RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 MYLK2Q9H1R3 596 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 INTUQ9ULD6 942 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 TMCO1Q9UM00 188 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 TRIM64CA6NLI5 447 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 TJP3O95049 919 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 ZCCHC18P0CG32 403 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 SKIP12755 728 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 CCNFP41002 786 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 CCDC15Q0P6D6 951 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 MPP3Q13368 585 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 PARP6Q2NL67 630 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 C6orf118Q5T5N4 469 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 SFMBT2Q5VUG0 894 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 ERP27Q96DN0 273 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 TIPINQ9BVW5 301 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 SEMA4AQ9H3S1 761 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 ZBTB3Q9H5J0 574 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 KCNK9Q9NPC2 374 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 TRPM7Q96QT4 1865 aa9□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM120BA0PK00 339 aa9□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 FOXO6A8MYZ6 492 aa9□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 PENKP01210 267 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 PCP11498 1178 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 FGFR4P22455 802 aa9□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 VHLP40337 213 aa9□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 AKNAD1Q5T1N1 836 aa9□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 MFSD6Q6ZSS7 791 aa9□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF365Q70YC5 407 aa9□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 EXOC3L1Q86VI1 746 aa9□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 SESTD1Q86VW0 696 aa9□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa9□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 LRMDAQ9H2I8 198 aa9□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 PCDH12Q9NPG4 1184 aa9□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa9□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 PRKAG3Q9UGI9 489 aa9□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 SNX24Q9Y343 169 aa9□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 NR2E1Q9Y466 385 aa9□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF532Q9HCE3 1301 aa9□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 ADAMTS3O15072 1205 aa9□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 TIMM44O43615 452 aa9□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 PLEKHA8P1O95397 391 aa9□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 GH1P01241 217 aa9□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 SERPING1P05155 500 aa9□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC5A1P13866 664 aa9□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 GNAT2P19087 354 aa9□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 ASIC1P78348 528 aa9□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 RAPGEF1Q13905 1077 aa9□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC18A3Q16572 532 aa9□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 MAN2A1Q16706 1144 aa9□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 SNX30Q5VWJ9 437 aa9□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 CGB2Q6NT52 195 aa9□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 TAOK1Q7L7X3 1001 aa9□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP9□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 FBXO25Q8TCJ0 367 aa9□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 SEC14L1Q92503 715 aa9□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 TNFRSF25Q93038 417 aa9□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 SEMA6BQ9H3T3 888 aa9□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 GREM2Q9H772 168 aa9□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 STOML1Q9UBI4 398 aa9□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 MAGEA13PA6NCF6 341 aa8.99□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 SIGLEC16A6NMB1 481 aa8.99□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 CES2O00748 559 aa8.99□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 RASGRF2O14827 1237 aa8.99□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 AUHQ13825 339 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 LRRC15Q8TF66 581 aa8.99□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 NRG4Q8WWG1 115 aa8.99□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 AZIN2Q96A70 460 aa8.99□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 SLX1AQ9BQ83 275 aa8.99□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM192AQ9GZU8 254 aa8.99□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa8.99□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 ETNK2Q9NVF9 386 aa8.99□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 CHMP2BQ9UQN3 213 aa8.99□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 ROBO3Q96MS0 1386 aa8.99□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 MBD4O95243 580 aa8.99□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 LONP1P36776 959 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 UBA7P41226 1012 aa8.99□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 NPY5RQ15761 445 aa8.99□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 CCDC152Q4G0S7 254 aa8.99□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 PEX26Q7Z412 305 aa8.99□□□□□ -0.97
RABGEF1-203ENST00000439720 NPAS4Q8IUM7 802 aa8.99□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms