RNA–Protein interactions for RNA: YHR119W

SET1, Transcript of Histone methyltransferase, subunit of the COMPASS (Set1C) complex, yeast

Gene SET1, Length 3,243 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SET1	YHR119W	BDH2	P39713	417 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SET1	YHR119W	YJR012C	P47087	207 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SET1	YHR119W	UBC11	P52492	156 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SET1	YHR119W	MPA43	P53583	542 aa	Predicted RBP	3.02	□□□□□ -1.93
SET1	YHR119W	YNL095C	P53932	642 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SET1	YHR119W	YOR283W	Q12040	230 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
SET1	YHR119W	ELG1	Q12050	791 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SET1	YHR119W	NCA2	Q12374	616 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SET1	YHR119W	AI5_ALPHA	Q9ZZX1	630 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SET1	YHR119W	CBP6	P07253	162 aa	Predicted RBP	3.02	□□□□□ -1.93
SET1	YHR119W	SCL1	P21243	252 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
SET1	YHR119W	YCR102C	P25608	368 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SET1	YHR119W	MGT1	P26188	188 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SET1	YHR119W	MUD1	P32605	298 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
SET1	YHR119W	MRPL6	P32904	214 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SET1	YHR119W	SKN1	P33336	771 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SET1	YHR119W	MRPL24	P36525	258 aa	Predicted RBP	3.02	□□□□□ -1.93
SET1	YHR119W	PRE3	P38624	215 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SET1	YHR119W	YHR112C	P38716	378 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SET1	YHR119W	RFC2	P40348	353 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SET1	YHR119W	MAM33	P40513	266 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SET1	YHR119W	JAC1	P53193	184 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SET1	YHR119W	IMP4	P53941	290 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
SET1	YHR119W	ASI3	P53983	676 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SET1	YHR119W	PFA5	Q03289	374 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SET1	YHR119W	YDR476C	Q03362	224 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SET1	YHR119W	SUE1	Q06524	206 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SET1	YHR119W	RNH203	Q12338	110 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SET1	YHR119W	RIB2	Q12362	591 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
SET1	YHR119W	YPR015C	Q12531	247 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SET1	YHR119W	TCB3	Q03640	1545 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
SET1	YHR119W	GAL10	P04397	699 aa		3.01	□□□□□ -1.93
SET1	YHR119W	IMA3	P0CW40	589 aa		3.01	□□□□□ -1.93
SET1	YHR119W	IMA4	P0CW41	589 aa		3.01	□□□□□ -1.93
SET1	YHR119W	YPK1	P12688	680 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
SET1	YHR119W	TRX3	P25372	127 aa		3.01	□□□□□ -1.93
SET1	YHR119W	TAH1	P25638	111 aa	Predicted RBP	3.01	□□□□□ -1.93
SET1	YHR119W	ZRT1	P32804	376 aa		3.01	□□□□□ -1.93
SET1	YHR119W	TRM7	P38238	310 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
SET1	YHR119W	YJR011C	P47086	261 aa	Predicted RBP	3.01	□□□□□ -1.93
SET1	YHR119W	YJR079W	P47126	109 aa		3.01	□□□□□ -1.93
SET1	YHR119W	POP6	P53218	158 aa		3.01	□□□□□ -1.93
