RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612161.4

SLC38A1-211, Transcript of solute carrier family 38 member 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SLC38A1, Length 1,607 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A1-211ENST00000612161 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 MFN1Q8IWA4 741 aa6.9□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 ZNF610Q8N9Z0 462 aa6.9□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 BICD2Q8TD16 824 aa6.9□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 ZFPM2Q8WW38 1151 aa6.9□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 COPS5Q92905 334 aa6.9□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 MVB12AQ96EY5 273 aa6.9□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 STK31Q9BXU1 1019 aa6.9□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 TAOK3Q9H2K8 898 aa6.9□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 CD248Q9HCU0 757 aa6.9□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 ZNF304Q9HCX3 659 aa6.9□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 RIC8AQ9NPQ8 531 aa6.9□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 PICK1Q9NRD5 415 aa6.9□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa6.9□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa6.9□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa6.89□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 A0A087WV62 115 aa6.89□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 A0A1W2PRQ8 180 aa6.89□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 K7ENM7 598 aa6.89□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 TBCAO75347 108 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 RPS6KA5O75582 802 aa6.89□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 UBXN7O94888 489 aa6.89□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 MBD4O95243 580 aa6.89□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 TSPY4P0CV99 314 aa6.89□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 TSPY10P0CW01 314 aa6.89□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa6.89□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 SLURP2P0DP57 97 aa6.89□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 ITIH2P19823 946 aa6.89□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 C5AR1P21730 350 aa6.89□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 LSP1P33241 339 aa6.89□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 CCT8P50990 548 aa6.89□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP6.89□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 CACNB3P54284 484 aa6.89□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 CTAG1AP78358 180 aa6.89□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 ZBED6P86452 979 aa6.89□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 ID3Q02535 119 aa6.89□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 DDR1Q08345 913 aa6.89□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 SCRN1Q12765 414 aa6.89□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 MPP3Q13368 585 aa6.89□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 PDCD1Q15116 288 aa6.89□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 RCN1Q15293 331 aa6.89□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP6.89□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 WDR45BQ5MNZ6 344 aa6.89□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 RETSATQ6NUM9 610 aa6.89□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 ARMC9Q7Z3E5 817 aa6.89□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 TMEM110Q86TL2 294 aa6.89□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 PRR18Q8N4B5 295 aa6.89□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 KCT2Q8NC54 265 aa6.89□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 LZICQ8WZA0 190 aa6.89□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 DCAF5Q96JK2 942 aa6.89□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 ALG1Q9BT22 464 aa6.89□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 B3GNT5Q9BYG0 378 aa6.89□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 TSGA10Q9BZW7 698 aa6.89□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa6.89□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 BRD8Q9H0E9 1235 aa6.89□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 NUP62CLQ9H1M0 184 aa6.89□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 BATF3Q9NR55 127 aa6.89□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 MYO6Q9UM54 1294 aa6.89□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 SPO11Q9Y5K1 396 aa6.89□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 ABCA9Q8IUA7 1624 aa6.89□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 GOLGA3Q08378 1498 aa6.88□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 ROCK1Q13464 1354 aa6.88□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 ARNTLO00327 626 aa6.88□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 MSCO60682 206 aa6.88□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 PROCP04070 461 aa6.88□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 ABCB4P21439 1286 aa6.88□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 ITGA6P23229 1130 aa6.88□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 TNFSF4P23510 183 aa6.88□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 RPL13P26373 211 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 TSPAN7P41732 249 aa6.88□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 PIK3CBP42338 1070 aa6.88□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 MTNR1BP49286 362 aa6.88□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 CASP5P51878 434 aa6.88□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 HDAC4P56524 1084 aa6.88□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 SLC8A3P57103 927 aa6.88□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 CORO7P57737 925 aa6.88□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 LAMB3Q13751 1172 aa6.88□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 MYBPC3Q14896 1274 aa6.88□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 SLMAPQ14BN4 828 aa6.88□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 RNF220Q5VTB9 566 aa6.88□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 TSHZ3Q63HK5 1081 aa6.88□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 RCSD1Q6JBY9 416 aa6.88□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 CLEC17AQ6ZS10 378 aa6.88□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 USP45Q70EL2 814 aa6.88□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 ARL10Q8N8L6 244 aa6.88□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 C2orf69Q8N8R5 385 aa6.88□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP6.88□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 USP6NLQ92738 828 aa6.88□□□□□ -1.31
SLC38A1-211ENST00000612161 KIAA1191Q96A73 305 aa6.88□□□□□ -1.31
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