RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000269228.9

NPC1-201, Transcript of NPC intracellular cholesterol transporter 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NPC1, Length 5,157 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1-201ENST00000269228 SREBF1P36956 1147 aa14.64□□□□□ -0.07
NPC1-201ENST00000269228 FMO5P49326 533 aa14.64□□□□□ -0.07
NPC1-201ENST00000269228 ATF7IP2Q5U623 682 aa14.64□□□□□ -0.07
NPC1-201ENST00000269228 KIFC3Q9BVG8 833 aa14.64□□□□□ -0.07
NPC1-201ENST00000269228 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
NPC1-201ENST00000269228 STAP1Q9ULZ2 295 aa14.64□□□□□ -0.07
NPC1-201ENST00000269228 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
NPC1-201ENST00000269228 TMEM132DQ14C87 1099 aa14.64□□□□□ -0.07
NPC1-201ENST00000269228 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
NPC1-201ENST00000269228 RDM1Q8NG50 284 aa14.64□□□□□ -0.07
NPC1-201ENST00000269228 CCHCR1Q8TD31 782 aa14.64□□□□□ -0.07
NPC1-201ENST00000269228 STMN2Q93045 179 aa14.64□□□□□ -0.07
NPC1-201ENST00000269228 UPP2O95045 317 aa14.64□□□□□ -0.07
NPC1-201ENST00000269228 GSTA1P08263 222 aa14.64□□□□□ -0.07
NPC1-201ENST00000269228 GSTA2P09210 222 aa14.64□□□□□ -0.07
NPC1-201ENST00000269228 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
NPC1-201ENST00000269228 NCAPGQ9BPX3 1015 aa14.64□□□□□ -0.07
NPC1-201ENST00000269228 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
NPC1-201ENST00000269228 CAPN11Q9UMQ6 739 aa14.64□□□□□ -0.07
NPC1-201ENST00000269228 ADGRG1Q9Y653 693 aa14.64□□□□□ -0.07
NPC1-201ENST00000269228 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa14.64□□□□□ -0.07
NPC1-201ENST00000269228 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa14.64□□□□□ -0.07
NPC1-201ENST00000269228 CPT1AP50416 773 aa14.64□□□□□ -0.07
NPC1-201ENST00000269228 RBP5P82980 135 aa14.64□□□□□ -0.07
NPC1-201ENST00000269228 NCOA4Q13772 614 aa14.64□□□□□ -0.07
NPC1-201ENST00000269228 TFDP2Q14188 446 aa14.64□□□□□ -0.07
NPC1-201ENST00000269228 NTRK3Q16288 839 aa14.64□□□□□ -0.07
NPC1-201ENST00000269228 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
NPC1-201ENST00000269228 MCUR1Q96AQ8 359 aa14.64□□□□□ -0.07
NPC1-201ENST00000269228 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
NPC1-201ENST00000269228 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
NPC1-201ENST00000269228 PTPAQ15257 358 aa14.63□□□□□ -0.07
NPC1-201ENST00000269228 RPS6KA2Q15349 733 aa14.63□□□□□ -0.07
NPC1-201ENST00000269228 EDRF1Q3B7T1 1238 aa14.63□□□□□ -0.07
NPC1-201ENST00000269228 ELMOD1Q8N336 334 aa14.63□□□□□ -0.07
NPC1-201ENST00000269228 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa14.63□□□□□ -0.07
NPC1-201ENST00000269228 CREB3O43889 395 aa14.63□□□□□ -0.07
NPC1-201ENST00000269228 MED24O75448 989 aa14.63□□□□□ -0.07
NPC1-201ENST00000269228 CYP11B2P19099 503 aa14.63□□□□□ -0.07
NPC1-201ENST00000269228 GRB10Q13322 594 aa14.63□□□□□ -0.07
NPC1-201ENST00000269228 IQCB1Q15051 598 aa14.63□□□□□ -0.07
NPC1-201ENST00000269228 TNIP3Q96KP6 325 aa14.63□□□□□ -0.07
NPC1-201ENST00000269228 GOLGA8CPA6NN73 597 aa14.63□□□□□ -0.07
NPC1-201ENST00000269228 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
NPC1-201ENST00000269228 AGPAT1Q99943 283 aa14.63□□□□□ -0.07
NPC1-201ENST00000269228 EDEM3Q9BZQ6 932 aa14.63□□□□□ -0.07
NPC1-201ENST00000269228 CYP26B1Q9NR63 512 aa14.63□□□□□ -0.07
NPC1-201ENST00000269228 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
