RNA–Protein interactions for RNA: YPL178W

CBC2, Transcript of Small subunit of the heterodimeric cap binding complex with Sto1p, yeastyeast

Gene CBC2, Length 627 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CBC2YPL178W SET6Q12529 373 aa4.79□□□□□ -1.64
CBC2YPL178W RHO1P06780 209 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
CBC2YPL178W SPO7P18410 259 aa4.78□□□□□ -1.64
CBC2YPL178W PRP21P32524 280 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
CBC2YPL178W CYS4P32582 507 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
CBC2YPL178W MRPL39P36533 70 aa4.78□□□□□ -1.64
CBC2YPL178W VBA2P38358 474 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
CBC2YPL178W CHL4P38907 458 aa4.78□□□□□ -1.64
CBC2YPL178W ZRG8P40021 1076 aa4.78□□□□□ -1.64
CBC2YPL178W KRE29P40026 464 aa4.78□□□□□ -1.64
CBC2YPL178W RFC4P40339 323 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
CBC2YPL178W SNX4P47057 423 aa4.78□□□□□ -1.64
CBC2YPL178W COS10P52924 374 aa4.78□□□□□ -1.64
CBC2YPL178W YMD8Q03697 442 aa4.78□□□□□ -1.64
CBC2YPL178W SMP3Q04174 516 aa4.78□□□□□ -1.64
CBC2YPL178W YPR147CQ06522 304 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
CBC2YPL178W GRE1Q08969 168 aa4.78□□□□□ -1.64
CBC2YPL178W YOR343CQ12484 108 aa4.78□□□□□ -1.64
CBC2YPL178W PRB1P09232 635 aa4.77□□□□□ -1.65
CBC2YPL178W SAM35P14693 329 aa4.77□□□□□ -1.65
CBC2YPL178W TAL1P15019 335 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
CBC2YPL178W RPB8P20436 146 aa4.77□□□□□ -1.65
CBC2YPL178W OAC1P32332 324 aa4.77□□□□□ -1.65
CBC2YPL178W MDH3P32419 343 aaKnown RBP RIP-Chip data4.77□□□□□ -1.65not detected
CBC2YPL178W ECM4P36156 370 aa4.77□□□□□ -1.65
CBC2YPL178W ECM8P38246 354 aa4.77□□□□□ -1.65
CBC2YPL178W YBR242WP38331 238 aa4.77□□□□□ -1.65
CBC2YPL178W MLH1P38920 769 aa4.77□□□□□ -1.65
CBC2YPL178W STB1P42845 420 aa4.77□□□□□ -1.65
CBC2YPL178W RET2P43621 546 aa4.77□□□□□ -1.65
CBC2YPL178W SSY5P47002 699 aa4.77□□□□□ -1.65
CBC2YPL178W HMS2P47175 358 aa4.77□□□□□ -1.65
CBC2YPL178W BRR6P53062 197 aa4.77□□□□□ -1.65
CBC2YPL178W MON1P53129 644 aa4.77□□□□□ -1.65
CBC2YPL178W SOK2P53438 785 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
CBC2YPL178W NUP116Q02630 1113 aa4.77□□□□□ -1.65
CBC2YPL178W KAP120Q02932 1032 aa4.77□□□□□ -1.65
CBC2YPL178W CRR1Q05790 422 aa4.77□□□□□ -1.65
CBC2YPL178W HRT1Q08273 121 aa4.77□□□□□ -1.65
CBC2YPL178W YDL180WQ12301 547 aa4.77□□□□□ -1.65
CBC2YPL178W YIL002W-AQ3E7Z5 69 aa4.77□□□□□ -1.65
CBC2YPL178W MSW1P04803 379 aa4.76□□□□□ -1.65
CBC2YPL178W PHO80P20052 293 aa4.76□□□□□ -1.65
CBC2YPL178W GAS1P22146 559 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
CBC2YPL178W MAK32P23060 363 aa4.76□□□□□ -1.65
CBC2YPL178W MCM10P32354 571 aa4.76□□□□□ -1.65
CBC2YPL178W SOF1P33750 489 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
CBC2YPL178W COS9P36034 407 aa4.76□□□□□ -1.65
CBC2YPL178W MRPL16P38064 232 aa4.76□□□□□ -1.65
CBC2YPL178W RTC2P38279 296 aa4.76□□□□□ -1.65
CBC2YPL178W YMR262WP38430 313 aa4.76□□□□□ -1.65
