RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412640.6

SOX9-AS1-201, SOX9 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene SOX9-AS1, Length 635 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PCDHA6Q9UN73 950 aa10.65□□□□□ -0.7
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa10.65□□□□□ -0.7
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PATJQ8NI35 1801 aa10.64□□□□□ -0.71
SOX9-AS1-201ENST00000412640 DENND3A2RUS2 1198 aa10.64□□□□□ -0.71
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
SOX9-AS1-201ENST00000412640 C9IYK1 514 aa10.64□□□□□ -0.71
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa10.64□□□□□ -0.71
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZBTB5O15062 677 aa10.64□□□□□ -0.71
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ADAMTS3O15072 1205 aa10.64□□□□□ -0.71
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PFKFB1P16118 471 aa10.64□□□□□ -0.71
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SPINK2P20155 84 aa10.64□□□□□ -0.71
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PPM1AP35813 382 aa10.64□□□□□ -0.71
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NAPAP54920 295 aa10.64□□□□□ -0.71
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
SOX9-AS1-201ENST00000412640 UBXN2BQ14CS0 331 aa10.64□□□□□ -0.71
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TTC38Q5R3I4 469 aa10.64□□□□□ -0.71
SOX9-AS1-201ENST00000412640 LAIR1Q6GTX8 287 aa10.64□□□□□ -0.71
SOX9-AS1-201ENST00000412640 METTL7BQ6UX53 244 aa10.64□□□□□ -0.71
SOX9-AS1-201ENST00000412640 KRT25Q7Z3Z0 450 aa10.64□□□□□ -0.71
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PIBF1Q8WXW3 757 aa10.64□□□□□ -0.71
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MYADMQ96S97 322 aa10.64□□□□□ -0.71
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SFXN1Q9H9B4 322 aa10.64□□□□□ -0.71
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa10.64□□□□□ -0.71
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MAST4O15021 2626 aa10.64□□□□□ -0.71
SOX9-AS1-201ENST00000412640 DOCK5Q9H7D0 1870 aa10.64□□□□□ -0.71
SOX9-AS1-201ENST00000412640 DSPP15924 2871 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
SOX9-AS1-201ENST00000412640 KAT6AQ92794 2004 aa10.63□□□□□ -0.71
SOX9-AS1-201ENST00000412640 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa10.63□□□□□ -0.71
SOX9-AS1-201ENST00000412640 A0A1B0GVL5 298 aa10.63□□□□□ -0.71
SOX9-AS1-201ENST00000412640 KANSL1LA0AUZ9 987 aa10.63□□□□□ -0.71
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SMCO2A6NFE2 343 aa10.63□□□□□ -0.71
SOX9-AS1-201ENST00000412640 FAM170BA6NMN3 283 aa10.63□□□□□ -0.71
SOX9-AS1-201ENST00000412640 M0QZ92 97 aa10.63□□□□□ -0.71
SOX9-AS1-201ENST00000412640 OPLAHO14841 1288 aa10.63□□□□□ -0.71
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RETP07949 1114 aa10.63□□□□□ -0.71
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CCDC192P0DO97 292 aa10.63□□□□□ -0.71
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CD72P21854 359 aa10.63□□□□□ -0.71
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CCND2P30279 289 aa10.63□□□□□ -0.71
SOX9-AS1-201ENST00000412640 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
SOX9-AS1-201ENST00000412640 HSD17B4P51659 736 aa10.63□□□□□ -0.71
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CSRP2Q16527 193 aa10.63□□□□□ -0.71
SOX9-AS1-201ENST00000412640 UVSSAQ2YD98 709 aa10.63□□□□□ -0.71
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PRR23BQ6ZRT6 265 aa10.63□□□□□ -0.71
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa10.63□□□□□ -0.71
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SLC24A5Q71RS6 500 aa10.63□□□□□ -0.71
SOX9-AS1-201ENST00000412640 HOMER1Q86YM7 354 aa10.63□□□□□ -0.71
SOX9-AS1-201ENST00000412640 VPS52Q8N1B4 723 aa10.63□□□□□ -0.71
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SLC39A11Q8N1S5 342 aa10.63□□□□□ -0.71
SOX9-AS1-201ENST00000412640 C4orf32Q8N8J7 132 aa10.63□□□□□ -0.71
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SHDQ96IW2 340 aa10.63□□□□□ -0.71
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CASD1Q96PB1 797 aa10.63□□□□□ -0.71
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GLT8D2Q9H1C3 349 aa10.63□□□□□ -0.71
SOX9-AS1-201ENST00000412640 VAT1LQ9HCJ6 419 aa10.63□□□□□ -0.71
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RIC8AQ9NPQ8 531 aa10.63□□□□□ -0.71
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RGS18Q9NS28 235 aa10.63□□□□□ -0.71
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GINS2Q9Y248 185 aa10.63□□□□□ -0.71
SOX9-AS1-201ENST00000412640 C2orf16Q68DN1 1984 aa10.63□□□□□ -0.71
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MIA3Q5JRA6 1907 aa10.62□□□□□ -0.71
SOX9-AS1-201ENST00000412640 IGF2RP11717 2491 aa10.62□□□□□ -0.71
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa10.62□□□□□ -0.71
SOX9-AS1-201ENST00000412640 LAD1O00515 517 aa10.62□□□□□ -0.71
SOX9-AS1-201ENST00000412640 WNT7AO00755 349 aa10.62□□□□□ -0.71
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TM4SF5O14894 197 aa10.62□□□□□ -0.71
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZNF202O95125 648 aa10.62□□□□□ -0.71
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CAVIN2O95810 425 aa10.62□□□□□ -0.71
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SYKP43405 635 aa10.62□□□□□ -0.71
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CLK2P49760 499 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GPC5P78333 572 aa10.62□□□□□ -0.71
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SEMA3FQ13275 785 aa10.62□□□□□ -0.71
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NEDD9Q14511 834 aa10.62□□□□□ -0.71
SOX9-AS1-201ENST00000412640 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CAMK4Q16566 473 aa10.62□□□□□ -0.71
SOX9-AS1-201ENST00000412640 QRICH1Q2TAL8 776 aa10.62□□□□□ -0.71
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
SOX9-AS1-201ENST00000412640 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NXPE3Q969Y0 559 aa10.62□□□□□ -0.71
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CLIC6Q96NY7 704 aa10.62□□□□□ -0.71
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TMEM117Q9H0C3 514 aa10.62□□□□□ -0.71
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CDHR5Q9HBB8 845 aa10.62□□□□□ -0.71
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa10.62□□□□□ -0.71
SOX9-AS1-201ENST00000412640 C1orf112Q9NSG2 853 aa10.62□□□□□ -0.71
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RNF19AQ9NV58 838 aa10.62□□□□□ -0.71
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TMEM161AQ9NX61 479 aa10.62□□□□□ -0.71
SOX9-AS1-201ENST00000412640 EPS15L1Q9UBC2 864 aa10.62□□□□□ -0.71
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa10.62□□□□□ -0.71
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa10.61□□□□□ -0.71
SOX9-AS1-201ENST00000412640 LRP3O75074 770 aa10.61□□□□□ -0.71
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MYBP10242 640 aa10.61□□□□□ -0.71
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PRPHP41219 470 aa10.61□□□□□ -0.71
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ADCY7P51828 1080 aa10.61□□□□□ -0.71
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TYRO3Q06418 890 aa10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29 ms