NPC1-201ENST00000269228 NCK2O43639 380 aa14.63□□□□□ -0.07
NPC1-201ENST00000269228 APBA1Q02410 837 aa14.63□□□□□ -0.07
NPC1-201ENST00000269228 FAM117BQ6P1L5 589 aa14.63□□□□□ -0.07
NPC1-201ENST00000269228 TRIM72Q6ZMU5 477 aa14.63□□□□□ -0.07
NPC1-201ENST00000269228 GLT1D1Q96MS3 346 aa14.63□□□□□ -0.07
NPC1-201ENST00000269228 RUSC1Q9BVN2 902 aa14.63□□□□□ -0.07
NPC1-201ENST00000269228 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
NPC1-201ENST00000269228 APEX2Q9UBZ4 518 aa14.63□□□□□ -0.07
NPC1-201ENST00000269228 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa14.63□□□□□ -0.07
NPC1-201ENST00000269228 RRN3P2A6NIE6 340 aa14.62□□□□□ -0.07
NPC1-201ENST00000269228 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
NPC1-201ENST00000269228 MSH2P43246 934 aa14.62□□□□□ -0.07
NPC1-201ENST00000269228 SLCO1A2P46721 670 aa14.62□□□□□ -0.07
NPC1-201ENST00000269228 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
NPC1-201ENST00000269228 NME3Q13232 169 aa14.62□□□□□ -0.07
NPC1-201ENST00000269228 NXNQ6DKJ4 435 aa14.62□□□□□ -0.07
NPC1-201ENST00000269228 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
NPC1-201ENST00000269228 A0A1B0GTH6 734 aa14.62□□□□□ -0.07
NPC1-201ENST00000269228 HERVK_113P62684 666 aa14.62□□□□□ -0.07
NPC1-201ENST00000269228 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
NPC1-201ENST00000269228 PKN1Q16512 942 aa14.62□□□□□ -0.07
NPC1-201ENST00000269228 LRRC31Q6UY01 552 aa14.62□□□□□ -0.07
NPC1-201ENST00000269228 PDIK1LQ8N165 341 aa14.62□□□□□ -0.07
NPC1-201ENST00000269228 PGBD4Q96DM1 585 aa14.62□□□□□ -0.07
NPC1-201ENST00000269228 PARD6BQ9BYG5 372 aa14.62□□□□□ -0.07
NPC1-201ENST00000269228 SPATC1LQ9H0A9 340 aa14.62□□□□□ -0.07
NPC1-201ENST00000269228 CCDC188H7C350 402 aa14.62□□□□□ -0.07
NPC1-201ENST00000269228 MUM1L1Q5H9M0 696 aa14.62□□□□□ -0.07
NPC1-201ENST00000269228 MOXD1Q6UVY6 613 aa14.62□□□□□ -0.07
NPC1-201ENST00000269228 EFCAB13Q8IY85 973 aa14.62□□□□□ -0.07
NPC1-201ENST00000269228 SLC8A2Q9UPR5 921 aa14.62□□□□□ -0.07
NPC1-201ENST00000269228 MYOM1P52179 1685 aa14.62□□□□□ -0.07
NPC1-201ENST00000269228 PIK3R2O00459 728 aa14.62□□□□□ -0.07
NPC1-201ENST00000269228 LCP1P13796 627 aa14.62□□□□□ -0.07
NPC1-201ENST00000269228 DSG3P32926 999 aa14.62□□□□□ -0.07
NPC1-201ENST00000269228 IFNAR2P48551 515 aa14.62□□□□□ -0.07
NPC1-201ENST00000269228 ATP11AP98196 1134 aa14.62□□□□□ -0.07
NPC1-201ENST00000269228 MTF1Q14872 753 aa14.62□□□□□ -0.07
NPC1-201ENST00000269228 KCTD17Q8N5Z5 321 aa14.62□□□□□ -0.07
NPC1-201ENST00000269228 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
NPC1-201ENST00000269228 PDCD2LQ9BRP1 358 aa14.62□□□□□ -0.07
NPC1-201ENST00000269228 MED4Q9NPJ6 270 aa14.62□□□□□ -0.07
NPC1-201ENST00000269228 GPRC5CQ9NQ84 441 aa14.62□□□□□ -0.07
NPC1-201ENST00000269228 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP14.62□□□□□ -0.07
NPC1-201ENST00000269228 TRAPPC3O43617 180 aa14.62□□□□□ -0.07
NPC1-201ENST00000269228 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
NPC1-201ENST00000269228 TMED2Q15363 201 aa14.62□□□□□ -0.07
NPC1-201ENST00000269228 RNF180Q86T96 592 aa14.62□□□□□ -0.07
NPC1-201ENST00000269228 MCUQ8NE86 351 aa14.62□□□□□ -0.07
NPC1-201ENST00000269228 APPL2Q8NEU8 664 aa14.62□□□□□ -0.07
NPC1-201ENST00000269228 CFAP36Q96G28 342 aa14.62□□□□□ -0.07
NPC1-201ENST00000269228 FMO2Q99518 471 aa14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.1 ms