CBC2YPL178W RPP1P38786 293 aa4.76□□□□□ -1.65
CBC2YPL178W PHO90P39535 881 aa4.76□□□□□ -1.65
CBC2YPL178W PDS1P40316 373 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
CBC2YPL178W NQM1P53228 333 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
CBC2YPL178W YNR040WP53736 256 aa4.76□□□□□ -1.65
CBC2YPL178W MNT4P53745 580 aa4.76□□□□□ -1.65
CBC2YPL178W MRPL19P53875 158 aa4.76□□□□□ -1.65
CBC2YPL178W APM1Q00776 475 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
CBC2YPL178W PLB2Q03674 706 aa4.76□□□□□ -1.65
CBC2YPL178W ELP6Q04868 273 aa4.76□□□□□ -1.65
CBC2YPL178W RAF1Q06891 181 aa4.76□□□□□ -1.65
CBC2YPL178W RCN2Q12044 265 aa4.76□□□□□ -1.65
CBC2YPL178W RTC5Q12108 567 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
CBC2YPL178W PCL9Q12477 304 aa4.76□□□□□ -1.65
CBC2YPL178W REP1P03871 373 aa4.75□□□□□ -1.65
CBC2YPL178W HIS3P06633 220 aa4.75□□□□□ -1.65
CBC2YPL178W NFT1P0CE68 1218 aa4.75□□□□□ -1.65
CBC2YPL178W IDP1P21954 428 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
CBC2YPL178W CAM1P29547 415 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
CBC2YPL178W THI4P32318 326 aa4.75□□□□□ -1.65
CBC2YPL178W KRE6P32486 720 aa4.75□□□□□ -1.65
CBC2YPL178W PAD1P33751 242 aaKnown RBP RIP-Chip data4.75□□□□□ -1.65not detected
CBC2YPL178W GVP36P40531 326 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
CBC2YPL178W HIS6P40545 261 aa4.75□□□□□ -1.65
CBC2YPL178W MSS2P40990 351 aa4.75□□□□□ -1.65
CBC2YPL178W SFH5P47008 294 aa4.75□□□□□ -1.65
CBC2YPL178W DPB11P47027 764 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
CBC2YPL178W ADO1P47143 340 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
CBC2YPL178W SLD3P53135 668 aa4.75□□□□□ -1.65
CBC2YPL178W MKC7P53379 596 aa4.75□□□□□ -1.65
CBC2YPL178W RRN9P53437 365 aa4.75□□□□□ -1.65
CBC2YPL178W BUD17P53727 317 aa4.75□□□□□ -1.65
CBC2YPL178W YMR099CQ03161 297 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
CBC2YPL178W OST6Q03723 332 aa4.75□□□□□ -1.65
CBC2YPL178W FIN1Q03898 291 aa4.75□□□□□ -1.65
CBC2YPL178W TY1A-DR2Q03964 440 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
CBC2YPL178W YMR315WQ04869 349 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
CBC2YPL178W COQ11Q05892 277 aa4.75□□□□□ -1.65
CBC2YPL178W CTS2Q06350 511 aa4.75□□□□□ -1.65
CBC2YPL178W YLR040CQ07988 224 aa4.75□□□□□ -1.65
CBC2YPL178W YOR289WQ12012 251 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
CBC2YPL178W MED2Q12124 431 aa4.75□□□□□ -1.65
CBC2YPL178W ACF2Q12168 779 aa4.75□□□□□ -1.65
CBC2YPL178W DBP10Q12389 995 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
CBC2YPL178W VCX1Q99385 411 aa4.75□□□□□ -1.65
CBC2YPL178W HEM4P06174 275 aa4.74□□□□□ -1.65
CBC2YPL178W SSA3P09435 649 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
CBC2YPL178W YGL041W-AP0C5N3 154 aa4.74□□□□□ -1.65
CBC2YPL178W RPL35AP0CX84 120 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
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