RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455631.5

PTPRA-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type A, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRA, Length 1,107 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRA-208ENST00000455631 DSG1Q02413 1049 aa25.99■■□□□ 1.75
PTPRA-208ENST00000455631 KRT32Q14532 448 aa25.99■■□□□ 1.75
PTPRA-208ENST00000455631 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
PTPRA-208ENST00000455631 Q4G0T1 1027 aa25.99■■□□□ 1.75
PTPRA-208ENST00000455631 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa25.99■■□□□ 1.75
PTPRA-208ENST00000455631 GLYCTKQ8IVS8 523 aa25.99■■□□□ 1.75
PTPRA-208ENST00000455631 HDAC7Q8WUI4 952 aa25.99■■□□□ 1.75
PTPRA-208ENST00000455631 SLC7A3Q8WY07 619 aa25.99■■□□□ 1.75
PTPRA-208ENST00000455631 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa25.99■■□□□ 1.75
PTPRA-208ENST00000455631 MINDY3Q9H8M7 445 aa25.99■■□□□ 1.75
PTPRA-208ENST00000455631 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa25.99■■□□□ 1.75
PTPRA-208ENST00000455631 CEP250Q9BV73 2442 aa25.98■■□□□ 1.75
PTPRA-208ENST00000455631 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa25.98■■□□□ 1.75
PTPRA-208ENST00000455631 F8W810 466 aa25.98■■□□□ 1.75
PTPRA-208ENST00000455631 LRRN2O75325 713 aa25.98■■□□□ 1.75
PTPRA-208ENST00000455631 TDP2O95551 362 aa25.98■■□□□ 1.75
PTPRA-208ENST00000455631 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
PTPRA-208ENST00000455631 MLH1P40692 756 aa25.98■■□□□ 1.75
PTPRA-208ENST00000455631 PSMC5P62195 406 aa25.98■■□□□ 1.75
PTPRA-208ENST00000455631 B3GNT9Q6UX72 402 aa25.98■■□□□ 1.75
PTPRA-208ENST00000455631 SUMF1Q8NBK3 374 aa25.98■■□□□ 1.75
PTPRA-208ENST00000455631 B3GALT6Q96L58 329 aa25.98■■□□□ 1.75
PTPRA-208ENST00000455631 UBN1Q9NPG3 1134 aa25.98■■□□□ 1.75
PTPRA-208ENST00000455631 NCOR2Q9Y618 2525 aa25.97■■□□□ 1.75
PTPRA-208ENST00000455631 NID2Q14112 1375 aa25.97■■□□□ 1.75
PTPRA-208ENST00000455631 FRYLO94915 3013 aa25.97■■□□□ 1.75
PTPRA-208ENST00000455631 TGM5O43548 720 aa25.97■■□□□ 1.75
PTPRA-208ENST00000455631 GAS2O43903 313 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
PTPRA-208ENST00000455631 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
PTPRA-208ENST00000455631 CPA1P15085 419 aa25.97■■□□□ 1.75
PTPRA-208ENST00000455631 NPEPPSP55786 919 aa25.97■■□□□ 1.75
PTPRA-208ENST00000455631 TSGA10IPQ3SY00 556 aa25.97■■□□□ 1.75
PTPRA-208ENST00000455631 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
PTPRA-208ENST00000455631 CNNM3Q8NE01 707 aa25.97■■□□□ 1.75
PTPRA-208ENST00000455631 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
PTPRA-208ENST00000455631 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
PTPRA-208ENST00000455631 BRF1Q92994 677 aa25.97■■□□□ 1.75
PTPRA-208ENST00000455631 TMEM143Q96AN5 459 aa25.97■■□□□ 1.75
PTPRA-208ENST00000455631 SHDQ96IW2 340 aa25.97■■□□□ 1.75
PTPRA-208ENST00000455631 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa25.97■■□□□ 1.75
PTPRA-208ENST00000455631 GAD1Q99259 594 aa25.97■■□□□ 1.75
PTPRA-208ENST00000455631 SLC26A6Q9BXS9 759 aa25.97■■□□□ 1.75
PTPRA-208ENST00000455631 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa25.97■■□□□ 1.75
PTPRA-208ENST00000455631 PRKD2Q9BZL6 878 aa25.97■■□□□ 1.75
PTPRA-208ENST00000455631 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
PTPRA-208ENST00000455631 IPPQ9Y573 584 aa25.97■■□□□ 1.75
PTPRA-208ENST00000455631 CACNA1BQ00975 2339 aa25.97■■□□□ 1.75
PTPRA-208ENST00000455631 ARL5CA6NH57 179 aa25.96■■□□□ 1.75
