RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265339.6

UBE2B-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2B, Length 2,515 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-201ENST00000265339 TTI2Q6NXR4 508 aa22.08■■□□□ 1.12
UBE2B-201ENST00000265339 BEGAINQ9BUH8 593 aa22.08■■□□□ 1.12
UBE2B-201ENST00000265339 CNGA1P29973 690 aa22.07■■□□□ 1.12
UBE2B-201ENST00000265339 AMPD2Q01433 879 aa22.07■■□□□ 1.12
UBE2B-201ENST00000265339 NELFCDQ8IXH7 590 aa22.07■■□□□ 1.12
UBE2B-201ENST00000265339 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
UBE2B-201ENST00000265339 H3BRB1 525 aa22.07■■□□□ 1.12
UBE2B-201ENST00000265339 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP22.07■■□□□ 1.12
UBE2B-201ENST00000265339 HBP1O60381 514 aa22.07■■□□□ 1.12
UBE2B-201ENST00000265339 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
UBE2B-201ENST00000265339 HMGCRP04035 888 aa22.07■■□□□ 1.12
UBE2B-201ENST00000265339 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
UBE2B-201ENST00000265339 RFC5P40937 340 aa22.07■■□□□ 1.12
UBE2B-201ENST00000265339 CENPPQ6IPU0 288 aa22.07■■□□□ 1.12
UBE2B-201ENST00000265339 SLC7A3Q8WY07 619 aa22.07■■□□□ 1.12
UBE2B-201ENST00000265339 BSNDQ8WZ55 320 aa22.07■■□□□ 1.12
UBE2B-201ENST00000265339 KIFAP3Q92845 792 aa22.07■■□□□ 1.12
UBE2B-201ENST00000265339 CCDC51Q96ER9 411 aa22.07■■□□□ 1.12
UBE2B-201ENST00000265339 AP5M1Q9H0R1 490 aa22.07■■□□□ 1.12
UBE2B-201ENST00000265339 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
UBE2B-201ENST00000265339 ABHD10Q9NUJ1 306 aa22.07■■□□□ 1.12
UBE2B-201ENST00000265339 SEPT4O43236 478 aa22.06■■□□□ 1.12
UBE2B-201ENST00000265339 ANKRD40Q6AI12 368 aa22.06■■□□□ 1.12
UBE2B-201ENST00000265339 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa22.06■■□□□ 1.12
UBE2B-201ENST00000265339 TAB2Q9NYJ8 693 aa22.06■■□□□ 1.12
UBE2B-201ENST00000265339 PPME1Q9Y570 386 aa22.06■■□□□ 1.12
UBE2B-201ENST00000265339 HOXD13P35453 343 aa22.06■■□□□ 1.12
UBE2B-201ENST00000265339 BEX3Q00994 111 aa22.06■■□□□ 1.12
UBE2B-201ENST00000265339 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF720Q7Z2F6 126 aa22.06■■□□□ 1.12
UBE2B-201ENST00000265339 TMTC1Q8IUR5 882 aa22.06■■□□□ 1.12
UBE2B-201ENST00000265339 TMEM143Q96AN5 459 aa22.06■■□□□ 1.12
UBE2B-201ENST00000265339 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
UBE2B-201ENST00000265339 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
UBE2B-201ENST00000265339 CD248Q9HCU0 757 aa22.06■■□□□ 1.12
UBE2B-201ENST00000265339 CCDC189A1A4V9 331 aa22.05■■□□□ 1.12
UBE2B-201ENST00000265339 BICDL2A1A5D9 508 aa22.05■■□□□ 1.12
UBE2B-201ENST00000265339 GOLGA6BA6NDN3 693 aa22.05■■□□□ 1.12
UBE2B-201ENST00000265339 MAFO75444 373 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
UBE2B-201ENST00000265339 CPT1AP50416 773 aa22.05■■□□□ 1.12
UBE2B-201ENST00000265339 PEX3P56589 373 aa22.05■■□□□ 1.12
UBE2B-201ENST00000265339 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa22.05■■□□□ 1.12
UBE2B-201ENST00000265339 SELENOOQ9BVL4 669 aa22.05■■□□□ 1.12
UBE2B-201ENST00000265339 ITIH6Q6UXX5 1313 aa22.05■■□□□ 1.12
UBE2B-201ENST00000265339 K7ENM7 598 aa22.05■■□□□ 1.12
UBE2B-201ENST00000265339 ENC1O14682 589 aa22.05■■□□□ 1.12
UBE2B-201ENST00000265339 FECHP22830 423 aa22.05■■□□□ 1.12
UBE2B-201ENST00000265339 RDXP35241 583 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
UBE2B-201ENST00000265339 ARHGAP25P42331 645 aa22.05■■□□□ 1.12
