RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468807.1

TTC28-204, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 28, humanhuman

TSL 2

Gene TTC28, Length 594 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-204ENST00000468807 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
TTC28-204ENST00000468807 SP100P23497 879 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
TTC28-204ENST00000468807 TPRNQ4KMQ1 711 aa24.15■■□□□ 1.46
TTC28-204ENST00000468807 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
TTC28-204ENST00000468807 HACE1Q8IYU2 909 aa24.15■■□□□ 1.46
TTC28-204ENST00000468807 MCPH1Q8NEM0 835 aa24.15■■□□□ 1.46
TTC28-204ENST00000468807 GAD1Q99259 594 aa24.15■■□□□ 1.46
TTC28-204ENST00000468807 RNF39Q9H2S5 420 aa24.15■■□□□ 1.46
TTC28-204ENST00000468807 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
TTC28-204ENST00000468807 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
TTC28-204ENST00000468807 ARHGEF35A5YM69 484 aa24.14■■□□□ 1.45
TTC28-204ENST00000468807 RPA1P27694 616 aa24.14■■□□□ 1.45
TTC28-204ENST00000468807 OR1G1P47890 313 aa24.14■■□□□ 1.45
TTC28-204ENST00000468807 GIT2Q14161 759 aa24.14■■□□□ 1.45
TTC28-204ENST00000468807 AMHR2Q16671 573 aa24.14■■□□□ 1.45
TTC28-204ENST00000468807 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
TTC28-204ENST00000468807 HAUS3Q68CZ6 603 aa24.14■■□□□ 1.45
TTC28-204ENST00000468807 CES5AQ6NT32 575 aa24.14■■□□□ 1.45
TTC28-204ENST00000468807 FAM122AQ96E09 287 aa24.14■■□□□ 1.45
TTC28-204ENST00000468807 TMEM175Q9BSA9 504 aa24.14■■□□□ 1.45
TTC28-204ENST00000468807 VN1R3Q9BXE9 311 aa24.14■■□□□ 1.45
TTC28-204ENST00000468807 NFKBIZQ9BYH8 718 aa24.14■■□□□ 1.45
TTC28-204ENST00000468807 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
TTC28-204ENST00000468807 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa24.14■■□□□ 1.45
TTC28-204ENST00000468807 CDH22Q9UJ99 828 aa24.14■■□□□ 1.45
TTC28-204ENST00000468807 ARL5CA6NH57 179 aa24.13■■□□□ 1.45
TTC28-204ENST00000468807 NRP1O14786 923 aa24.13■■□□□ 1.45
TTC28-204ENST00000468807 NPTXRO95502 500 aa24.13■■□□□ 1.45
TTC28-204ENST00000468807 TRAPPC10P48553 1259 aa24.13■■□□□ 1.45
TTC28-204ENST00000468807 SCNN1GP51170 649 aa24.13■■□□□ 1.45
TTC28-204ENST00000468807 RABEP1Q15276 862 aa24.13■■□□□ 1.45
TTC28-204ENST00000468807 TMEM132AQ24JP5 1023 aa24.13■■□□□ 1.45
TTC28-204ENST00000468807 PADI6Q6TGC4 694 aa24.13■■□□□ 1.45
TTC28-204ENST00000468807 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa24.13■■□□□ 1.45
TTC28-204ENST00000468807 ZFP42Q96MM3 310 aa24.13■■□□□ 1.45
TTC28-204ENST00000468807 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
TTC28-204ENST00000468807 SPDYE4A6NLX3 237 aa24.12■■□□□ 1.45
TTC28-204ENST00000468807 ST18O60284 1047 aa24.12■■□□□ 1.45
TTC28-204ENST00000468807 LIG1P18858 919 aa24.12■■□□□ 1.45
TTC28-204ENST00000468807 AKAP5P24588 427 aa24.12■■□□□ 1.45
TTC28-204ENST00000468807 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
TTC28-204ENST00000468807 SLC27A1Q6PCB7 646 aa24.12■■□□□ 1.45
TTC28-204ENST00000468807 LRWD1Q9UFC0 647 aa24.12■■□□□ 1.45
TTC28-204ENST00000468807 C2CD2LO14523 706 aa24.11■■□□□ 1.45
TTC28-204ENST00000468807 EPCAMP16422 314 aa24.11■■□□□ 1.45
TTC28-204ENST00000468807 PLA2G5P39877 138 aa24.11■■□□□ 1.45
TTC28-204ENST00000468807 PTPN14Q15678 1187 aa24.11■■□□□ 1.45
TTC28-204ENST00000468807 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
