RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000020163.6

Nedd1-201, Transcript of Protein NEDD1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Nedd1, Length 3,534 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Rpap2Q8VC34 614 aa10.64□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Pex19Q8VCI5 299 aa10.64□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Fam192aQ91WE2 254 aa10.64□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cpb2Q9JHH6 422 aa10.64□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Zfp831A2ADM8 1628 aa10.64□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 MttpO08601 894 aa10.64□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 HdgfP51859 237 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gdf10P97737 476 aa10.64□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gpsm3Q3U1Z5 159 aa10.64□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ctc1Q5SUQ9 1212 aa10.64□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Rsad1Q5SUV1 442 aa10.64□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gpr139Q80UC8 345 aa10.64□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Smim5Q8BT42 78 aa10.64□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Fam187aQ9D3R5 417 aa10.64□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Drap1Q9D6N5 205 aa10.64□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Hyou1Q9JKR6 999 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Hebp1Q9R257 190 aa10.64□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Psmc2P46471 433 aa10.64□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Rpl13P47963 211 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Lilrb3P97484 841 aa10.64□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Mark3Q03141 753 aa10.64□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Kctd19Q562E2 927 aa10.64□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Hbs1lQ69ZS7 682 aa10.64□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Orai3Q6P8G8 290 aa10.64□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Nucks1Q80XU3 234 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Lpgat1Q91YX5 370 aa10.64□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 HgsQ99LI8 775 aa10.64□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tomm20lQ9D4V6 152 aa10.64□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Xab2Q9DCD2 855 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ccnt1Q9QWV9 724 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Phtf1Q9QZ09 761 aa10.64□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Glt1d1A4FUP9 346 aa10.63□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Alppl2P24823 529 aa10.63□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Nedd4P46935 887 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Xlr3aQ60595 226 aa10.63□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Nlrp4eQ66X19 978 aa10.63□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Chmp2bQ8BJF9 213 aa10.63□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 SowahcQ8C0J6 512 aa10.63□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ccdc113Q8C5T8 377 aa10.63□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 PnkpQ9JLV6 522 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Osbpl7A2A716 963 aa10.63□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Eps15P42567 897 aa10.63□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 FerP70451 823 aa10.63□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Islr2Q5RKR3 745 aa10.63□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Rasa3Q60790 834 aa10.63□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Grtp1Q9D3N8 359 aa10.63□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Fthl17aQ9DAX0 182 aa10.63□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Dmap1Q9JI44 468 aa10.63□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Nap1l5Q9JJF0 156 aa10.63□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Epb41l3Q9WV92 929 aa10.63□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Map3k15A2AQW0 1331 aa10.63□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm8994E9PV04 411 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 DtnbO70585 659 aa10.63□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Rfx2P48379 717 aa10.63□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Psmc4P54775 418 aa10.63□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ripk2P58801 539 aa10.63□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Wdhd1P59328 1117 aa10.63□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Aars2Q14CH7 980 aa10.63□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Stxbp3Q60770 592 aa10.63□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Zcchc2Q69ZB8 1166 aa10.63□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 PhkbQ7TSH2 1085 aa10.63□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Llgl1Q80Y17 1036 aa10.63□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm5622Q810Q0 167 aa10.63□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 NrcamQ810U4 1256 aa10.63□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Nop53Q8BK35 484 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Heatr3Q8BQM4 679 aa10.63□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Snx30Q8CE50 437 aa10.63□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 YarsQ91WQ3 528 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Mrps22Q9CXW2 359 aa10.63□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Txnrd1Q9JMH6 613 aa10.63□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Pex11aQ9Z211 246 aa10.63□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Fam155bA2BDP1 471 aa10.62□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 AurkbO70126 345 aa10.62□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Atp9aO70228 1047 aa10.62□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cdh16O88338 830 aa10.62□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Art2aP17981 287 aa10.62□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Soat1Q61263 540 aa10.62□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Mageb18Q8BQR7 327 aa10.62□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Q8BT18 775 aa10.62□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 SucoQ8C341 1250 aa10.62□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 TdrpQ8C5P7 182 aa10.62□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tesk2Q8VCT9 570 aa10.62□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Stx18Q8VDS8 334 aa10.62□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Terb2Q9D494 218 aa10.62□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Mta2Q9R190 668 aa10.62□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cib2Q9Z309 187 aa10.62□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm30191A0A0U1RNT7 187 aa10.62□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ythdf1P59326 559 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Rpusd2Q149F1 553 aa10.62□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 ZufspQ3T9Z9 577 aa10.62□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Pdp2Q504M2 532 aa10.62□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Jmjd4Q8BFT6 427 aa10.62□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 B3glctQ8BHT6 489 aa10.62□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 CpvlQ9D3S9 478 aa10.62□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 IydQ9DCX8 285 aa10.62□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Mia3Q8BI84 1930 aa10.62□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 C4bP01029 1738 aa10.62□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ltn1Q6A009 1767 aa10.62□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Nme9A0A1L1SUL6 329 aa10.62□□□□□ -0.71
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Sema4dO09126 861 aa10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 19.4 ms