RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000341935.9

CCR6-201, Transcript of C-C motif chemokine receptor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR6, Length 4,018 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR6-201ENST00000341935 EFCAB12Q6NXP0 572 aa6.6□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 TAS1R3Q7RTX0 852 aa6.6□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 FRMD5Q7Z6J6 570 aa6.6□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 ZSCAN30Q86W11 494 aa6.6□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 DEPTORQ8TB45 409 aa6.6□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 TMEM174Q8WUU8 243 aa6.6□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 KCNN1Q92952 543 aa6.6□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 SUGCTQ9HAC7 445 aa6.6□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 DMAC2Q9NW81 257 aa6.6□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 ITIH6Q6UXX5 1313 aa6.59□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 LRRIQ4A6NIV6 560 aa6.59□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 GNRH1P01148 92 aa6.59□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 MYL3P08590 195 aa6.59□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 EPB41P11171 864 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 DNM2P50570 870 aa6.59□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 CYP2J2P51589 502 aa6.59□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 GSDMDP57764 484 aa6.59□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 BEX3Q00994 111 aa6.59□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 CCDC15Q0P6D6 951 aa6.59□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa6.59□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 SLC9A9Q8IVB4 645 aa6.59□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 KAT2BQ92831 832 aa6.59□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 ZBTB10Q96DT7 871 aa6.59□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 ERO1AQ96HE7 468 aa6.59□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 KCNF1Q9H3M0 494 aa6.59□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 UBAP1Q9NZ09 502 aa6.59□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP6.59□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 TISP43B9A030 160 aa6.59□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 ANKRD63C9JTQ0 380 aa6.59□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 FKTNO75072 461 aa6.59□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 AKAP3O75969 853 aa6.59□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 F2P00734 622 aa6.59□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 ELNP15502 786 aa6.59□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 CNGA1P29973 690 aa6.59□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 CASP4P49662 377 aa6.59□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 PPFIA1Q13136 1202 aa6.59□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 GRIK4Q16099 956 aa6.59□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 CEP135Q66GS9 1140 aa6.59□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 MTHFD1LQ6UB35 978 aa6.59□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 TRIM59Q8IWR1 403 aa6.59□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 C12orf56Q8IXR9 622 aa6.59□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 LINC01465Q8N7H1 131 aa6.59□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 NDST4Q9H3R1 872 aa6.59□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 TMEM134Q9H6X4 195 aa6.59□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 A0A1W2PQC6 194 aa6.59□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 MAGEB2O15479 319 aa6.59□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 SEPT4O43236 478 aa6.59□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 KLRC1P26715 233 aa6.59□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 CLCN3P51790 818 aa6.59□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 GJA9P57773 515 aa6.59□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 MFSD10Q14728 455 aa6.59□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 ARID5BQ14865 1188 aa6.59□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 FKBP15Q5T1M5 1219 aa6.59□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 METTL13Q8N6R0 699 aa6.59□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 CCDC150Q8NCX0 1101 aa6.59□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 PCIF1Q9H4Z3 704 aa6.59□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa6.58□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 ADCY3O60266 1144 aa6.58□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa6.58□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa6.58□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 PSEN2P49810 448 aa6.58□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 STRN3Q13033 797 aa6.58□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 KIAA0753Q2KHM9 967 aa6.58□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 MARCH8Q5T0T0 291 aa6.58□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 ARMCX5Q6P1M9 558 aa6.58□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 SLC39A4Q6P5W5 647 aa6.58□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 RHPN2Q8IUC4 686 aa6.58□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 LRRC8AQ8IWT6 810 aa6.58□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 FAM186BQ8IYM0 893 aa6.58□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 BICD1Q96G01 975 aa6.58□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 MKNK1Q9BUB5 465 aa6.58□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP6.58□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP6.58□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 MRFAP1Q9Y605 127 aa6.58□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 MYADML2A6NDP7 307 aa6.58□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 RRN3P2A6NIE6 340 aa6.58□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 HMGCRP04035 888 aa6.58□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 TFDP1Q14186 410 aa6.58□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 RAET1EQ8TD07 263 aa6.58□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 CBWD1Q9BRT8 395 aa6.58□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 CCDC113Q9H0I3 377 aa6.58□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 HSPBP1Q9NZL4 362 aa6.58□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 CARNS1A5YM72 827 aa6.58□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 K7ERI5 159 aa6.58□□□□□ -1.36
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