RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376649.7

PUS1-202, Transcript of pseudouridylate synthase 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PUS1, Length 4,094 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS1-202ENST00000376649 SLITRK3O94933 977 aa15.96■□□□□ 0.15
PUS1-202ENST00000376649 HSPA6P17066 643 aa15.96■□□□□ 0.15
PUS1-202ENST00000376649 KRT17Q04695 432 aa15.96■□□□□ 0.15
PUS1-202ENST00000376649 SLC27A3Q5K4L6 730 aa15.96■□□□□ 0.15
PUS1-202ENST00000376649 FBXL13Q8NEE6 735 aa15.96■□□□□ 0.15
PUS1-202ENST00000376649 TMEM143Q96AN5 459 aa15.96■□□□□ 0.15
PUS1-202ENST00000376649 HVCN1Q96D96 273 aa15.96■□□□□ 0.15
PUS1-202ENST00000376649 ZDHHC15Q96MV8 337 aa15.96■□□□□ 0.15
PUS1-202ENST00000376649 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
PUS1-202ENST00000376649 ERP44Q9BS26 406 aa15.96■□□□□ 0.15
PUS1-202ENST00000376649 CALN1Q9BXU9 219 aa15.96■□□□□ 0.15
PUS1-202ENST00000376649 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
PUS1-202ENST00000376649 FEM1BQ9UK73 627 aa15.96■□□□□ 0.15
PUS1-202ENST00000376649 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
PUS1-202ENST00000376649 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa15.96■□□□□ 0.15
PUS1-202ENST00000376649 RASSF10A6NK89 507 aa15.96■□□□□ 0.15
PUS1-202ENST00000376649 TMEM253P0C7T8 217 aa15.96■□□□□ 0.15
PUS1-202ENST00000376649 RASA3Q14644 834 aa15.96■□□□□ 0.15
PUS1-202ENST00000376649 ZNF720Q7Z2F6 126 aa15.96■□□□□ 0.15
PUS1-202ENST00000376649 VCPKMTQ9H867 229 aa15.96■□□□□ 0.15
PUS1-202ENST00000376649 SAYSD1Q9NPB0 183 aa15.96■□□□□ 0.15
PUS1-202ENST00000376649 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
PUS1-202ENST00000376649 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
PUS1-202ENST00000376649 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
PUS1-202ENST00000376649 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
PUS1-202ENST00000376649 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
PUS1-202ENST00000376649 CYFIP2Q96F07 1278 aa15.96■□□□□ 0.15
PUS1-202ENST00000376649 TAAR1Q96RJ0 339 aa15.96■□□□□ 0.15
PUS1-202ENST00000376649 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
PUS1-202ENST00000376649 ZHX2Q9Y6X8 837 aa15.96■□□□□ 0.15
PUS1-202ENST00000376649 NEBLO76041 1014 aa15.95■□□□□ 0.14
PUS1-202ENST00000376649 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
PUS1-202ENST00000376649 GUCY2CP25092 1073 aa15.95■□□□□ 0.14
PUS1-202ENST00000376649 CHRNA3P32297 505 aa15.95■□□□□ 0.14
PUS1-202ENST00000376649 SESN3P58005 492 aa15.95■□□□□ 0.14
PUS1-202ENST00000376649 ATP11AP98196 1134 aa15.95■□□□□ 0.14
PUS1-202ENST00000376649 KYNUQ16719 465 aa15.95■□□□□ 0.14
PUS1-202ENST00000376649 CASC4Q6P4E1 433 aa15.95■□□□□ 0.14
PUS1-202ENST00000376649 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa15.95■□□□□ 0.14
PUS1-202ENST00000376649 CHMP6Q96FZ7 201 aa15.95■□□□□ 0.14
PUS1-202ENST00000376649 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
PUS1-202ENST00000376649 MYO3BQ8WXR4 1341 aa15.95■□□□□ 0.14
PUS1-202ENST00000376649 MYH8P13535 1937 aa15.95■□□□□ 0.14
PUS1-202ENST00000376649 CAND2O75155 1236 aa15.95■□□□□ 0.14
PUS1-202ENST00000376649 BRAFP15056 766 aa15.95■□□□□ 0.14
PUS1-202ENST00000376649 ADCY2Q08462 1091 aa15.95■□□□□ 0.14
PUS1-202ENST00000376649 HGSNATQ68CP4 663 aa15.95■□□□□ 0.14
PUS1-202ENST00000376649 TRIM68Q6AZZ1 485 aa15.95■□□□□ 0.14
PUS1-202ENST00000376649 DNAJC24Q6P3W2 148 aa15.95■□□□□ 0.14
