RNA–Protein interactions for RNA: YGL158W

RCK1, Transcript of Protein kinase involved in the response to oxidative stress, yeast

Gene RCK1, Length 1,539 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RCK1	YGL158W	ASP3-1	P0CZ17	362 aa		5	□□□□□ -1.61
RCK1	YGL158W	GCN3	P14741	305 aa		5	□□□□□ -1.61
RCK1	YGL158W	GPI12	P23797	304 aa		5	□□□□□ -1.61
RCK1	YGL158W	CSM1	P25651	190 aa		5	□□□□□ -1.61
RCK1	YGL158W	RPS5	P26783	225 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
RCK1	YGL158W	MRP4	P32902	394 aa		5	□□□□□ -1.61
RCK1	YGL158W	TIR2	P33890	251 aa		5	□□□□□ -1.61
RCK1	YGL158W	ETR1	P38071	380 aa		5	□□□□□ -1.61
RCK1	YGL158W	MTC4	P38335	694 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
RCK1	YGL158W	RBG1	P39729	369 aa		5	□□□□□ -1.61
RCK1	YGL158W	DSE1	P40077	573 aa		5	□□□□□ -1.61
RCK1	YGL158W	FMP32	P43557	207 aa		5	□□□□□ -1.61
RCK1	YGL158W	LSG1	P53145	640 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
RCK1	YGL158W	RCF2	P53721	224 aa		5	□□□□□ -1.61
RCK1	YGL158W	TRM112	P53738	135 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
RCK1	YGL158W	HER2	Q03557	464 aa		5	□□□□□ -1.61
RCK1	YGL158W	PLP1	Q04004	230 aa		5	□□□□□ -1.61
RCK1	YGL158W	RRN11	Q04712	507 aa		5	□□□□□ -1.61
RCK1	YGL158W	YLR173W	Q06247	608 aa		5	□□□□□ -1.61
RCK1	YGL158W	GAT3	Q07928	141 aa		5	□□□□□ -1.61
RCK1	YGL158W	RRP12	Q12754	1228 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
RCK1	YGL158W	RAD10	P06838	210 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RCK1	YGL158W	NTG1	P31378	399 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RCK1	YGL158W	CSE1	P33307	960 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RCK1	YGL158W	PMU1	P36069	295 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RCK1	YGL158W	YHK8	P38776	514 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RCK1	YGL158W	YHR182W	P38870	785 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RCK1	YGL158W	YIL152W	P40455	235 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RCK1	YGL158W	RTT101	P47050	842 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RCK1	YGL158W	COS1	P53822	381 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RCK1	YGL158W	TLG1	Q03322	224 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RCK1	YGL158W	RTT103	Q05543	409 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RCK1	YGL158W	YLR281C	Q05863	155 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RCK1	YGL158W	CDD1	Q06549	142 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RCK1	YGL158W	RPN8	Q08723	338 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RCK1	YGL158W	SAM4	Q08985	325 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RCK1	YGL158W	DAP1	Q12091	152 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RCK1	YGL158W	ADF1	Q2V2Q1	113 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RCK1	YGL158W	DET1	Q99288	334 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RCK1	YGL158W	FKS1	P38631	1876 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RCK1	YGL158W	RAD7	P06779	565 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RCK1	YGL158W	MRS3	P10566	314 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RCK1	YGL158W	ITR2	P30606	609 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RCK1	YGL158W	RCN1	P36054	211 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RCK1	YGL158W	MIX23	P38162	196 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RCK1	YGL158W	GOS1	P38736	223 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RCK1	YGL158W	JLP2	P40206	208 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RCK1	YGL158W	OST1	P41543	476 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RCK1	YGL158W	KEG1	P43614	200 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RCK1	YGL158W	TVP15	Q03860	143 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RCK1	YGL158W	YET3	Q07451	203 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RCK1	YGL158W	SLF1	Q12034	447 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RCK1	YGL158W	YDR018C	Q12185	396 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RCK1	YGL158W	MED4	Q12343	284 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RCK1	YGL158W	RPL20A	P0CX23	172 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RCK1	YGL158W	RPL20B	P0CX24	172 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RCK1	YGL158W	PUT3	P25502	979 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RCK1	YGL158W	MKK1	P32490	508 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RCK1	YGL158W	HMT1	P38074	348 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RCK1	YGL158W	PDX3	P38075	228 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RCK1	YGL158W	YBR137W	P38276	179 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RCK1	YGL158W	YJR054W	P47114	497 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RCK1	YGL158W	HXT11	P54862	567 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RCK1	YGL158W	SWP1	Q02795	286 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RCK1	YGL158W	GPI17	Q04080	534 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RCK1	YGL158W	SPC2	Q04969	178 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RCK1	YGL158W	YMR226C	Q05016	267 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RCK1	YGL158W	YPR117W	Q06116	2489 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RCK1	YGL158W	SIA1	Q12212	622 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RCK1	YGL158W	AYT1	Q12226	474 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RCK1	YGL158W	RBD2	Q12270	262 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RCK1	YGL158W	GIS3	Q12418	502 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RCK1	YGL158W	REP1	P03871	373 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RCK1	YGL158W	VPS3	P23643	1011 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RCK1	YGL158W	DAL2	P25335	343 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RCK1	YGL158W	ACB1	P31787	87 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RCK1	YGL158W	ARC40	P38328	384 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RCK1	YGL158W	IBD2	P53892	351 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RCK1	YGL158W	YML108W	Q03759	105 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RCK1	YGL158W	BOP2	Q06150	570 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RCK1	YGL158W	UIP4	Q08926	304 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RCK1	YGL158W	PRP46	Q12417	451 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RCK1	YGL158W	MOT1	P32333	1867 aa		4.96	□□□□□ -1.61
RCK1	YGL158W	KSS1	P14681	368 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RCK1	YGL158W	CDC42	P19073	191 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RCK1	YGL158W	DCC1	P25559	380 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RCK1	YGL158W	ZIP1	P31111	875 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RCK1	YGL158W	ATS1	P31386	333 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RCK1	YGL158W	PHA2	P32452	334 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RCK1	YGL158W	CSG2	P35206	410 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RCK1	YGL158W	ASK1	P35734	292 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RCK1	YGL158W	NAT2	P37293	288 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RCK1	YGL158W	MTC6	P38849	526 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RCK1	YGL158W	COX16	P47081	118 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RCK1	YGL158W	TRF5	P48561	642 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RCK1	YGL158W	GOR1	P53839	350 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RCK1	YGL158W	NOP13	P53883	403 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.96	□□□□□ -1.62	not detected
RCK1	YGL158W	SKI8	Q02793	397 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RCK1	YGL158W	ERP1	Q05359	219 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RCK1	YGL158W	SEC10	Q06245	871 aa		4.96	□□□□□ -1.62

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