RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460297.1

NME4-209, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4, humanhuman

TSL 5

Gene NME4, Length 1,652 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4-209ENST00000460297 EXOC3O60645 756 aa26.5■■□□□ 1.83
NME4-209ENST00000460297 FGFR4P22455 802 aa26.5■■□□□ 1.83
NME4-209ENST00000460297 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
NME4-209ENST00000460297 SNX17Q15036 470 aa26.5■■□□□ 1.83
NME4-209ENST00000460297 CCDC40Q4G0X9 1142 aa26.5■■□□□ 1.83
NME4-209ENST00000460297 XXYLT1Q8NBI6 393 aa26.5■■□□□ 1.83
NME4-209ENST00000460297 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa26.5■■□□□ 1.83
NME4-209ENST00000460297 PRIMPOLQ96LW4 560 aa26.5■■□□□ 1.83
NME4-209ENST00000460297 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa26.5■■□□□ 1.83
NME4-209ENST00000460297 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
NME4-209ENST00000460297 INTS13Q9NVM9 706 aa26.5■■□□□ 1.83
NME4-209ENST00000460297 NOD1Q9Y239 953 aa26.5■■□□□ 1.83
NME4-209ENST00000460297 A0A1B0GTH6 734 aa26.49■■□□□ 1.83
NME4-209ENST00000460297 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa26.49■■□□□ 1.83
NME4-209ENST00000460297 TOM1L1O75674 476 aa26.49■■□□□ 1.83
NME4-209ENST00000460297 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
NME4-209ENST00000460297 COPB1P53618 953 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
NME4-209ENST00000460297 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
NME4-209ENST00000460297 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
NME4-209ENST00000460297 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa26.49■■□□□ 1.83
NME4-209ENST00000460297 BORCS6Q96GS4 357 aa26.49■■□□□ 1.83
NME4-209ENST00000460297 MKNK1Q9BUB5 465 aa26.49■■□□□ 1.83
NME4-209ENST00000460297 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
NME4-209ENST00000460297 VPS16Q9H269 839 aa26.49■■□□□ 1.83
NME4-209ENST00000460297 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa26.49■■□□□ 1.83
NME4-209ENST00000460297 CDY2AQ9Y6F7 541 aa26.49■■□□□ 1.83
NME4-209ENST00000460297 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa26.49■■□□□ 1.83
NME4-209ENST00000460297 ABLIM1O14639 778 aa26.48■■□□□ 1.83
NME4-209ENST00000460297 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
NME4-209ENST00000460297 EPB41P11171 864 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
NME4-209ENST00000460297 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
NME4-209ENST00000460297 SLFN12LQ6IEE8 588 aa26.48■■□□□ 1.83
NME4-209ENST00000460297 SAAL1Q96ER3 474 aa26.48■■□□□ 1.83
NME4-209ENST00000460297 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa26.48■■□□□ 1.83
NME4-209ENST00000460297 PTPRHQ9HD43 1115 aa26.48■■□□□ 1.83
NME4-209ENST00000460297 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa26.48■■□□□ 1.83
NME4-209ENST00000460297 A0A0B4J269 797 aa26.47■■□□□ 1.83
NME4-209ENST00000460297 GOLGA8IPA6NC78 632 aa26.47■■□□□ 1.83
NME4-209ENST00000460297 GOLGA8JA6NMD2 632 aa26.47■■□□□ 1.83
NME4-209ENST00000460297 TSPAN1O60635 241 aa26.47■■□□□ 1.83
NME4-209ENST00000460297 CHRNA1P02708 482 aa26.47■■□□□ 1.83
NME4-209ENST00000460297 CTSHP09668 335 aa26.47■■□□□ 1.83
NME4-209ENST00000460297 PROZP22891 400 aa26.47■■□□□ 1.83
NME4-209ENST00000460297 THPOP40225 353 aa26.47■■□□□ 1.83
NME4-209ENST00000460297 MGAT3Q09327 533 aa26.47■■□□□ 1.83
NME4-209ENST00000460297 MIIPQ5JXC2 388 aa26.47■■□□□ 1.83
NME4-209ENST00000460297 ATF7IP2Q5U623 682 aa26.47■■□□□ 1.83
NME4-209ENST00000460297 FRMD5Q7Z6J6 570 aa26.47■■□□□ 1.83
