RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000086471.11

Suds3-201, Transcript of Sin3 histone deacetylase corepressor complex component SDS3, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Suds3, Length 2,425 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Suds3-201ENSMUST00000086471 Atp2a1Q8R429 994 aa25.04■■□□□ 1.6
Suds3-201ENSMUST00000086471 Med10Q9CXU0 135 aa25.04■■□□□ 1.6
Suds3-201ENSMUST00000086471 Wdr72D3YYM4 1114 aa25.04■■□□□ 1.6
Suds3-201ENSMUST00000086471 Actn3O88990 900 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
Suds3-201ENSMUST00000086471 Edem3Q2HXL6 931 aa25.04■■□□□ 1.6
Suds3-201ENSMUST00000086471 Znf532Q6NXK2 1036 aa25.04■■□□□ 1.6
Suds3-201ENSMUST00000086471 NostrinQ6WKZ7 506 aa25.04■■□□□ 1.6
Suds3-201ENSMUST00000086471 Gm45140A0A0N4SUM8 220 aa25.03■■□□□ 1.6
Suds3-201ENSMUST00000086471 Kcna3P16390 528 aa25.03■■□□□ 1.6
Suds3-201ENSMUST00000086471 Phka1P18826 1241 aa25.03■■□□□ 1.6
Suds3-201ENSMUST00000086471 PgfP49764 158 aa25.03■■□□□ 1.6
Suds3-201ENSMUST00000086471 Tatdn3Q3U1C6 294 aa25.03■■□□□ 1.6
Suds3-201ENSMUST00000086471 Cct6bQ61390 531 aa25.03■■□□□ 1.6
Suds3-201ENSMUST00000086471 Llgl1Q80Y17 1036 aa25.03■■□□□ 1.6
Suds3-201ENSMUST00000086471 Cwf19l2Q8BG79 887 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
Suds3-201ENSMUST00000086471 Tmco3Q8BH01 678 aa25.03■■□□□ 1.6
Suds3-201ENSMUST00000086471 Dusp19Q8K4T5 220 aa25.03■■□□□ 1.6
Suds3-201ENSMUST00000086471 Olfr1499Q8VG65 314 aa25.03■■□□□ 1.6
Suds3-201ENSMUST00000086471 Mageb16Q9CWV4 363 aa25.03■■□□□ 1.6
Suds3-201ENSMUST00000086471 Serpina9Q9D7D2 418 aa25.03■■□□□ 1.6
Suds3-201ENSMUST00000086471 PolkQ9QUG2 852 aa25.03■■□□□ 1.6
Suds3-201ENSMUST00000086471 Mmrn2A6H6E2 943 aa25.03■■□□□ 1.6
Suds3-201ENSMUST00000086471 Trim5E9PV98 497 aa25.03■■□□□ 1.6
Suds3-201ENSMUST00000086471 Krt35Q497I4 455 aa25.03■■□□□ 1.6
Suds3-201ENSMUST00000086471 Krit1Q6S5J6 736 aa25.03■■□□□ 1.6
Suds3-201ENSMUST00000086471 Lin9Q8C735 542 aa25.03■■□□□ 1.6
Suds3-201ENSMUST00000086471 Hdhd5Q91WM2 419 aa25.03■■□□□ 1.6
Suds3-201ENSMUST00000086471 Arhgap8Q9CXP4 425 aa25.03■■□□□ 1.6
Suds3-201ENSMUST00000086471 Arih1Q9Z1K5 555 aa25.03■■□□□ 1.6
Suds3-201ENSMUST00000086471 Mgat1P27808 447 aa25.02■■□□□ 1.6
Suds3-201ENSMUST00000086471 SnrpfP62307 86 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
Suds3-201ENSMUST00000086471 CiitaP79621 1155 aa25.02■■□□□ 1.6
Suds3-201ENSMUST00000086471 Cd180Q62192 661 aa25.02■■□□□ 1.6
Suds3-201ENSMUST00000086471 Pxylp1Q8BHA9 480 aa25.02■■□□□ 1.6
Suds3-201ENSMUST00000086471 Cst12Q9DAN8 128 aa25.02■■□□□ 1.6
Suds3-201ENSMUST00000086471 Nfx1B1AY10 1114 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
Suds3-201ENSMUST00000086471 TxkP42682 527 aa25.02■■□□□ 1.6
Suds3-201ENSMUST00000086471 Scarf2P59222 833 aa25.02■■□□□ 1.6
Suds3-201ENSMUST00000086471 PrkcbP68404 671 aa25.02■■□□□ 1.6
Suds3-201ENSMUST00000086471 Muc1Q02496 630 aa25.02■■□□□ 1.6
Suds3-201ENSMUST00000086471 MlxipQ2VPU4 917 aa25.02■■□□□ 1.6
Suds3-201ENSMUST00000086471 Srebf2Q3U1N2 1130 aa25.02■■□□□ 1.6
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ahcyl2Q68FL4 613 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ttc7aQ8BGB2 858 aa25.02■■□□□ 1.6
Suds3-201ENSMUST00000086471 Gnl3Q8CI11 538 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
Suds3-201ENSMUST00000086471 Tmco4Q91WU4 631 aa25.02■■□□□ 1.6
Suds3-201ENSMUST00000086471 Alkbh1P0CB42 389 aa25.01■■□□□ 1.59
Suds3-201ENSMUST00000086471 Irs1P35569 1233 aa25.01■■□□□ 1.59