PTPRA-208ENST00000455631 NR1I2O75469 434 aa25.96■■□□□ 1.75
PTPRA-208ENST00000455631 ERLIN2O94905 339 aa25.96■■□□□ 1.75
PTPRA-208ENST00000455631 PAPLNO95428 1278 aa25.96■■□□□ 1.75
PTPRA-208ENST00000455631 EFEMP2O95967 443 aa25.96■■□□□ 1.75
PTPRA-208ENST00000455631 SCNN1GP51170 649 aa25.96■■□□□ 1.75
PTPRA-208ENST00000455631 NLRP5P59047 1200 aa25.96■■□□□ 1.75
PTPRA-208ENST00000455631 STARD6P59095 220 aa25.96■■□□□ 1.75
PTPRA-208ENST00000455631 DSC1Q08554 894 aa25.96■■□□□ 1.75
PTPRA-208ENST00000455631 Q6ZUG5 572 aa25.96■■□□□ 1.75
PTPRA-208ENST00000455631 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
PTPRA-208ENST00000455631 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
PTPRA-208ENST00000455631 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
PTPRA-208ENST00000455631 NCDNQ9UBB6 729 aa25.96■■□□□ 1.75
PTPRA-208ENST00000455631 COL4A3Q01955 1670 aa25.96■■□□□ 1.75
PTPRA-208ENST00000455631 PATJQ8NI35 1801 aa25.95■■□□□ 1.75
PTPRA-208ENST00000455631 ETNPPLQ8TBG4 499 aa25.95■■□□□ 1.74
PTPRA-208ENST00000455631 CEP170P1Q96L14 293 aa25.95■■□□□ 1.74
PTPRA-208ENST00000455631 ZFP42Q96MM3 310 aa25.95■■□□□ 1.74
PTPRA-208ENST00000455631 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
PTPRA-208ENST00000455631 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP25.95■■□□□ 1.74
PTPRA-208ENST00000455631 CHST7Q9NS84 486 aa25.95■■□□□ 1.74
PTPRA-208ENST00000455631 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
PTPRA-208ENST00000455631 KRT37O76014 449 aa25.94■■□□□ 1.74
PTPRA-208ENST00000455631 FSHRP23945 695 aa25.94■■□□□ 1.74
PTPRA-208ENST00000455631 GPC5P78333 572 aa25.94■■□□□ 1.74
PTPRA-208ENST00000455631 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa25.94■■□□□ 1.74
PTPRA-208ENST00000455631 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
PTPRA-208ENST00000455631 RNF149Q8NC42 400 aa25.94■■□□□ 1.74
PTPRA-208ENST00000455631 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
PTPRA-208ENST00000455631 COLEC11Q9BWP8 271 aa25.94■■□□□ 1.74
PTPRA-208ENST00000455631 APOL6Q9BWW8 343 aa25.94■■□□□ 1.74
PTPRA-208ENST00000455631 BCO2Q9BYV7 579 aa25.94■■□□□ 1.74
PTPRA-208ENST00000455631 C22orf23Q9BZE7 217 aa25.94■■□□□ 1.74
PTPRA-208ENST00000455631 RNF39Q9H2S5 420 aa25.94■■□□□ 1.74
PTPRA-208ENST00000455631 HES2Q9Y543 173 aa25.94■■□□□ 1.74
PTPRA-208ENST00000455631 LAMTOR5O43504 91 aa25.93■■□□□ 1.74
PTPRA-208ENST00000455631 RPL17P18621 184 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
PTPRA-208ENST00000455631 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
PTPRA-208ENST00000455631 FUT10Q6P4F1 479 aa25.93■■□□□ 1.74
PTPRA-208ENST00000455631 FGF14Q92915 247 aa25.93■■□□□ 1.74
PTPRA-208ENST00000455631 GPR62Q9BZJ7 368 aa25.93■■□□□ 1.74
PTPRA-208ENST00000455631 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
PTPRA-208ENST00000455631 MIOSQ9NXC5 875 aa25.93■■□□□ 1.74
PTPRA-208ENST00000455631 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
PTPRA-208ENST00000455631 DOCK6Q96HP0 2047 aa25.92■■□□□ 1.74
PTPRA-208ENST00000455631 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa25.92■■□□□ 1.74
PTPRA-208ENST00000455631 KANSL1LA0AUZ9 987 aa25.92■■□□□ 1.74
PTPRA-208ENST00000455631 EML1O00423 815 aa25.92■■□□□ 1.74
PTPRA-208ENST00000455631 SPTLC1O15269 473 aa25.92■■□□□ 1.74
PTPRA-208ENST00000455631 ZMYND10O75800 440 aa25.92■■□□□ 1.74
PTPRA-208ENST00000455631 C1RP00736 705 aa25.92■■□□□ 1.74
PTPRA-208ENST00000455631 CYP3A7P24462 503 aa25.92■■□□□ 1.74
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