PUS1-202ENST00000376649 ZNF449Q6P9G9 518 aa15.95■□□□□ 0.14
PUS1-202ENST00000376649 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
PUS1-202ENST00000376649 GAKO14976 1311 aa15.95■□□□□ 0.14
PUS1-202ENST00000376649 PJA2O43164 708 aa15.95■□□□□ 0.14
PUS1-202ENST00000376649 SPAG7O75391 227 aa15.95■□□□□ 0.14
PUS1-202ENST00000376649 NOL4O94818 638 aa15.95■□□□□ 0.14
PUS1-202ENST00000376649 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP15.95■□□□□ 0.14
PUS1-202ENST00000376649 BPIFB4P59827 614 aa15.95■□□□□ 0.14
PUS1-202ENST00000376649 PSMC5P62195 406 aa15.95■□□□□ 0.14
PUS1-202ENST00000376649 MTMR2Q13614 643 aa15.95■□□□□ 0.14
PUS1-202ENST00000376649 BBS9Q3SYG4 887 aa15.95■□□□□ 0.14
PUS1-202ENST00000376649 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
PUS1-202ENST00000376649 MXRA8Q9BRK3 442 aa15.95■□□□□ 0.14
PUS1-202ENST00000376649 TMEM117Q9H0C3 514 aa15.95■□□□□ 0.14
PUS1-202ENST00000376649 HAUS2Q9NVX0 235 aa15.95■□□□□ 0.14
PUS1-202ENST00000376649 RTN2O75298 545 aa15.94■□□□□ 0.14
PUS1-202ENST00000376649 CA4P22748 312 aa15.94■□□□□ 0.14
PUS1-202ENST00000376649 GADL1Q6ZQY3 521 aa15.94■□□□□ 0.14
PUS1-202ENST00000376649 TTC16Q8NEE8 873 aa15.94■□□□□ 0.14
PUS1-202ENST00000376649 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
PUS1-202ENST00000376649 NLRP4Q96MN2 994 aa15.94■□□□□ 0.14
PUS1-202ENST00000376649 FAM198AQ9UFP1 575 aa15.94■□□□□ 0.14
PUS1-202ENST00000376649 STAM2O75886 525 aa15.94■□□□□ 0.14
PUS1-202ENST00000376649 DLG4P78352 724 aa15.94■□□□□ 0.14
PUS1-202ENST00000376649 BASP1P80723 227 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
PUS1-202ENST00000376649 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa15.94■□□□□ 0.14
PUS1-202ENST00000376649 ABCC6O95255 1503 aa15.94■□□□□ 0.14
PUS1-202ENST00000376649 RPS6P62753 249 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
PUS1-202ENST00000376649 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
PUS1-202ENST00000376649 SLC47A2Q86VL8 602 aa15.94■□□□□ 0.14
PUS1-202ENST00000376649 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
PUS1-202ENST00000376649 TBC1D22BQ9NU19 505 aa15.94■□□□□ 0.14
PUS1-202ENST00000376649 PCSK1NQ9UHG2 260 aa15.94■□□□□ 0.14
PUS1-202ENST00000376649 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa15.94■□□□□ 0.14
PUS1-202ENST00000376649 M0R2N6 131 aa15.94■□□□□ 0.14
PUS1-202ENST00000376649 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP15.94■□□□□ 0.149e-8■■■□□ 15
PUS1-202ENST00000376649 PAF1Q8N7H5 531 aa15.94■□□□□ 0.14
PUS1-202ENST00000376649 GANQ9H2C0 597 aa15.94■□□□□ 0.14
PUS1-202ENST00000376649 ODF2LQ9ULJ1 636 aa15.94■□□□□ 0.14
PUS1-202ENST00000376649 TLR3O15455 904 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
PUS1-202ENST00000376649 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa15.93■□□□□ 0.14
PUS1-202ENST00000376649 CNGA1P29973 690 aa15.93■□□□□ 0.14
PUS1-202ENST00000376649 CCND2P30279 289 aa15.93■□□□□ 0.14
PUS1-202ENST00000376649 PCK1P35558 622 aa15.93■□□□□ 0.14
PUS1-202ENST00000376649 OTOP1Q7RTM1 612 aa15.93■□□□□ 0.14
PUS1-202ENST00000376649 SEC16BQ96JE7 1060 aa15.93■□□□□ 0.14
PUS1-202ENST00000376649 KCTD10Q9H3F6 313 aa15.93■□□□□ 0.14
PUS1-202ENST00000376649 FAM187AA6NFU0 413 aa15.93■□□□□ 0.14
PUS1-202ENST00000376649 RASA4BC9J798 803 aa15.93■□□□□ 0.14
PUS1-202ENST00000376649 RASA4O43374 803 aa15.93■□□□□ 0.14
PUS1-202ENST00000376649 PSAPP07602 524 aa15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.4 ms