RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467691.1

CASQ1-202, Transcript of calsequestrin 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CASQ1, Length 595 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1-202ENST00000467691 SARSP49591 514 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 LIG4P49917 911 aa9.69□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 PSMD2Q13200 908 aa9.69□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 ALCAMQ13740 583 aa9.69□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 KCNB1Q14721 858 aa9.69□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 ZNF568Q3ZCX4 644 aa9.69□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 UBXN11Q5T124 520 aa9.69□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 RASIP1Q5U651 963 aa9.69□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 EEF1DP3Q658K8 133 aa9.69□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 FAM117BQ6P1L5 589 aa9.69□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 SLC27A1Q6PCB7 646 aa9.69□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 SLC24A5Q71RS6 500 aa9.69□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 ZBTB33Q86T24 672 aa9.69□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 MAP4K3Q8IVH8 894 aa9.69□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 NELFCDQ8IXH7 590 aa9.69□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 TDHQ8IZJ6 230 aa9.69□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 SYCP3Q8IZU3 236 aa9.69□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 KIAA0895Q8NCT3 520 aa9.69□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 HVCN1Q96D96 273 aa9.69□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 CCDC51Q96ER9 411 aa9.69□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 GSDMAQ96QA5 445 aa9.69□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 ACCSQ96QU6 501 aa9.69□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 TCHPQ9BT92 498 aa9.69□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 PRO3102Q9H379 93 aa9.69□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 C1orf112Q9NSG2 853 aa9.69□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 MAN1B1Q9UKM7 699 aa9.69□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 LRFN2Q9ULH4 789 aa9.69□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa9.69□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 TNFSF13BQ9Y275 285 aa9.69□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 GDAQ9Y2T3 454 aa9.69□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa9.69□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 A0A0U1RQF3 1178 aa9.68□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 ANKRD63C9JTQ0 380 aa9.68□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP9.68□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 TOM1L1O75674 476 aa9.68□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 SLC39A4Q6P5W5 647 aa9.68□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 MPZL3Q6UWV2 235 aa9.68□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 ZPBP2Q6X784 338 aa9.68□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 ECHDC2Q86YB7 292 aa9.68□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 SPATA20Q8TB22 786 aa9.68□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 SCFD1Q8WVM8 642 aa9.68□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 KCNN1Q92952 543 aa9.68□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 LPPQ93052 612 aa9.68□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 TOP1MTQ969P6 601 aa9.68□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 SLC9A7Q96T83 725 aa9.68□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 ADPGKQ9BRR6 497 aa9.68□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 APOL6Q9BWW8 343 aa9.68□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 PTPRHQ9HD43 1115 aa9.68□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 FAM105AQ9NUU6 356 aa9.68□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 EXOC7Q9UPT5 735 aa9.68□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 HES2Q9Y543 173 aa9.68□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 IPPQ9Y573 584 aa9.68□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa9.68□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa9.68□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 MICAL3Q7RTP6 2002 aa9.68□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 CEP290O15078 2479 aa9.67□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 UBE4BO95155 1302 aa9.67□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 GRXCR1A8MXD5 290 aa9.67□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 ABLIM1O14639 778 aa9.67□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 CLDN3O15551 220 aa9.67□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 PIGRP01833 764 aa9.67□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 FGFR1P11362 822 aa9.67□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 SKIP12755 728 aa9.67□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 PTMSP20962 102 aa9.67□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 PROZP22891 400 aa9.67□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 AKAP5P24588 427 aa9.67□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 HOXD13P35453 343 aa9.67□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 RAB27AP51159 221 aa9.67□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 RABGGTBP53611 331 aa9.67□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 OSTNP61366 133 aa9.67□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 FAM189BP81408 668 aa9.67□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP9.67□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa9.67□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 NPAS4Q8IUM7 802 aa9.67□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 HERC6Q8IVU3 1022 aa9.67□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 ZNF507Q8TCN5 953 aa9.67□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 ZBED2Q9BTP6 218 aa9.67□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 TRAIPQ9BWF2 469 aa9.67□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 HAPLN2Q9GZV7 340 aa9.67□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 CDT1Q9H211 546 aa9.67□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 RNF39Q9H2S5 420 aa9.67□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 TMEM206Q9H813 350 aa9.67□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 TMEM161AQ9NX61 479 aa9.67□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 KIAA1468Q9P260 1216 aa9.67□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa9.66□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 MEIS3P2A8K0S8 358 aa9.66□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 ZNF623O75123 536 aa9.66□□□□□ -0.86
CASQ1-202ENST00000467691 GJB5O95377 273 aa9.66□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.7 ms