RNA–Protein interactions for RNA: YMR198W

CIK1, Transcript of Kinesin-associated protein, yeast

Gene CIK1, Length 1,785 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CIK1	YMR198W	OST6	Q03723	332 aa		2.76	□□□□□ -1.97
CIK1	YMR198W	REX4	Q08237	289 aa		2.76	□□□□□ -1.97
CIK1	YMR198W	GRE1	Q08969	168 aa		2.76	□□□□□ -1.97
CIK1	YMR198W	SNF8	Q12483	233 aa		2.76	□□□□□ -1.97
CIK1	YMR198W	IDH1	P28834	360 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.75	□□□□□ -1.97	not detected
CIK1	YMR198W	IES6	P32617	166 aa		2.75	□□□□□ -1.97
CIK1	YMR198W	VAM7	P32912	316 aa		2.75	□□□□□ -1.97
CIK1	YMR198W	VPS21	P36017	210 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
CIK1	YMR198W	DTR1	P38125	572 aa		2.75	□□□□□ -1.97
CIK1	YMR198W	TDA11	P38854	504 aa		2.75	□□□□□ -1.97
CIK1	YMR198W	PXR1	P53335	271 aa	Predicted RBP	2.75	□□□□□ -1.97
CIK1	YMR198W	MKC7	P53379	596 aa		2.75	□□□□□ -1.97
CIK1	YMR198W	GPI15	P53961	229 aa		2.75	□□□□□ -1.97
CIK1	YMR198W	SKI8	Q02793	397 aa	Predicted RBP	2.75	□□□□□ -1.97
CIK1	YMR198W	ECM11	Q04110	302 aa		2.75	□□□□□ -1.97
CIK1	YMR198W	SEC10	Q06245	871 aa		2.75	□□□□□ -1.97
CIK1	YMR198W	PBP4	Q07362	185 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
CIK1	YMR198W	YDL109C	Q12103	647 aa		2.75	□□□□□ -1.97
CIK1	YMR198W	YOR338W	Q99326	363 aa		2.75	□□□□□ -1.97
CIK1	YMR198W	QCR7	P00128	127 aa		2.74	□□□□□ -1.97
CIK1	YMR198W	HIS1	P00498	297 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
CIK1	YMR198W	ATP6	P00854	259 aa		2.74	□□□□□ -1.97
CIK1	YMR198W	CTR86	P25355	563 aa		2.74	□□□□□ -1.97
CIK1	YMR198W	BMH1	P29311	267 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
CIK1	YMR198W	ACB1	P31787	87 aa		2.74	□□□□□ -1.97
CIK1	YMR198W	NUP2	P32499	720 aa		2.74	□□□□□ -1.97
CIK1	YMR198W	COX13	P32799	129 aa		2.74	□□□□□ -1.97
CIK1	YMR198W	SPO23	P33757	523 aa		2.74	□□□□□ -1.97
CIK1	YMR198W	TAF14	P35189	244 aa		2.74	□□□□□ -1.97
CIK1	YMR198W	AME1	P38313	324 aa		2.74	□□□□□ -1.97
CIK1	YMR198W	URA8	P38627	578 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97
CIK1	YMR198W	TRM5	P38793	499 aa		2.74	□□□□□ -1.97
CIK1	YMR198W	COX15	P40086	486 aa		2.74	□□□□□ -1.97
CIK1	YMR198W	SLM1	P40485	686 aa		2.74	□□□□□ -1.97
CIK1	YMR198W	AZR1	P50080	613 aa		2.74	□□□□□ -1.97
CIK1	YMR198W	RRN9	P53437	365 aa		2.74	□□□□□ -1.97
CIK1	YMR198W	MRS2	Q01926	470 aa		2.74	□□□□□ -1.97
CIK1	YMR198W	YCL012C	Q8J0M4	134 aa		2.74	□□□□□ -1.97
CIK1	YMR198W	FAB1	P34756	2278 aa		2.74	□□□□□ -1.97
CIK1	YMR198W	TPK3	P05986	398 aa		2.74	□□□□□ -1.97
CIK1	YMR198W	QCR2	P07257	368 aa		2.74	□□□□□ -1.97
CIK1	YMR198W	ARF2	P19146	181 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
CIK1	YMR198W	MRPL8	P22353	238 aa		2.74	□□□□□ -1.97
CIK1	YMR198W	SSO1	P32867	290 aa		2.74	□□□□□ -1.97
CIK1	YMR198W	DDI1	P40087	428 aa		2.74	□□□□□ -1.97
CIK1	YMR198W	LSM1	P47017	172 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
CIK1	YMR198W	TAD2	P47058	250 aa		2.74	□□□□□ -1.97
CIK1	YMR198W	HOC1	P47124	396 aa		2.74	□□□□□ -1.97
CIK1	YMR198W	HMS2	P47175	358 aa		2.74	□□□□□ -1.97
CIK1	YMR198W	TOS2	P50078	622 aa		2.74	□□□□□ -1.97
CIK1	YMR198W	YPL080C	Q02826	108 aa		2.74	□□□□□ -1.97
CIK1	YMR198W	PEX12	Q04370	399 aa		2.74	□□□□□ -1.97
CIK1	YMR198W	NDE2	Q07500	545 aa		2.74	□□□□□ -1.97
CIK1	YMR198W	APC9	Q12107	265 aa		2.74	□□□□□ -1.97
CIK1	YMR198W	PER33	Q12144	273 aa		2.74	□□□□□ -1.97
CIK1	YMR198W	RIO1	Q12196	484 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
CIK1	YMR198W	RNA15	P25299	296 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