UBE2B-201ENST00000265339 KCNA1Q09470 495 aa22.05■■□□□ 1.12
UBE2B-201ENST00000265339 ARHGEF6Q15052 776 aa22.05■■□□□ 1.12
UBE2B-201ENST00000265339 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
UBE2B-201ENST00000265339 BMT2Q1RMZ1 405 aa22.05■■□□□ 1.12
UBE2B-201ENST00000265339 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa22.05■■□□□ 1.12
UBE2B-201ENST00000265339 PXYLP1Q8TE99 480 aa22.05■■□□□ 1.12
UBE2B-201ENST00000265339 KCTD10Q9H3F6 313 aa22.05■■□□□ 1.12
UBE2B-201ENST00000265339 HDAC6Q9UBN7 1215 aa22.05■■□□□ 1.12
UBE2B-201ENST00000265339 GRIN2DO15399 1336 aa22.05■■□□□ 1.12
UBE2B-201ENST00000265339 MYADML2A6NDP7 307 aa22.04■■□□□ 1.12
UBE2B-201ENST00000265339 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP22.04■■□□□ 1.12
UBE2B-201ENST00000265339 PPP1R37O75864 691 aa22.04■■□□□ 1.12
UBE2B-201ENST00000265339 KIAA0754O94854 1291 aa22.04■■□□□ 1.12
UBE2B-201ENST00000265339 INSRRP14616 1297 aa22.04■■□□□ 1.12
UBE2B-201ENST00000265339 ZCWPW2Q504Y3 356 aa22.04■■□□□ 1.12
UBE2B-201ENST00000265339 OTUD6BQ8N6M0 293 aa22.04■■□□□ 1.12
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF507Q8TCN5 953 aa22.04■■□□□ 1.12
UBE2B-201ENST00000265339 STRA6Q9BX79 667 aa22.04■■□□□ 1.12
UBE2B-201ENST00000265339 WBP1LQ9NX94 342 aa22.04■■□□□ 1.12
UBE2B-201ENST00000265339 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
UBE2B-201ENST00000265339 F2P00734 622 aa22.04■■□□□ 1.12
UBE2B-201ENST00000265339 MYBL2P10244 700 aa22.04■■□□□ 1.12
UBE2B-201ENST00000265339 COPB1P53618 953 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
UBE2B-201ENST00000265339 KSR1Q8IVT5 923 aa22.04■■□□□ 1.12
UBE2B-201ENST00000265339 MMS19Q96T76 1030 aa22.04■■□□□ 1.12
UBE2B-201ENST00000265339 MYO1AQ9UBC5 1043 aa22.04■■□□□ 1.12
UBE2B-201ENST00000265339 MAPTP10636 758 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
UBE2B-201ENST00000265339 RTP1P59025 263 aa22.03■■□□□ 1.12
UBE2B-201ENST00000265339 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
UBE2B-201ENST00000265339 DRP2Q13474 957 aa22.03■■□□□ 1.12
UBE2B-201ENST00000265339 CYP26C1Q6V0L0 522 aa22.03■■□□□ 1.12
UBE2B-201ENST00000265339 ZBTB10Q96DT7 871 aa22.03■■□□□ 1.12
UBE2B-201ENST00000265339 C17orf75Q9HAS0 396 aa22.03■■□□□ 1.12
UBE2B-201ENST00000265339 TRIM17Q9Y577 477 aa22.03■■□□□ 1.12
UBE2B-201ENST00000265339 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
UBE2B-201ENST00000265339 KRT9P35527 623 aa22.03■■□□□ 1.12
UBE2B-201ENST00000265339 NPTX2P47972 431 aa22.03■■□□□ 1.12
UBE2B-201ENST00000265339 NCKAP1LP55160 1127 aa22.03■■□□□ 1.12
UBE2B-201ENST00000265339 GJA9P57773 515 aa22.03■■□□□ 1.12
UBE2B-201ENST00000265339 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
UBE2B-201ENST00000265339 CAPZA3Q96KX2 299 aa22.03■■□□□ 1.12
UBE2B-201ENST00000265339 KIFC3Q9BVG8 833 aa22.03■■□□□ 1.12
UBE2B-201ENST00000265339 GUCA1BQ9UMX6 200 aa22.03■■□□□ 1.12
UBE2B-201ENST00000265339 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa22.03■■□□□ 1.12
UBE2B-201ENST00000265339 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa22.02■■□□□ 1.12
UBE2B-201ENST00000265339 LRRC10BA6NIK2 292 aa22.02■■□□□ 1.12
UBE2B-201ENST00000265339 KCNJ18B7U540 433 aa22.02■■□□□ 1.12
UBE2B-201ENST00000265339 SLC16A4O15374 487 aa22.02■■□□□ 1.12
UBE2B-201ENST00000265339 MYL3P08590 195 aa22.02■■□□□ 1.12
UBE2B-201ENST00000265339 RARBP10826 455 aa22.02■■□□□ 1.12
UBE2B-201ENST00000265339 ARL2P36404 184 aa22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.5 ms