Suds3-201ENSMUST00000086471 Pafah1b1P63005 410 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
Suds3-201ENSMUST00000086471 Spink5Q148R4 1017 aa25.01■■□□□ 1.59
Suds3-201ENSMUST00000086471 Q8CEZ4 452 aa25.01■■□□□ 1.59
Suds3-201ENSMUST00000086471 Zcchc18Q8VD24 393 aa25.01■■□□□ 1.59
Suds3-201ENSMUST00000086471 Cpsf2O35218 782 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
Suds3-201ENSMUST00000086471 Chrna1P04756 457 aa25.01■■□□□ 1.59
Suds3-201ENSMUST00000086471 Serpina1eQ00898 413 aa25.01■■□□□ 1.59
Suds3-201ENSMUST00000086471 NrcamQ810U4 1256 aa25.01■■□□□ 1.59
Suds3-201ENSMUST00000086471 Pds5aQ6A026 1332 aa25■■□□□ 1.59
Suds3-201ENSMUST00000086471 Snx27Q3UHD6 539 aa25■■□□□ 1.59
Suds3-201ENSMUST00000086471 Lrig3Q6P1C6 1117 aa25■■□□□ 1.59
Suds3-201ENSMUST00000086471 Atp1a2Q6PIE5 1020 aa25■■□□□ 1.59
Suds3-201ENSMUST00000086471 Il17cQ8K4C5 194 aa25■■□□□ 1.59
Suds3-201ENSMUST00000086471 Tmem206Q9D771 350 aa25■■□□□ 1.59
Suds3-201ENSMUST00000086471 Gm44511A0A0N4SW10 223 aa25■■□□□ 1.59
Suds3-201ENSMUST00000086471 Gm11985A0A1B0GS61 206 aa25■■□□□ 1.59
Suds3-201ENSMUST00000086471 Odf2A3KGV1 830 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
Suds3-201ENSMUST00000086471 Sclt1G5E861 688 aa25■■□□□ 1.59
Suds3-201ENSMUST00000086471 Klrb1bP27812 223 aa25■■□□□ 1.59
Suds3-201ENSMUST00000086471 Erich4Q3UNU4 136 aa25■■□□□ 1.59
Suds3-201ENSMUST00000086471 Asap3Q5U464 904 aa25■■□□□ 1.59
Suds3-201ENSMUST00000086471 Zfp251Q6PCX8 632 aa25■■□□□ 1.59
Suds3-201ENSMUST00000086471 Rnf139Q7TMV1 668 aa25■■□□□ 1.59
Suds3-201ENSMUST00000086471 Arrdc3Q7TPQ9 414 aa25■■□□□ 1.59
Suds3-201ENSMUST00000086471 Zbtb5Q7TQG0 670 aa25■■□□□ 1.59
Suds3-201ENSMUST00000086471 H2-Q4Q8HWB2 354 aa25■■□□□ 1.59
Suds3-201ENSMUST00000086471 Rpp40Q8R1F9 363 aa25■■□□□ 1.59
Suds3-201ENSMUST00000086471 Mettl7bQ9DD20 244 aa25■■□□□ 1.59
Suds3-201ENSMUST00000086471 Znhit2Q9QY66 399 aa25■■□□□ 1.59
Suds3-201ENSMUST00000086471 Btbd18A0A0A6YY25 723 aa24.99■■□□□ 1.59
Suds3-201ENSMUST00000086471 Osbpl7A2A716 963 aa24.99■■□□□ 1.59
Suds3-201ENSMUST00000086471 Xpo5Q924C1 1204 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
Suds3-201ENSMUST00000086471 Akt3Q9WUA6 479 aa24.99■■□□□ 1.59
Suds3-201ENSMUST00000086471 Sptlc1O35704 473 aa24.98■■□□□ 1.59
Suds3-201ENSMUST00000086471 EpoP07321 192 aa24.98■■□□□ 1.59
Suds3-201ENSMUST00000086471 ItpripQ3TNL8 555 aa24.98■■□□□ 1.59
Suds3-201ENSMUST00000086471 LbrQ3U9G9 626 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
Suds3-201ENSMUST00000086471 Gja3Q64448 417 aa24.98■■□□□ 1.59
Suds3-201ENSMUST00000086471 Kcnt1Q6ZPR4 1224 aa24.98■■□□□ 1.59
Suds3-201ENSMUST00000086471 Znf507Q6ZPY5 941 aa24.98■■□□□ 1.59
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ush1gQ80T11 461 aa24.98■■□□□ 1.59
Suds3-201ENSMUST00000086471 Depdc1bQ8BH88 529 aa24.98■■□□□ 1.59
Suds3-201ENSMUST00000086471 Olfml3Q8BK62 406 aa24.98■■□□□ 1.59
Suds3-201ENSMUST00000086471 Sar1bQ9CQC9 198 aa24.98■■□□□ 1.59
Suds3-201ENSMUST00000086471 Castor1Q9CWQ8 331 aa24.98■■□□□ 1.59
Suds3-201ENSMUST00000086471 Gm4846B2RWH8 538 aa24.98■■□□□ 1.59
Suds3-201ENSMUST00000086471 Olfr552E9Q545 317 aa24.98■■□□□ 1.59
Suds3-201ENSMUST00000086471 Cep112Q5PR68 954 aa24.98■■□□□ 1.59
Suds3-201ENSMUST00000086471 Slc26a6Q8CIW6 758 aa24.98■■□□□ 1.59
Suds3-201ENSMUST00000086471 Uchl3Q9JKB1 230 aa24.98■■□□□ 1.59
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ankrd2Q9WV06 328 aa24.98■■□□□ 1.59
Suds3-201ENSMUST00000086471 Atp2c2A7L9Z8 944 aa24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 19.8 ms