RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487284.2

CUX1-209, Transcript of cut like homeobox 1, humanhuman

TSL 2

Gene CUX1, Length 1,566 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX1-209ENST00000487284 EPHB6O15197 1021 aa15.49■□□□□ 0.07
CUX1-209ENST00000487284 MAGEB2O15479 319 aa15.49■□□□□ 0.07
CUX1-209ENST00000487284 CABYRO75952 493 aa15.49■□□□□ 0.07
CUX1-209ENST00000487284 SGPL1O95470 568 aa15.49■□□□□ 0.07
CUX1-209ENST00000487284 HOXC8P31273 242 aa15.49■□□□□ 0.07
CUX1-209ENST00000487284 ADAM17P78536 824 aa15.49■□□□□ 0.07
CUX1-209ENST00000487284 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
CUX1-209ENST00000487284 PPP2R5AQ15172 486 aa15.49■□□□□ 0.07
CUX1-209ENST00000487284 MEA1Q16626 185 aa15.49■□□□□ 0.07
CUX1-209ENST00000487284 FAM47CQ5HY64 1035 aa15.49■□□□□ 0.07
CUX1-209ENST00000487284 EFCAB12Q6NXP0 572 aa15.49■□□□□ 0.07
CUX1-209ENST00000487284 CYP26C1Q6V0L0 522 aa15.49■□□□□ 0.07
CUX1-209ENST00000487284 RAD9BQ6WBX8 426 aa15.49■□□□□ 0.07
CUX1-209ENST00000487284 EXOC8Q8IYI6 725 aa15.49■□□□□ 0.07
CUX1-209ENST00000487284 LINC01465Q8N7H1 131 aa15.49■□□□□ 0.07
CUX1-209ENST00000487284 ASAP3Q8TDY4 903 aa15.49■□□□□ 0.07
CUX1-209ENST00000487284 VTI1AQ96AJ9 217 aa15.49■□□□□ 0.07
CUX1-209ENST00000487284 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
CUX1-209ENST00000487284 KIFC3Q9BVG8 833 aa15.49■□□□□ 0.07
CUX1-209ENST00000487284 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa15.49■□□□□ 0.07
CUX1-209ENST00000487284 MMRN2Q9H8L6 949 aa15.49■□□□□ 0.07
CUX1-209ENST00000487284 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
CUX1-209ENST00000487284 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa15.49■□□□□ 0.07
CUX1-209ENST00000487284 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
CUX1-209ENST00000487284 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa15.49■□□□□ 0.07
CUX1-209ENST00000487284 PHF24Q9UPV7 400 aa15.49■□□□□ 0.07
CUX1-209ENST00000487284 C17orf102A2RUQ5 167 aa15.48■□□□□ 0.07
CUX1-209ENST00000487284 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
CUX1-209ENST00000487284 TISP43B9A030 160 aa15.48■□□□□ 0.07
CUX1-209ENST00000487284 MAPK13O15264 365 aa15.48■□□□□ 0.07
CUX1-209ENST00000487284 TREHO43280 583 aa15.48■□□□□ 0.07
CUX1-209ENST00000487284 ZSCAN12O43309 604 aa15.48■□□□□ 0.07
CUX1-209ENST00000487284 GAS2O43903 313 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
CUX1-209ENST00000487284 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
CUX1-209ENST00000487284 NAMPTP43490 491 aa15.48■□□□□ 0.07
CUX1-209ENST00000487284 MTF1Q14872 753 aa15.48■□□□□ 0.07
CUX1-209ENST00000487284 IER5Q5VY09 327 aa15.48■□□□□ 0.07
CUX1-209ENST00000487284 NFRKBQ6P4R8 1299 aa15.48■□□□□ 0.07
CUX1-209ENST00000487284 WDR59Q6PJI9 974 aa15.48■□□□□ 0.07
CUX1-209ENST00000487284 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
CUX1-209ENST00000487284 NEK11Q8NG66 645 aa15.48■□□□□ 0.07
CUX1-209ENST00000487284 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
CUX1-209ENST00000487284 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa15.48■□□□□ 0.07
CUX1-209ENST00000487284 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
CUX1-209ENST00000487284 EXOC3O60645 756 aa15.47■□□□□ 0.07
CUX1-209ENST00000487284 GLRA2P23416 452 aa15.47■□□□□ 0.07
CUX1-209ENST00000487284 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
CUX1-209ENST00000487284 CDK17Q00537 523 aa15.47■□□□□ 0.07
CUX1-209ENST00000487284 ITGA7Q13683 1181 aa15.47■□□□□ 0.07
