RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025294.7

Ttc39c-201, Transcript of Tetratricopeptide repeat protein 39C, mousemouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ttc39c, Length 2,571 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39c-201ENSMUST00000025294 Rtp1Q8C8C1 263 aa22.26■■□□□ 1.15
Ttc39c-201ENSMUST00000025294 Lrrc45Q8CIM1 670 aa22.26■■□□□ 1.15
Ttc39c-201ENSMUST00000025294 Lrrc42Q8R2U7 421 aa22.26■■□□□ 1.15
Ttc39c-201ENSMUST00000025294 Kdm4bQ91VY5 1086 aa22.26■■□□□ 1.15
Ttc39c-201ENSMUST00000025294 Mmrn1B2RPV6 1210 aa22.26■■□□□ 1.15
Ttc39c-201ENSMUST00000025294 Hnrnph1O35737 449 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
Ttc39c-201ENSMUST00000025294 Atp9aO70228 1047 aa22.26■■□□□ 1.15
Ttc39c-201ENSMUST00000025294 Ccnd2P30280 289 aa22.26■■□□□ 1.15
Ttc39c-201ENSMUST00000025294 Bank1Q80VH0 783 aa22.26■■□□□ 1.15
Ttc39c-201ENSMUST00000025294 Atg4cQ811C2 458 aa22.26■■□□□ 1.15
Ttc39c-201ENSMUST00000025294 Efcab14Q8BGQ6 484 aa22.26■■□□□ 1.15
Ttc39c-201ENSMUST00000025294 Fbxo38Q8BMI0 1194 aa22.26■■□□□ 1.15
Ttc39c-201ENSMUST00000025294 Fbxo43Q8CDI2 640 aa22.26■■□□□ 1.15
Ttc39c-201ENSMUST00000025294 Sppl3Q9CUS9 384 aa22.26■■□□□ 1.15
Ttc39c-201ENSMUST00000025294 Cnga3Q9JJZ8 631 aa22.26■■□□□ 1.15
Ttc39c-201ENSMUST00000025294 Ttll6A4Q9E8 822 aa22.25■■□□□ 1.15
Ttc39c-201ENSMUST00000025294 Tex35Q14BK3 207 aa22.25■■□□□ 1.15
Ttc39c-201ENSMUST00000025294 Rufy4Q3TYX8 563 aa22.25■■□□□ 1.15
Ttc39c-201ENSMUST00000025294 Slc9c1Q6UJY2 1175 aa22.25■■□□□ 1.15
Ttc39c-201ENSMUST00000025294 PycardQ9EPB4 193 aa22.25■■□□□ 1.15
Ttc39c-201ENSMUST00000025294 Itgb4A2A863 1818 aa22.25■■□□□ 1.15
Ttc39c-201ENSMUST00000025294 4933406M09RikG3XA12 479 aa22.25■■□□□ 1.15
Ttc39c-201ENSMUST00000025294 AfpP02772 605 aa22.25■■□□□ 1.15
Ttc39c-201ENSMUST00000025294 Irf8P23611 424 aa22.25■■□□□ 1.15
Ttc39c-201ENSMUST00000025294 Xrcc5P27641 732 aa22.25■■□□□ 1.15
Ttc39c-201ENSMUST00000025294 Miga1Q4QQM5 600 aa22.25■■□□□ 1.15
Ttc39c-201ENSMUST00000025294 Retreg2Q6NS82 541 aa22.25■■□□□ 1.15
Ttc39c-201ENSMUST00000025294 SpopQ6ZWS8 374 aa22.25■■□□□ 1.15
Ttc39c-201ENSMUST00000025294 Dusp4Q8BFV3 398 aa22.25■■□□□ 1.15
Ttc39c-201ENSMUST00000025294 Elmo3Q8BYZ7 720 aa22.25■■□□□ 1.15
Ttc39c-201ENSMUST00000025294 Hdac9Q99N13 588 aa22.25■■□□□ 1.15