CIK1	YMR198W	MEI4	P29467	408 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CIK1	YMR198W	TOA2	P32774	122 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CIK1	YMR198W	YBR056W	P38081	501 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CIK1	YMR198W	MRX3	P38172	270 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CIK1	YMR198W	FIG1	P38224	298 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CIK1	YMR198W	IST2	P38250	946 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CIK1	YMR198W	FZO1	P38297	855 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CIK1	YMR198W	PRS2	P38620	318 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
CIK1	YMR198W	ATG7	P38862	630 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CIK1	YMR198W	SOP4	P39543	234 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
CIK1	YMR198W	GAB1	P41733	394 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CIK1	YMR198W	CTF19	Q02732	369 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CIK1	YMR198W	YDR209C	Q03480	137 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CIK1	YMR198W	CSM4	Q08955	156 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CIK1	YMR198W	ORT1	Q12375	292 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CIK1	YMR198W	YDR157W	A0A023PZE8	133 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CIK1	YMR198W	SEN2	P16658	377 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CIK1	YMR198W	FAR1	P21268	830 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CIK1	YMR198W	RFA3	P26755	122 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
CIK1	YMR198W	MUD1	P32605	298 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
CIK1	YMR198W	CSE2	P33308	149 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CIK1	YMR198W	YKL097C	P34245	136 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CIK1	YMR198W	POG1	P40473	351 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CIK1	YMR198W	YPT32	P51996	222 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
CIK1	YMR198W	LST7	P53237	242 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CIK1	YMR198W	YIP3	P53633	176 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CIK1	YMR198W	YPL077C	Q02831	240 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CIK1	YMR198W	PEX10	Q05568	337 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CIK1	YMR198W	ASR1	Q06834	288 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CIK1	YMR198W	TUS1	Q06412	1307 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CIK1	YMR198W	ILV1	P00927	576 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
CIK1	YMR198W	RPP0	P05317	312 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
CIK1	YMR198W	PET494	P07390	489 aa	Predicted RBP	2.72	□□□□□ -1.97
CIK1	YMR198W	NAM2	P11325	894 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CIK1	YMR198W	SNA3	P14359	133 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CIK1	YMR198W	DCC1	P25559	380 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CIK1	YMR198W	ZRT1	P32804	376 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CIK1	YMR198W	CSE1	P33307	960 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CIK1	YMR198W	RCK2	P38623	610 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CIK1	YMR198W	IKI1	P38874	309 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CIK1	YMR198W	SRP14	P38985	146 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CIK1	YMR198W	LYS1	P38998	373 aa	RIP-Chip data	2.72	□□□□□ -1.97	RIP-Chip
CIK1	YMR198W	NPT1	P39683	429 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97

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