CUX1-209ENST00000487284 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
CUX1-209ENST00000487284 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
CUX1-209ENST00000487284 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
CUX1-209ENST00000487284 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa15.47■□□□□ 0.07
CUX1-209ENST00000487284 REXO1L1PQ8IX06 675 aa15.47■□□□□ 0.07
CUX1-209ENST00000487284 XXYLT1Q8NBI6 393 aa15.47■□□□□ 0.07
CUX1-209ENST00000487284 TCP11Q8WWU5 503 aa15.47■□□□□ 0.07
CUX1-209ENST00000487284 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
CUX1-209ENST00000487284 CBWD1Q9BRT8 395 aa15.47■□□□□ 0.07
CUX1-209ENST00000487284 STARD7Q9NQZ5 370 aa15.47■□□□□ 0.07
CUX1-209ENST00000487284 HSPBP1Q9NZL4 362 aa15.47■□□□□ 0.07
CUX1-209ENST00000487284 CEP72Q9P209 647 aa15.47■□□□□ 0.07
CUX1-209ENST00000487284 ANKRD63C9JTQ0 380 aa15.46■□□□□ 0.07
CUX1-209ENST00000487284 NOL4O94818 638 aa15.46■□□□□ 0.07
CUX1-209ENST00000487284 TFRCP02786 760 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
CUX1-209ENST00000487284 CYP2C9P11712 490 aa15.46■□□□□ 0.07
CUX1-209ENST00000487284 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
CUX1-209ENST00000487284 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
CUX1-209ENST00000487284 TCERG1LQ5VWI1 586 aa15.46■□□□□ 0.07
CUX1-209ENST00000487284 SLC39A4Q6P5W5 647 aa15.46■□□□□ 0.07
CUX1-209ENST00000487284 RUFY4Q6ZNE9 571 aa15.46■□□□□ 0.07
CUX1-209ENST00000487284 TAS1R3Q7RTX0 852 aa15.46■□□□□ 0.07
CUX1-209ENST00000487284 SESTD1Q86VW0 696 aa15.46■□□□□ 0.07
CUX1-209ENST00000487284 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
CUX1-209ENST00000487284 BAP1Q92560 729 aa15.46■□□□□ 0.07
CUX1-209ENST00000487284 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
CUX1-209ENST00000487284 PLCB1Q9NQ66 1216 aa15.46■□□□□ 0.07
CUX1-209ENST00000487284 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
CUX1-209ENST00000487284 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa15.45■□□□□ 0.06
CUX1-209ENST00000487284 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
CUX1-209ENST00000487284 CCDC175P0C221 793 aa15.45■□□□□ 0.06
CUX1-209ENST00000487284 GNAT1P11488 350 aa15.45■□□□□ 0.06
CUX1-209ENST00000487284 ADSSP30520 456 aa15.45■□□□□ 0.06
CUX1-209ENST00000487284 GJA8P48165 433 aa15.45■□□□□ 0.06
CUX1-209ENST00000487284 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa15.45■□□□□ 0.06
CUX1-209ENST00000487284 BFSP1Q12934 665 aa15.45■□□□□ 0.06
CUX1-209ENST00000487284 CAPSQ13938 189 aa15.45■□□□□ 0.06
CUX1-209ENST00000487284 PTPN14Q15678 1187 aa15.45■□□□□ 0.06
CUX1-209ENST00000487284 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa15.45■□□□□ 0.06
CUX1-209ENST00000487284 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
CUX1-209ENST00000487284 RHPN2Q8IUC4 686 aa15.45■□□□□ 0.06
CUX1-209ENST00000487284 CHP1Q99653 195 aa15.45■□□□□ 0.06
CUX1-209ENST00000487284 CRACR2AQ9BSW2 395 aa15.45■□□□□ 0.06
CUX1-209ENST00000487284 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
CUX1-209ENST00000487284 GANQ9H2C0 597 aa15.45■□□□□ 0.06
CUX1-209ENST00000487284 PLAGL2Q9UPG8 496 aa15.45■□□□□ 0.06
CUX1-209ENST00000487284 AKT3Q9Y243 479 aa15.45■□□□□ 0.06
CUX1-209ENST00000487284 ADGRG1Q9Y653 693 aa15.45■□□□□ 0.06
CUX1-209ENST00000487284 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
CUX1-209ENST00000487284 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa15.45■□□□□ 0.06
CUX1-209ENST00000487284 LRRIQ4A6NIV6 560 aa15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.1 ms