Ttc39c-201ENSMUST00000025294 Fam133bQ9CVI2 245 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
Ttc39c-201ENSMUST00000025294 Rnf225Q9D7D1 332 aa22.25■■□□□ 1.15
Ttc39c-201ENSMUST00000025294 Drg2Q9QXB9 364 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
Ttc39c-201ENSMUST00000025294 Rasgrp1Q9Z1S3 795 aa22.25■■□□□ 1.15
Ttc39c-201ENSMUST00000025294 Olfr552E9Q545 317 aa22.24■■□□□ 1.15
Ttc39c-201ENSMUST00000025294 LipeP54310 759 aa22.24■■□□□ 1.15
Ttc39c-201ENSMUST00000025294 GabpaQ00422 454 aa22.24■■□□□ 1.15
Ttc39c-201ENSMUST00000025294 Cracr2aQ3UP38 310 aa22.24■■□□□ 1.15
Ttc39c-201ENSMUST00000025294 Fdxacb1Q3UY23 622 aa22.24■■□□□ 1.15
Ttc39c-201ENSMUST00000025294 Trim37Q6PCX9 961 aa22.24■■□□□ 1.15
Ttc39c-201ENSMUST00000025294 Rassf10Q8BL43 508 aa22.24■■□□□ 1.15
Ttc39c-201ENSMUST00000025294 TbckQ8BM85 762 aa22.24■■□□□ 1.15
Ttc39c-201ENSMUST00000025294 Rbm31yQ9D3U4 565 aa22.24■■□□□ 1.15
Ttc39c-201ENSMUST00000025294 Fem1bQ9Z2G0 627 aa22.24■■□□□ 1.15
Ttc39c-201ENSMUST00000025294 Unc13dB2RUP2 1085 aa22.24■■□□□ 1.15
Ttc39c-201ENSMUST00000025294 Gm4758L7N258 96 aa22.24■■□□□ 1.15
Ttc39c-201ENSMUST00000025294 Wfs1P56695 890 aa22.24■■□□□ 1.15
Ttc39c-201ENSMUST00000025294 Pla2g4cQ64GA5 597 aa22.24■■□□□ 1.15
Ttc39c-201ENSMUST00000025294 Gm2163Q6PCY5 473 aa22.24■■□□□ 1.15
Ttc39c-201ENSMUST00000025294 Pgrmc2Q80UU9 217 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
Ttc39c-201ENSMUST00000025294 Olfml3Q8BK62 406 aa22.24■■□□□ 1.15
Ttc39c-201ENSMUST00000025294 Krt71Q9R0H5 524 aa22.24■■□□□ 1.15
Ttc39c-201ENSMUST00000025294 GssP51855 474 aa22.23■■□□□ 1.15
Ttc39c-201ENSMUST00000025294 Lgr6Q3UVD5 967 aa22.23■■□□□ 1.15
Ttc39c-201ENSMUST00000025294 Bicd1Q8BR07 835 aa22.23■■□□□ 1.15
Ttc39c-201ENSMUST00000025294 Commd10Q8JZY2 202 aa22.23■■□□□ 1.15
Ttc39c-201ENSMUST00000025294 D630039A03RikQ8K0M7 236 aa22.23■■□□□ 1.15
Ttc39c-201ENSMUST00000025294 Dnajc28Q8VCE1 385 aa22.23■■□□□ 1.15
Ttc39c-201ENSMUST00000025294 Mis12Q9CY25 206 aa22.23■■□□□ 1.15
Ttc39c-201ENSMUST00000025294 Trmt10bQ9D075 318 aa22.23■■□□□ 1.15
Ttc39c-201ENSMUST00000025294 CsadQ9DBE0 493 aa22.23■■□□□ 1.15
Ttc39c-201ENSMUST00000025294 Cyp2s1Q9DBX6 501 aa22.23■■□□□ 1.15
Ttc39c-201ENSMUST00000025294 Gm382B1AXN3 1250 aa22.23■■□□□ 1.15
Ttc39c-201ENSMUST00000025294 Gm10488Q4KL05 212 aa22.23■■□□□ 1.15
