RNA–Protein interactions for RNA: YMR065W

KAR5, Transcript of Protein required for nuclear membrane fusion during karyogamy, yeast

Gene KAR5, Length 1,515 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
KAR5	YMR065W	TY1B-ER2	Q03619	1755 aa		3.09	□□□□□ -1.91
KAR5	YMR065W	TY1B-MR1	Q04214	1755 aa		3.09	□□□□□ -1.91
KAR5	YMR065W	TY1B-MR2	Q04670	1755 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
KAR5	YMR065W	TY1B-LR1	Q12088	1755 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
KAR5	YMR065W	TY1B-NL1	Q12112	1755 aa		3.09	□□□□□ -1.91
KAR5	YMR065W	TY1B-GR1	Q12141	1755 aa		3.09	□□□□□ -1.91
KAR5	YMR065W	TY1B-BL	Q12490	1755 aa		3.09	□□□□□ -1.91
KAR5	YMR065W	VPS15	P22219	1454 aa		3.09	□□□□□ -1.92
KAR5	YMR065W	DRS2	P39524	1355 aa		3.09	□□□□□ -1.92
KAR5	YMR065W	MRPL20	P22354	195 aa	Predicted RBP	3.09	□□□□□ -1.92
KAR5	YMR065W	SSO2	P39926	295 aa		3.09	□□□□□ -1.92
KAR5	YMR065W	YGL118C	P53132	145 aa		3.09	□□□□□ -1.92
KAR5	YMR065W	SMD1	Q02260	146 aa	Predicted RBP	3.09	□□□□□ -1.92
KAR5	YMR065W	UBX2	Q04228	584 aa		3.09	□□□□□ -1.92
KAR5	YMR065W	VPS20	Q04272	221 aa		3.09	□□□□□ -1.92
KAR5	YMR065W	SAM4	Q08985	325 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.92
KAR5	YMR065W	CUP2	P15315	225 aa		3.08	□□□□□ -1.92
KAR5	YMR065W	PET18	P25362	215 aa		3.08	□□□□□ -1.92
KAR5	YMR065W	ZRT1	P32804	376 aa		3.08	□□□□□ -1.92
KAR5	YMR065W	YHR035W	P38769	630 aa		3.08	□□□□□ -1.92
KAR5	YMR065W	POP2	P39008	433 aa		3.08	□□□□□ -1.92
KAR5	YMR065W	SLM1	P40485	686 aa		3.08	□□□□□ -1.92
KAR5	YMR065W	YIL059C	P40520	121 aa		3.08	□□□□□ -1.92
KAR5	YMR065W	INA22	P40576	216 aa		3.08	□□□□□ -1.92
KAR5	YMR065W	CAX4	P53223	239 aa		3.08	□□□□□ -1.92
KAR5	YMR065W	YPL080C	Q02826	108 aa		3.08	□□□□□ -1.92
KAR5	YMR065W	RTC5	Q12108	567 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
KAR5	YMR065W	YPR1	Q12458	312 aa		3.08	□□□□□ -1.92
KAR5	YMR065W	BI3	Q9ZZW7	517 aa		3.08	□□□□□ -1.92
KAR5	YMR065W	SWC5	P38326	303 aa		3.07	□□□□□ -1.92
KAR5	YMR065W	PET8	P38921	284 aa		3.07	□□□□□ -1.92
KAR5	YMR065W	COS4	P43542	379 aa		3.07	□□□□□ -1.92
KAR5	YMR065W	YNR066C	P53752	436 aa		3.07	□□□□□ -1.92
KAR5	YMR065W	SNX41	Q04053	625 aa		3.07	□□□□□ -1.92
KAR5	YMR065W	DIB1	Q06819	143 aa	Predicted RBP	3.07	□□□□□ -1.92
KAR5	YMR065W	UTP23	Q12339	254 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
KAR5	YMR065W	RPO21	P04050	1733 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
KAR5	YMR065W	INO2	P26798	304 aa		3.06	□□□□□ -1.92
KAR5	YMR065W	RPB9	P27999	122 aa		3.06	□□□□□ -1.92
KAR5	YMR065W	CPR7	P47103	393 aa		3.06	□□□□□ -1.92
KAR5	YMR065W	REX3	Q12090	404 aa		3.06	□□□□□ -1.92
KAR5	YMR065W	TFC7	Q12415	435 aa		3.06	□□□□□ -1.92
KAR5	YMR065W	PAA1	Q12447	191 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
KAR5	YMR065W	SSN2	P38931	1420 aa		3.06	□□□□□ -1.92
KAR5	YMR065W	SPO14	P36126	1683 aa		3.05	□□□□□ -1.92
KAR5	YMR065W	DOP1	Q03921	1698 aa		3.05	□□□□□ -1.92
KAR5	YMR065W	IME2	P32581	645 aa		3.05	□□□□□ -1.92
KAR5	YMR065W	AGA2	P32781	87 aa		3.05	□□□□□ -1.92
KAR5	YMR065W	SUR1	P33300	382 aa		3.05	□□□□□ -1.92
KAR5	YMR065W	YKL162C	P36052	402 aa		3.05	□□□□□ -1.92
KAR5	YMR065W	YDR089W	P38966	869 aa		3.05	□□□□□ -1.92