SET1	YHR119W	MKC7	P53379	596 aa		3.01	□□□□□ -1.93
SET1	YHR119W	YMR187C	Q03236	431 aa		3.01	□□□□□ -1.93
SET1	YHR119W	MSS11	Q03825	758 aa		3.01	□□□□□ -1.93
SET1	YHR119W	RAV2	Q03956	351 aa		3.01	□□□□□ -1.93
SET1	YHR119W	CAC2	Q04199	468 aa		3.01	□□□□□ -1.93
SET1	YHR119W	YDR124W	Q04608	324 aa		3.01	□□□□□ -1.93
SET1	YHR119W	ARR3	Q06598	404 aa		3.01	□□□□□ -1.93
SET1	YHR119W	IMA2	Q08295	589 aa		3.01	□□□□□ -1.93
SET1	YHR119W	SNU23	Q12368	194 aa	Predicted RBP	3.01	□□□□□ -1.93
SET1	YHR119W	PEP4	P07267	405 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
SET1	YHR119W	DDI2	P0CH63	225 aa		3.01	□□□□□ -1.93
SET1	YHR119W	DDI3	P0CH64	225 aa		3.01	□□□□□ -1.93
SET1	YHR119W	HEM15	P16622	393 aa		3.01	□□□□□ -1.93
SET1	YHR119W	MCK1	P21965	375 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
SET1	YHR119W	ACB1	P31787	87 aa		3.01	□□□□□ -1.93
SET1	YHR119W	APL3	P38065	1025 aa		3.01	□□□□□ -1.93
SET1	YHR119W	DBP8	P38719	431 aa		3.01	□□□□□ -1.93
SET1	YHR119W	KRE29	P40026	464 aa		3.01	□□□□□ -1.93
SET1	YHR119W	GVP36	P40531	326 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
SET1	YHR119W	YFR020W	P43600	232 aa		3.01	□□□□□ -1.93
SET1	YHR119W	CHA4	P43634	648 aa		3.01	□□□□□ -1.93
SET1	YHR119W	KTR5	P53966	522 aa	Predicted RBP	3.01	□□□□□ -1.93
SET1	YHR119W	SNU56	Q03782	492 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
SET1	YHR119W	GAS2	Q06135	555 aa		3.01	□□□□□ -1.93
SET1	YHR119W	MHR1	Q06630	226 aa		3.01	□□□□□ -1.93
SET1	YHR119W	YDL057W	Q07379	328 aa		3.01	□□□□□ -1.93
SET1	YHR119W	RCL1	Q08096	367 aa	Predicted RBP	3.01	□□□□□ -1.93
SET1	YHR119W	SGT1	Q08446	395 aa		3.01	□□□□□ -1.93
SET1	YHR119W	PST2	Q12335	198 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
SET1	YHR119W	GEP5	Q12393	293 aa		3.01	□□□□□ -1.93
SET1	YHR119W	PEX11	Q12462	236 aa		3.01	□□□□□ -1.93
SET1	YHR119W	EFG1	Q3E705	233 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
SET1	YHR119W	RIB3	Q99258	208 aa		3.01	□□□□□ -1.93
SET1	YHR119W	CMD1	P06787	147 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
SET1	YHR119W	ADE5,7	P07244	802 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
SET1	YHR119W	ERS1	P17261	260 aa		3	□□□□□ -1.93
SET1	YHR119W	SAM2	P19358	384 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
SET1	YHR119W	CNB1	P25296	175 aa		3	□□□□□ -1.93
SET1	YHR119W	CDC20	P26309	610 aa		3	□□□□□ -1.93
SET1	YHR119W	MRPS5	P33759	307 aa		3	□□□□□ -1.93
SET1	YHR119W	CBP4	P37267	147 aa		3	□□□□□ -1.93
SET1	YHR119W	LSM12	P38828	187 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
SET1	YHR119W	SER33	P40510	469 aa		3	□□□□□ -1.93
SET1	YHR119W	MRPL22	P53881	309 aa		3	□□□□□ -1.93
SET1	YHR119W	SLG1	P54867	378 aa		3	□□□□□ -1.93
SET1	YHR119W	YPL077C	Q02831	240 aa		3	□□□□□ -1.93
SET1	YHR119W	NUP53	Q03790	475 aa		3	□□□□□ -1.93
SET1	YHR119W	YMR315W	Q04869	349 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
SET1	YHR119W	FAR10	Q06001	478 aa		3	□□□□□ -1.93
SET1	YHR119W	MRX9	Q07349	420 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
SET1	YHR119W	HRD1	Q08109	551 aa		3	□□□□□ -1.93
SET1	YHR119W	ZEO1	Q08245	113 aa		3	□□□□□ -1.93
SET1	YHR119W	THI72	Q08579	599 aa		3	□□□□□ -1.93
SET1	YHR119W	TAF10	Q12030	206 aa		3	□□□□□ -1.93
SET1	YHR119W	DRS2	P39524	1355 aa		3	□□□□□ -1.93
SET1	YHR119W	PDR18	P53756	1333 aa		3	□□□□□ -1.93
SET1	YHR119W	MRPS28	P21771	286 aa		3	□□□□□ -1.93
SET1	YHR119W	PPH21	P23594	369 aa		3	□□□□□ -1.93

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