NME4-209ENST00000460297 TRIM59Q8IWR1 403 aa26.47■■□□□ 1.83
NME4-209ENST00000460297 FAM186BQ8IYM0 893 aa26.47■■□□□ 1.83
NME4-209ENST00000460297 RDH13Q8NBN7 331 aa26.47■■□□□ 1.83
NME4-209ENST00000460297 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
NME4-209ENST00000460297 FBXL18Q96ME1 805 aa26.47■■□□□ 1.83
NME4-209ENST00000460297 MCOLN1Q9GZU1 580 aa26.47■■□□□ 1.83
NME4-209ENST00000460297 TRPV2Q9Y5S1 764 aa26.47■■□□□ 1.83
NME4-209ENST00000460297 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
NME4-209ENST00000460297 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
NME4-209ENST00000460297 EEF1DP3Q658K8 133 aa26.47■■□□□ 1.83
NME4-209ENST00000460297 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
NME4-209ENST00000460297 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
NME4-209ENST00000460297 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa26.47■■□□□ 1.83
NME4-209ENST00000460297 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
NME4-209ENST00000460297 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
NME4-209ENST00000460297 TNFSF13BQ9Y275 285 aa26.47■■□□□ 1.83
NME4-209ENST00000460297 M0QZ92 97 aa26.46■■□□□ 1.83
NME4-209ENST00000460297 CLDN3O15551 220 aa26.46■■□□□ 1.83
NME4-209ENST00000460297 ERLIN2O94905 339 aa26.46■■□□□ 1.83
NME4-209ENST00000460297 NR1I3Q14994 352 aa26.46■■□□□ 1.83
NME4-209ENST00000460297 FAM126BQ8IXS8 530 aa26.46■■□□□ 1.83
NME4-209ENST00000460297 CPB2Q96IY4 423 aa26.46■■□□□ 1.83
NME4-209ENST00000460297 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
NME4-209ENST00000460297 N4BP3O15049 544 aa26.45■■□□□ 1.82
NME4-209ENST00000460297 TEX33O43247 280 aa26.45■■□□□ 1.82
NME4-209ENST00000460297 COL6A1P12109 1028 aa26.45■■□□□ 1.82
NME4-209ENST00000460297 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP26.45■■□□□ 1.82
NME4-209ENST00000460297 MAN2A1Q16706 1144 aa26.45■■□□□ 1.82
NME4-209ENST00000460297 CBWD2Q8IUF1 395 aa26.45■■□□□ 1.82
NME4-209ENST00000460297 GPD1LQ8N335 351 aa26.45■■□□□ 1.82
NME4-209ENST00000460297 TCHPQ9BT92 498 aa26.45■■□□□ 1.82
NME4-209ENST00000460297 MSTO1Q9BUK6 570 aa26.45■■□□□ 1.82
NME4-209ENST00000460297 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
NME4-209ENST00000460297 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
NME4-209ENST00000460297 CBFA2T2O43439 604 aa26.44■■□□□ 1.82
NME4-209ENST00000460297 ADRB2P07550 413 aa26.44■■□□□ 1.82
NME4-209ENST00000460297 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
NME4-209ENST00000460297 MCL1Q07820 350 aa26.44■■□□□ 1.82
NME4-209ENST00000460297 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP26.44■■□□□ 1.822e-46■■■■□ 22.3
NME4-209ENST00000460297 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
NME4-209ENST00000460297 TMEM132AQ24JP5 1023 aa26.44■■□□□ 1.82
NME4-209ENST00000460297 MPZL3Q6UWV2 235 aa26.44■■□□□ 1.82
NME4-209ENST00000460297 CATSPER4Q7RTX7 472 aa26.44■■□□□ 1.82
NME4-209ENST00000460297 ZBTB33Q86T24 672 aa26.44■■□□□ 1.82
NME4-209ENST00000460297 PDZD7Q9H5P4 517 aa26.44■■□□□ 1.82
NME4-209ENST00000460297 MAPK13O15264 365 aa26.44■■□□□ 1.82
NME4-209ENST00000460297 FAM189A1O60320 539 aa26.44■■□□□ 1.82
NME4-209ENST00000460297 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
NME4-209ENST00000460297 PTPN21Q16825 1174 aa26.44■■□□□ 1.82
NME4-209ENST00000460297 FILIP1LQ4L180 1135 aa26.44■■□□□ 1.82
NME4-209ENST00000460297 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa26.44■■□□□ 1.82
NME4-209ENST00000460297 ANKLE1Q8NAG6 615 aa26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.2 ms