RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617451.4

PTPRF-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRF, Length 1,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-216ENST00000617451 URGCPQ8TCY9 931 aa27.87■■■□□ 2.05
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PTPRF-216ENST00000617451 XBP1P17861 261 aa27.86■■■□□ 2.05
PTPRF-216ENST00000617451 MTMR3Q13615 1198 aa27.86■■■□□ 2.05
PTPRF-216ENST00000617451 EPHA7Q15375 998 aa27.86■■■□□ 2.05
PTPRF-216ENST00000617451 PTPN14Q15678 1187 aa27.86■■■□□ 2.05
PTPRF-216ENST00000617451 OXER1Q8TDS5 423 aa27.86■■■□□ 2.05
PTPRF-216ENST00000617451 LXNQ9BS40 222 aa27.86■■■□□ 2.05
PTPRF-216ENST00000617451 GJB4Q9NTQ9 266 aa27.86■■■□□ 2.05
PTPRF-216ENST00000617451 STK36Q9NRP7 1315 aa27.86■■■□□ 2.05
PTPRF-216ENST00000617451 DDHD2O94830 711 aa27.85■■■□□ 2.05
PTPRF-216ENST00000617451 BRD1O95696 1058 aa27.85■■■□□ 2.05
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PTPRF-216ENST00000617451 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa27.85■■■□□ 2.05
PTPRF-216ENST00000617451 PPFIBP1Q86W92 1011 aa27.85■■■□□ 2.05
PTPRF-216ENST00000617451 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa27.85■■■□□ 2.05
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PTPRF-216ENST00000617451 RSAD1Q9HA92 442 aa27.85■■■□□ 2.05
PTPRF-216ENST00000617451 RGL1Q9NZL6 768 aa27.85■■■□□ 2.05
PTPRF-216ENST00000617451 STK39Q9UEW8 545 aa27.85■■■□□ 2.05
PTPRF-216ENST00000617451 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa27.85■■■□□ 2.05
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PTPRF-216ENST00000617451 CABP7Q86V35 215 aa27.84■■■□□ 2.05
PTPRF-216ENST00000617451 TCP11Q8WWU5 503 aa27.84■■■□□ 2.05
PTPRF-216ENST00000617451 KANSL3Q9P2N6 904 aa27.84■■■□□ 2.05
PTPRF-216ENST00000617451 USTQ9Y2C2 406 aa27.84■■■□□ 2.05
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PTPRF-216ENST00000617451 MARCH6O60337 910 aa27.83■■■□□ 2.05
PTPRF-216ENST00000617451 PFKFB2O60825 505 aa27.83■■■□□ 2.05
PTPRF-216ENST00000617451 ALDH2P05091 517 aa27.83■■■□□ 2.05
PTPRF-216ENST00000617451 SPIRE1Q08AE8 756 aa27.83■■■□□ 2.05
PTPRF-216ENST00000617451 EMC2Q15006 297 aa27.83■■■□□ 2.05
PTPRF-216ENST00000617451 FERMT3Q86UX7 667 aa27.83■■■□□ 2.05
PTPRF-216ENST00000617451 POTEDQ86YR6 584 aa27.83■■■□□ 2.05
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PTPRF-216ENST00000617451 TMEM175Q9BSA9 504 aa27.83■■■□□ 2.05
PTPRF-216ENST00000617451 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa27.83■■■□□ 2.05
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PTPRF-216ENST00000617451 ZBTB39O15060 712 aa27.82■■■□□ 2.04
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PTPRF-216ENST00000617451 TMC5Q6UXY8 1006 aa27.82■■■□□ 2.04
PTPRF-216ENST00000617451 FEZF2Q8TBJ5 459 aa27.82■■■□□ 2.04
PTPRF-216ENST00000617451 DYDC2Q96IM9 177 aa27.82■■■□□ 2.04
PTPRF-216ENST00000617451 KLHL5Q96PQ7 755 aa27.82■■■□□ 2.04
PTPRF-216ENST00000617451 LIMD1Q9UGP4 676 aa27.82■■■□□ 2.04
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PTPRF-216ENST00000617451 MYO15AQ9UKN7 3530 aa27.81■■■□□ 2.04
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PTPRF-216ENST00000617451 SMOC2Q9H3U7 446 aa27.81■■■□□ 2.04
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PTPRF-216ENST00000617451 POMCP01189 267 aa27.8■■■□□ 2.04
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PTPRF-216ENST00000617451 CLCN4P51793 760 aa27.8■■■□□ 2.04
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PTPRF-216ENST00000617451 BAG4O95429 457 aaKnown RBP27.79■■■□□ 2.04
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PTPRF-216ENST00000617451 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP27.79■■■□□ 2.044e-7■□□□□ 9
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PTPRF-216ENST00000617451 ITGA4P13612 1032 aa27.78■■■□□ 2.04
PTPRF-216ENST00000617451 PTENP60484 403 aa27.78■■■□□ 2.04
PTPRF-216ENST00000617451 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP27.78■■■□□ 2.04
PTPRF-216ENST00000617451 TPH2Q8IWU9 490 aa27.78■■■□□ 2.04
PTPRF-216ENST00000617451 WASF1Q92558 559 aa27.78■■■□□ 2.04
PTPRF-216ENST00000617451 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa27.78■■■□□ 2.04
PTPRF-216ENST00000617451 FAM86C1Q9NVL1 165 aa27.78■■■□□ 2.04
PTPRF-216ENST00000617451 IPPQ9Y573 584 aa27.78■■■□□ 2.04
PTPRF-216ENST00000617451 CFAP54Q96N23 3096 aa27.77■■■□□ 2.04
PTPRF-216ENST00000617451 INPPL1O15357 1258 aa27.77■■■□□ 2.04
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