TTC28-204ENST00000468807 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
TTC28-204ENST00000468807 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa24.11■■□□□ 1.45
TTC28-204ENST00000468807 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
TTC28-204ENST00000468807 STK39Q9UEW8 545 aa24.11■■□□□ 1.45
TTC28-204ENST00000468807 PARP2Q9UGN5 583 aa24.11■■□□□ 1.45
TTC28-204ENST00000468807 GIT1Q9Y2X7 761 aa24.11■■□□□ 1.45
TTC28-204ENST00000468807 IRAK3Q9Y616 596 aa24.11■■□□□ 1.45
TTC28-204ENST00000468807 NR1I2O75469 434 aa24.1■■□□□ 1.45
TTC28-204ENST00000468807 WEE2P0C1S8 567 aa24.1■■□□□ 1.45
TTC28-204ENST00000468807 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP24.1■■□□□ 1.45
TTC28-204ENST00000468807 ITIH3Q06033 890 aa24.1■■□□□ 1.45
TTC28-204ENST00000468807 MCTP1Q6DN14 999 aa24.1■■□□□ 1.45
TTC28-204ENST00000468807 COLGALT2Q8IYK4 626 aa24.1■■□□□ 1.45
TTC28-204ENST00000468807 DEPTORQ8TB45 409 aa24.1■■□□□ 1.45
TTC28-204ENST00000468807 EDAQ92838 391 aa24.1■■□□□ 1.45
TTC28-204ENST00000468807 ADAM7Q9H2U9 754 aa24.1■■□□□ 1.45
TTC28-204ENST00000468807 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
TTC28-204ENST00000468807 DZANK1Q9NVP4 752 aa24.1■■□□□ 1.45
TTC28-204ENST00000468807 MIOSQ9NXC5 875 aa24.1■■□□□ 1.45
TTC28-204ENST00000468807 KLK14Q9P0G3 267 aa24.1■■□□□ 1.45
TTC28-204ENST00000468807 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa24.1■■□□□ 1.45
TTC28-204ENST00000468807 A0A1B0GUA9 196 aa24.09■■□□□ 1.45
TTC28-204ENST00000468807 CYP11B2P19099 503 aa24.09■■□□□ 1.45
TTC28-204ENST00000468807 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP24.09■■□□□ 1.45
TTC28-204ENST00000468807 KLRC2P26717 231 aa24.09■■□□□ 1.45
TTC28-204ENST00000468807 PTGDRQ13258 359 aa24.09■■□□□ 1.45
TTC28-204ENST00000468807 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
TTC28-204ENST00000468807 KANK3Q6NY19 840 aa24.09■■□□□ 1.45
TTC28-204ENST00000468807 ZBTB33Q86T24 672 aa24.09■■□□□ 1.45
TTC28-204ENST00000468807 CABP7Q86V35 215 aa24.09■■□□□ 1.45
TTC28-204ENST00000468807 C4orf32Q8N8J7 132 aa24.09■■□□□ 1.45
TTC28-204ENST00000468807 SNX29Q8TEQ0 813 aa24.09■■□□□ 1.45
TTC28-204ENST00000468807 BSNDQ8WZ55 320 aa24.09■■□□□ 1.45
TTC28-204ENST00000468807 RAB34Q9BZG1 259 aa24.09■■□□□ 1.45
TTC28-204ENST00000468807 C2orf40Q9H1Z8 148 aa24.09■■□□□ 1.45
TTC28-204ENST00000468807 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
TTC28-204ENST00000468807 MARCH5Q9NX47 278 aa24.09■■□□□ 1.45
TTC28-204ENST00000468807 KIAA1024Q9UPX6 916 aa24.09■■□□□ 1.45
TTC28-204ENST00000468807 KIF3AQ9Y496 699 aa24.09■■□□□ 1.45
TTC28-204ENST00000468807 URODP06132 367 aa24.08■■□□□ 1.45
TTC28-204ENST00000468807 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
TTC28-204ENST00000468807 ECM1Q16610 540 aa24.08■■□□□ 1.45
TTC28-204ENST00000468807 HFE2Q6ZVN8 426 aa24.08■■□□□ 1.45
TTC28-204ENST00000468807 PPFIBP1Q86W92 1011 aa24.08■■□□□ 1.45
TTC28-204ENST00000468807 PRIMPOLQ96LW4 560 aa24.08■■□□□ 1.45
TTC28-204ENST00000468807 RIPOR3Q96MK2 946 aa24.08■■□□□ 1.45
TTC28-204ENST00000468807 NECTIN4Q96NY8 510 aa24.08■■□□□ 1.45
TTC28-204ENST00000468807 RPS6KC1Q96S38 1066 aa24.08■■□□□ 1.45
TTC28-204ENST00000468807 BHMT2Q9H2M3 363 aa24.08■■□□□ 1.45
TTC28-204ENST00000468807 POMKQ9H5K3 350 aa24.08■■□□□ 1.45
TTC28-204ENST00000468807 POLD4Q9HCU8 107 aa24.08■■□□□ 1.45
TTC28-204ENST00000468807 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.6 ms