RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261169.10

LMO3-201, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO3, Length 3,810 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-201ENST00000261169 PPM1NQ8N819 430 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-201ENST00000261169 AGR3Q8TD06 166 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-201ENST00000261169 MAML1Q92585 1016 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-201ENST00000261169 EXT2Q93063 718 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-201ENST00000261169 BTBD6Q96KE9 485 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-201ENST00000261169 DEFB129Q9H1M3 183 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-201ENST00000261169 KCNH7Q9NS40 1196 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-201ENST00000261169 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
LMO3-201ENST00000261169 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-201ENST00000261169 PDXKO00764 312 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-201ENST00000261169 CFLARO15519 480 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-201ENST00000261169 GMNNO75496 209 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-201ENST00000261169 TXNP10599 105 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
LMO3-201ENST00000261169 RARBP10826 455 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-201ENST00000261169 DPEP1P16444 411 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-201ENST00000261169 ADORA2BP29275 332 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-201ENST00000261169 SERPINB6P35237 376 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-201ENST00000261169 MAP2K2P36507 400 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-201ENST00000261169 JAK3P52333 1124 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-201ENST00000261169 LMNB2Q03252 620 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-201ENST00000261169 MYO1EQ12965 1108 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-201ENST00000261169 ORC1Q13415 861 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-201ENST00000261169 NBPF9Q3BBW0 867 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-201ENST00000261169 SH2D4BQ5SQS7 431 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-201ENST00000261169 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
LMO3-201ENST00000261169 ALS2CLQ60I27 953 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-201ENST00000261169 SLFN12LQ6IEE8 588 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-201ENST00000261169 C1orf228Q6PIY5 440 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-201ENST00000261169 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
LMO3-201ENST00000261169 ANKMY2Q8IV38 441 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-201ENST00000261169 LMNTD2Q8IXW0 634 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-201ENST00000261169 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
LMO3-201ENST00000261169 GLIS3Q8NEA6 775 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-201ENST00000261169 FAF2Q96CS3 445 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-201ENST00000261169 PNKPQ96T60 521 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-201ENST00000261169 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
LMO3-201ENST00000261169 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
LMO3-201ENST00000261169 MTRQ99707 1265 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-201ENST00000261169 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP5.89□□□□□ -1.47
LMO3-201ENST00000261169 RUSC1Q9BVN2 902 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-201ENST00000261169 PITPNM3Q9BZ71 974 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-201ENST00000261169 SLC13A1Q9BZW2 595 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-201ENST00000261169 ACAD9Q9H845 621 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-201ENST00000261169 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
LMO3-201ENST00000261169 GGA3Q9NZ52 723 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-201ENST00000261169 SLC9A2Q9UBY0 812 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-201ENST00000261169 UBE4BO95155 1302 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-201ENST00000261169 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-201ENST00000261169 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-201ENST00000261169 GON4LQ3T8J9 2241 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-201ENST00000261169 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-201ENST00000261169 M0QYV0 167 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-201ENST00000261169 MSH4O15457 936 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-201ENST00000261169 CYTH3O43739 400 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-201ENST00000261169 PDGFRBP09619 1106 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-201ENST00000261169 GBP1P32455 592 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-201ENST00000261169 RASSF2P50749 326 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-201ENST00000261169 COG2Q14746 738 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-201ENST00000261169 NYAP1Q6ZVC0 841 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-201ENST00000261169 BBOF1Q8ND07 529 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-201ENST00000261169 RFFLQ8WZ73 363 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-201ENST00000261169 CDKL2Q92772 493 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-201ENST00000261169 HDAC11Q96DB2 347 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-201ENST00000261169 TRIM11Q96F44 468 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-201ENST00000261169 CYTH2Q99418 400 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-201ENST00000261169 AGPAT1Q99943 283 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-201ENST00000261169 TMEM117Q9H0C3 514 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-201ENST00000261169 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
LMO3-201ENST00000261169 NYAP2Q9P242 653 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-201ENST00000261169 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
LMO3-201ENST00000261169 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
LMO3-201ENST00000261169 MYOM1P52179 1685 aa5.89□□□□□ -1.47
LMO3-201ENST00000261169 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
LMO3-201ENST00000261169 NRXN1Q9ULB1 1477 aa5.88□□□□□ -1.47
LMO3-201ENST00000261169 GOLGA8CPA6NN73 597 aa5.88□□□□□ -1.47
LMO3-201ENST00000261169 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
LMO3-201ENST00000261169 MYL3P08590 195 aa5.88□□□□□ -1.47
LMO3-201ENST00000261169 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
LMO3-201ENST00000261169 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
LMO3-201ENST00000261169 RPA1P27694 616 aa5.88□□□□□ -1.47
LMO3-201ENST00000261169 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
LMO3-201ENST00000261169 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
LMO3-201ENST00000261169 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa5.88□□□□□ -1.47
LMO3-201ENST00000261169 SMTNL2Q2TAL5 461 aa5.88□□□□□ -1.47
LMO3-201ENST00000261169 KIAA1841Q6NSI8 718 aa5.88□□□□□ -1.47
LMO3-201ENST00000261169 TEX2Q8IWB9 1127 aa5.88□□□□□ -1.47
LMO3-201ENST00000261169 ZBED8Q8IZ13 594 aa5.88□□□□□ -1.47
LMO3-201ENST00000261169 CCDC33Q8N5R6 958 aa5.88□□□□□ -1.47
LMO3-201ENST00000261169 AGAP3Q96P47 875 aa5.88□□□□□ -1.47
LMO3-201ENST00000261169 CBWD1Q9BRT8 395 aa5.88□□□□□ -1.47
LMO3-201ENST00000261169 BEGAINQ9BUH8 593 aa5.88□□□□□ -1.47
LMO3-201ENST00000261169 CCDC68Q9H2F9 335 aa5.88□□□□□ -1.47
LMO3-201ENST00000261169 SEMA6BQ9H3T3 888 aa5.88□□□□□ -1.47
LMO3-201ENST00000261169 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
LMO3-201ENST00000261169 IFT122Q9HBG6 1241 aa5.88□□□□□ -1.47
LMO3-201ENST00000261169 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
LMO3-201ENST00000261169 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
LMO3-201ENST00000261169 PNMA2Q9UL42 364 aa5.88□□□□□ -1.47
LMO3-201ENST00000261169 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa5.88□□□□□ -1.47
LMO3-201ENST00000261169 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa5.88□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.1 ms