KAR5	YMR065W	SOP4	P39543	234 aa	Predicted RBP	3.05	□□□□□ -1.92
KAR5	YMR065W	YFL040W	P43562	540 aa		3.05	□□□□□ -1.92
KAR5	YMR065W	OKP1	P53298	406 aa		3.05	□□□□□ -1.92
KAR5	YMR065W	PRO2	P54885	456 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
KAR5	YMR065W	PBP4	Q07362	185 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
KAR5	YMR065W	VIK1	Q12045	647 aa		3.05	□□□□□ -1.92
KAR5	YMR065W	TRM10	Q12400	293 aa		3.05	□□□□□ -1.92
KAR5	YMR065W	NUP159	P40477	1460 aa		3.05	□□□□□ -1.92
KAR5	YMR065W	TRM732	Q03496	1420 aa		3.04	□□□□□ -1.92
KAR5	YMR065W	CBP2	P03874	630 aa	Predicted RBP	3.04	□□□□□ -1.92
KAR5	YMR065W	ASP1	P38986	381 aa	Predicted RBP	3.04	□□□□□ -1.92
KAR5	YMR065W	FET3	P38993	636 aa		3.04	□□□□□ -1.92
KAR5	YMR065W	OSW5	P40219	148 aa		3.04	□□□□□ -1.92
KAR5	YMR065W	ABZ2	Q03266	374 aa		3.04	□□□□□ -1.92
KAR5	YMR065W	MMS22	Q06164	1454 aa		3.04	□□□□□ -1.92
KAR5	YMR065W	YGR266W	P53326	701 aa		3.03	□□□□□ -1.92
KAR5	YMR065W	YOR292C	Q08743	309 aa		3.03	□□□□□ -1.92
KAR5	YMR065W	RFM1	Q12192	310 aa		3.03	□□□□□ -1.92
KAR5	YMR065W	ERP3	Q12403	225 aa		3.03	□□□□□ -1.92
KAR5	YMR065W	PRP46	Q12417	451 aa	Predicted RBP	3.03	□□□□□ -1.92
KAR5	YMR065W	TOP2	P06786	1428 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
KAR5	YMR065W	NUP170	P38181	1502 aa		3.03	□□□□□ -1.92
KAR5	YMR065W	SLX1	P38324	304 aa		3.03	□□□□□ -1.92
KAR5	YMR065W	IZH4	Q99393	312 aa		3.03	□□□□□ -1.92
KAR5	YMR065W	TDH3	P00359	332 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.02	□□□□□ -1.93	not detected
KAR5	YMR065W	GCD2	P12754	651 aa	Predicted RBP	3.02	□□□□□ -1.93
KAR5	YMR065W	MSS116	P15424	664 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
KAR5	YMR065W	SAR1	P20606	190 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
KAR5	YMR065W	MCH2	P36032	473 aa		3.02	□□□□□ -1.93
KAR5	YMR065W	RIB4	P50861	169 aa	Predicted RBP	3.02	□□□□□ -1.93
KAR5	YMR065W	VOA1	P53262	265 aa		3.02	□□□□□ -1.93
KAR5	YMR065W	DCP1	Q12517	231 aa	Predicted RBP	3.02	□□□□□ -1.93
KAR5	YMR065W	LAG2	Q92325	660 aa		3.02	□□□□□ -1.93
KAR5	YMR065W	CAR2	P07991	424 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
KAR5	YMR065W	HPR1	P17629	752 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
KAR5	YMR065W	IFM1	P25038	676 aa		3.01	□□□□□ -1.93
KAR5	YMR065W	RPL16B	P26785	198 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
KAR5	YMR065W	EDC2	P40023	145 aa	Predicted RBP	3.01	□□□□□ -1.93
KAR5	YMR065W	YLR446W	Q06204	433 aa		3.01	□□□□□ -1.93
KAR5	YMR065W	MRPL6	P32904	214 aa		3	□□□□□ -1.93
KAR5	YMR065W	CSE1	P33307	960 aa		3	□□□□□ -1.93
KAR5	YMR065W	MNN9	P39107	395 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
KAR5	YMR065W	PES4	P39684	611 aa		3	□□□□□ -1.93
KAR5	YMR065W	LOH1	P47055	219 aa		3	□□□□□ -1.93
KAR5	YMR065W	SWC4	P53201	476 aa		3	□□□□□ -1.93
KAR5	YMR065W	DBP6	P53734	629 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
KAR5	YMR065W	YMR111C	Q04461	462 aa	Predicted RBP	3	□□□□□ -1.93
KAR5	YMR065W	SEC13	Q04491	297 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
KAR5	YMR065W	ARC18	Q05933	178 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93

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