RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367364.5

PTPRC-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 1,017 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-202ENST00000367364 CAGE1Q8TC20 777 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-202ENST00000367364 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-202ENST00000367364 TRIM39Q9HCM9 518 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-202ENST00000367364 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-202ENST00000367364 ZBTB7CA1YPR0 619 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-202ENST00000367364 DIRC3C9JPN6 131 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-202ENST00000367364 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-202ENST00000367364 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-202ENST00000367364 GZMKP49863 264 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-202ENST00000367364 CD69Q07108 199 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-202ENST00000367364 KIAA1841Q6NSI8 718 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-202ENST00000367364 SLC44A3Q8N4M1 653 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-202ENST00000367364 SLC9A6Q92581 669 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-202ENST00000367364 MYL10Q9BUA6 226 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-202ENST00000367364 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-202ENST00000367364 MAST3O60307 1309 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-202ENST00000367364 MGST3O14880 152 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-202ENST00000367364 TCF3P15923 654 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-202ENST00000367364 SCAPQ12770 1279 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-202ENST00000367364 MAPK7Q13164 816 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-202ENST00000367364 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-202ENST00000367364 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-202ENST00000367364 CHST14Q8NCH0 376 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF384Q8TF68 577 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-202ENST00000367364 DUSP26Q9BV47 211 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-202ENST00000367364 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-202ENST00000367364 SEMA4GQ9NTN9 838 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-202ENST00000367364 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-202ENST00000367364 CGB1A6NKQ9 187 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-202ENST00000367364 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-202ENST00000367364 APOL3O95236 402 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-202ENST00000367364 LY86O95711 162 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-202ENST00000367364 ABCG1P45844 678 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-202ENST00000367364 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-202ENST00000367364 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-202ENST00000367364 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-202ENST00000367364 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-202ENST00000367364 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-202ENST00000367364 OR10H5Q8NGA6 315 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-202ENST00000367364 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-202ENST00000367364 HIST1H2AJQ99878 128 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-202ENST00000367364 POFUT1Q9H488 388 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-202ENST00000367364 SPON1Q9HCB6 807 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-202ENST00000367364 PTPDC1A2A3K4 754 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-202ENST00000367364 LRRC3CA6NJW4 275 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-202ENST00000367364 ITGAMP11215 1152 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-202ENST00000367364 METRNLQ641Q3 311 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-202ENST00000367364 CKAP2LQ8IYA6 745 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-202ENST00000367364 C7orf31Q8N865 590 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF366Q8N895 744 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF778Q96MU6 729 aa6.24□□□□□ -1.41
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PTPRC-202ENST00000367364 SLC29A3Q9BZD2 475 aa6.24□□□□□ -1.41
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PTPRC-202ENST00000367364 CLCA2Q9UQC9 943 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-202ENST00000367364 H7C1D1 291 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-202ENST00000367364 MAFGO15525 162 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-202ENST00000367364 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-202ENST00000367364 ADCY1Q08828 1119 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-202ENST00000367364 RESTQ13127 1097 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-202ENST00000367364 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
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PTPRC-202ENST00000367364 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-202ENST00000367364 ARHGEF25Q86VW2 580 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-202ENST00000367364 SH2D3CQ8N5H7 860 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-202ENST00000367364 NEU1Q99519 415 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-202ENST00000367364 SAMD15Q9P1V8 674 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-202ENST00000367364 SLC9A1P19634 815 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF81P51508 661 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRC-202ENST00000367364 DUSP2Q05923 314 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRC-202ENST00000367364 CREB3L3Q68CJ9 461 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRC-202ENST00000367364 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
PTPRC-202ENST00000367364 TAS1R1Q7RTX1 841 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRC-202ENST00000367364 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
PTPRC-202ENST00000367364 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
PTPRC-202ENST00000367364 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
PTPRC-202ENST00000367364 KIAA1586Q9HCI6 787 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRC-202ENST00000367364 PODXL2Q9NZ53 605 aa6.22□□□□□ -1.41
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PTPRC-202ENST00000367364 PCDH8O95206 1070 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRC-202ENST00000367364 HLA-DOAP06340 250 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRC-202ENST00000367364 SPATA31D3P0C874 917 aa6.21□□□□□ -1.42
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PTPRC-202ENST00000367364 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRC-202ENST00000367364 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
PTPRC-202ENST00000367364 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
PTPRC-202ENST00000367364 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa6.21□□□□□ -1.42
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PTPRC-202ENST00000367364 RARRES1P49788 294 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-202ENST00000367364 DDB1Q16531 1140 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-202ENST00000367364 GPR149Q86SP6 731 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-202ENST00000367364 RNF169Q8NCN4 708 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-202ENST00000367364 RNF181Q9P0P0 153 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-202ENST00000367364 MYPNQ86TC9 1320 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-202ENST00000367364 ZMYM3Q14202 1370 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRC-202ENST00000367364 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
PTPRC-202ENST00000367364 RBP3P10745 1247 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRC-202ENST00000367364 FDXRP22570 491 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRC-202ENST00000367364 RASA3Q14644 834 aa6.19□□□□□ -1.42
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