RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484135.1

PTPRC-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-211ENST00000484135 TCAF1Q9Y4C2 921 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-211ENST00000484135 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-211ENST00000484135 SHANK3Q9BYB0 1731 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-211ENST00000484135 WNK3Q9BYP7 1800 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-211ENST00000484135 PKD1L3Q7Z443 1732 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-211ENST00000484135 SLC12A8A0AV02 714 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-211ENST00000484135 OVOL3O00110 214 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-211ENST00000484135 KCNQ2O43526 872 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-211ENST00000484135 HMGCRP04035 888 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-211ENST00000484135 ETV4P43268 484 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-211ENST00000484135 KCNQ1P51787 676 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-211ENST00000484135 SLFN5Q08AF3 891 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-211ENST00000484135 LMOD3Q0VAK6 560 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-211ENST00000484135 TEFQ10587 303 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-211ENST00000484135 SEC23AQ15436 765 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-211ENST00000484135 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-211ENST00000484135 KRT24Q2M2I5 525 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-211ENST00000484135 ZMAT1Q5H9K5 638 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-211ENST00000484135 FSTL4Q6MZW2 842 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-211ENST00000484135 WDR63Q8IWG1 891 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-211ENST00000484135 PALM2Q8IXS6 379 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-211ENST00000484135 C2orf69Q8N8R5 385 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-211ENST00000484135 IGSF22Q8N9C0 903 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-211ENST00000484135 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-211ENST00000484135 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-211ENST00000484135 SCLYQ96I15 445 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-211ENST00000484135 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-211ENST00000484135 KLC2Q9H0B6 622 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-211ENST00000484135 SEC61A2Q9H9S3 476 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-211ENST00000484135 KCNH7Q9NS40 1196 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-211ENST00000484135 BTBD7Q9P203 1132 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-211ENST00000484135 FBXO10Q9UK96 956 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-211ENST00000484135 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-211ENST00000484135 LRRC37A3O60309 1634 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-211ENST00000484135 BRWD3Q6RI45 1802 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-211ENST00000484135 TNS2Q63HR2 1409 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-211ENST00000484135 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-211ENST00000484135 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-211ENST00000484135 FOXP2O15409 715 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-211ENST00000484135 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-211ENST00000484135 FSHBP01225 129 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-211ENST00000484135 TNFRSF1AP19438 455 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-211ENST00000484135 SELENOPP49908 381 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-211ENST00000484135 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-211ENST00000484135 KRTAP1-1Q07627 177 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-211ENST00000484135 TMEM132BQ14DG7 1078 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-211ENST00000484135 TM4SF20Q53R12 229 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-211ENST00000484135 TMEM177Q53S58 311 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-211ENST00000484135 OVCH1Q7RTY7 1134 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-211ENST00000484135 KRT27Q7Z3Y8 459 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-211ENST00000484135 LILRB2Q8N423 598 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-211ENST00000484135 ASB15Q8WXK1 588 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-211ENST00000484135 GNRHR2Q96P88 292 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-211ENST00000484135 BTBD2Q9BX70 525 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-211ENST00000484135 CD248Q9HCU0 757 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-211ENST00000484135 TSPYL4Q9UJ04 414 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-211ENST00000484135 FANCIQ9NVI1 1328 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-211ENST00000484135 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-211ENST00000484135 SCN11AQ9UI33 1791 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-211ENST00000484135 PATE3B3GLJ2 98 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-211ENST00000484135 CHL1O00533 1208 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-211ENST00000484135 PLD2O14939 933 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-211ENST00000484135 MATN3O15232 486 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-211ENST00000484135 KRT37O76014 449 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-211ENST00000484135 NPTXRO95502 500 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-211ENST00000484135 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF853P0CG23 659 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-211ENST00000484135 ECE1P42892 770 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-211ENST00000484135 RAC3P60763 192 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-211ENST00000484135 GNAI1P63096 354 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-211ENST00000484135 IRF9Q00978 393 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-211ENST00000484135 LRSAM1Q6UWE0 723 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-211ENST00000484135 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-211ENST00000484135 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-211ENST00000484135 NGEFQ8N5V2 710 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-211ENST00000484135 TSPYL6Q8N831 410 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-211ENST00000484135 C8orf58Q8NAV2 365 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-211ENST00000484135 SLC16A11Q8NCK7 471 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-211ENST00000484135 DNERQ8NFT8 737 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-211ENST00000484135 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-211ENST00000484135 PIGBQ92521 554 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-211ENST00000484135 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-211ENST00000484135 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-211ENST00000484135 WNK4Q96J92 1243 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-211ENST00000484135 SCYL1Q96KG9 808 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-211ENST00000484135 GBP4Q96PP9 640 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-211ENST00000484135 TRIM39Q9HCM9 518 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-211ENST00000484135 IFT57Q9NWB7 429 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-211ENST00000484135 TMOD3Q9NYL9 352 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-211ENST00000484135 ASAP1Q9ULH1 1129 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-211ENST00000484135 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-211ENST00000484135 NR2E1Q9Y466 385 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-211ENST00000484135 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-211ENST00000484135 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-211ENST00000484135 RGS12O14924 1447 aa6□□□□□ -1.45
PTPRC-211ENST00000484135 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa6□□□□□ -1.45
PTPRC-211ENST00000484135 ERVV-2B6SEH9 535 aa6□□□□□ -1.45
PTPRC-211ENST00000484135 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa6□□□□□ -1.45
PTPRC-211ENST00000484135 MUSKO15146 869 aa6□□□□□ -1.45
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF623O75123 536 aa6□□□□□ -1.45
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