Ttc39c-201ENSMUST00000025294 FancbQ5XJY6 703 aa22.23■■□□□ 1.15
Ttc39c-201ENSMUST00000025294 Gpd2Q64521 727 aa22.23■■□□□ 1.15
Ttc39c-201ENSMUST00000025294 Usp29Q9ES63 869 aa22.23■■□□□ 1.15
Ttc39c-201ENSMUST00000025294 Cpb2Q9JHH6 422 aa22.23■■□□□ 1.15
Ttc39c-201ENSMUST00000025294 Eddm13E9Q7F5 164 aa22.22■■□□□ 1.15
Ttc39c-201ENSMUST00000025294 IvlP48997 467 aa22.22■■□□□ 1.15
Ttc39c-201ENSMUST00000025294 Rnf216P58283 853 aa22.22■■□□□ 1.15
Ttc39c-201ENSMUST00000025294 Nipa1Q8BHK1 323 aa22.22■■□□□ 1.15
Ttc39c-201ENSMUST00000025294 Cyp2d26Q8CIM7 500 aa22.22■■□□□ 1.15
Ttc39c-201ENSMUST00000025294 Rnf6Q9DBU5 667 aa22.22■■□□□ 1.15
Ttc39c-201ENSMUST00000025294 Myo1eE9Q634 1107 aa22.22■■□□□ 1.15
Ttc39c-201ENSMUST00000025294 Slc1a1P51906 523 aa22.22■■□□□ 1.15
Ttc39c-201ENSMUST00000025294 Rps6P62754 249 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
Ttc39c-201ENSMUST00000025294 Mageb18Q8BQR7 327 aa22.22■■□□□ 1.15
Ttc39c-201ENSMUST00000025294 Tmem161bQ8C2L6 487 aa22.22■■□□□ 1.15
Ttc39c-201ENSMUST00000025294 Pcdha5Q91Y15 934 aa22.22■■□□□ 1.15
Ttc39c-201ENSMUST00000025294 4930550L24RikQ99PA7 320 aa22.22■■□□□ 1.15
Ttc39c-201ENSMUST00000025294 Tgm5Q9D7I9 724 aa22.22■■□□□ 1.15
Ttc39c-201ENSMUST00000025294 Ccdc91Q9D8L5 442 aa22.22■■□□□ 1.15
Ttc39c-201ENSMUST00000025294 MesdQ9ERE7 224 aa22.22■■□□□ 1.15
Ttc39c-201ENSMUST00000025294 Mta2Q9R190 668 aa22.22■■□□□ 1.15
Ttc39c-201ENSMUST00000025294 TazI7HJS2 263 aa22.21■■□□□ 1.15
Ttc39c-201ENSMUST00000025294 Wdr41Q3UDP0 460 aa22.21■■□□□ 1.15
Ttc39c-201ENSMUST00000025294 Ccdc125Q5U465 500 aa22.21■■□□□ 1.15
Ttc39c-201ENSMUST00000025294 Six1Q62231 284 aa22.21■■□□□ 1.15
Ttc39c-201ENSMUST00000025294 Tbc1d22bQ80VE5 505 aa22.21■■□□□ 1.15
Ttc39c-201ENSMUST00000025294 Fsd1lQ8BYN5 507 aa22.21■■□□□ 1.15
Ttc39c-201ENSMUST00000025294 Epc2Q8C0I4 808 aa22.21■■□□□ 1.15
Ttc39c-201ENSMUST00000025294 Pnma1Q8C1C8 353 aa22.21■■□□□ 1.15
Ttc39c-201ENSMUST00000025294 Apol9bQ8C7I4 310 aa22.21■■□□□ 1.15
Ttc39c-201ENSMUST00000025294 C130026I21RikQ8C898 291 aa22.21■■□□□ 1.15
Ttc39c-201ENSMUST00000025294 Klhl11Q8CE33 709 aa22.21■■□□□ 1.15
Ttc39c-201ENSMUST00000025294 Apol9aQ8VDU3 310 aa22.21■■□□□ 1.15
Ttc39c-201ENSMUST00000025294 Themis2Q91YX0 663 aa22.21■■□□□ 1.15
Ttc39c-201ENSMUST00000025294 Sf3a3Q9D554 501 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 19.7 ms