYFIP2Q96F07 1278 aa6.39□□□□□ -1.39
CCL20-204ENST00000489160 MANSC1Q9H8J5 431 aa6.39□□□□□ -1.39
CCL20-204ENST00000489160 USP40Q9NVE5 1235 aa6.39□□□□□ -1.39
CCL20-204ENST00000489160 GPRC5DQ9NZD1 345 aa6.39□□□□□ -1.39
CCL20-204ENST00000489160 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa6.39□□□□□ -1.39
CCL20-204ENST00000489160 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
CCL20-204ENST00000489160 PMS2P1A4D2B8 440 aa6.38□□□□□ -1.39
CCL20-204ENST00000489160 SGTAO43765 313 aa6.38□□□□□ -1.39
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