RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000609232.5

CTCFL-222, Transcript of CCCTC-binding factor like, human

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTCFL, Length 3,668 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTCFL-222	ENST00000609232	SPATC1L	Q9H0A9	340 aa		10.65	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	ACBD3	Q9H3P7	528 aa		10.65	□□□□□ -0.7
CTCFL-222	ENST00000609232	MAGEA9	P43362	315 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	KCTD2	Q14681	263 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	STXBP4	Q6ZWJ1	553 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	REXO1L1P	Q8IX06	675 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	CTTNBP2NL	Q9P2B4	639 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	FAN1	Q9Y2M0	1017 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	SSC5D	A1L4H1	1573 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	SPDYE5	A6NIY4	337 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232		H3BQF6	201 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	SLC26A4	O43511	780 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	STX10	O60499	249 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	CCDC172	P0C7W6	258 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	HPD	P32754	393 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	KRT76	Q01546	638 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	PLCB3	Q01970	1234 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	CBWD2	Q8IUF1	395 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	COG1	Q8WTW3	980 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	RRAGC	Q9HB90	399 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	FBXO40	Q9UH90	709 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	CAPN6	Q9Y6Q1	641 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	GOLGA6L9	A6NEM1	432 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	CXCL11	O14625	94 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	FANCG	O15287	622 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	ZEB2	O60315	1214 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	BCR	P11274	1271 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	GAP43	P17677	238 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	YWHAB	P31946	246 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	AMHR2	Q16671	573 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	LBX2	Q6XYB7	198 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	FASTKD5	Q7L8L6	764 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	DDX42	Q86XP3	938 aa	Known RBP eCLIP	10.64	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	RHPN2	Q8IUC4	686 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	EGFL6	Q8IUX8	553 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	EXOC8	Q8IYI6	725 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	CHST13	Q8NET6	341 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	REPS2	Q8NFH8	660 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	LRRN4	Q8WUT4	740 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	NCAPG	Q9BPX3	1015 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	FUT8	Q9BYC5	575 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	YY1AP1	Q9H869	796 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	KCND1	Q9NSA2	647 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	CALU	O43852	315 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	N4BP1	O75113	896 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	MAN2A1	Q16706	1144 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	KNOP1	Q1ED39	458 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	SH3D19	Q5HYK7	790 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	DPP9	Q86TI2	863 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	TMTC1	Q8IUR5	882 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	MMS19	Q96T76	1030 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	HEMGN	Q9BXL5	484 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	LARS	Q9P2J5	1176 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	PCDHA10	Q9Y5I2	948 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	RPTOR	Q8N122	1335 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	HTT	P42858	3142 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	RPL13	P26373	211 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	ATP1A2	P50993	1020 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	JAK3	P52333	1124 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	NIPA1	Q7RTP0	329 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	MAATS1	Q7Z4T9	603 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	NEK9	Q8TD19	979 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	L3MBTL3	Q96JM7	780 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	CDHR1	Q96JP9	859 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	RUFY1	Q96T51	708 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	MOV10L1	Q9BXT6	1211 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	JPH1	Q9HDC5	661 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	KMT5A	Q9NQR1	393 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232		A0A087X0T9	212 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	CCDC151	A5D8V7	595 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	LRRC10B	A6NIK2	292 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	FAM228B	P0C875	321 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	PSMC5	P62195	406 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	SNAPC2	Q13487	334 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	BRD3	Q15059	726 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	AADACL2	Q6P093	401 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	FOXR1	Q6PIV2	292 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	TRIM65	Q6PJ69	517 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	SAMD3	Q8N6K7	520 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	HDAC7	Q8WUI4	952 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	GBP3	Q9H0R5	595 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	ATAD5	Q96QE3	1844 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	DHX15	O43143	795 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	TNFAIP3	P21580	790 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	GUCY2C	P25092	1073 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	PAFAH1B1	P43034	410 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	MNAT1	P51948	309 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	TBX2	Q13207	712 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	PPIL2	Q13356	520 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	TRIM14	Q14142	442 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	RETREG2	Q8NC44	543 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	KRT12	Q99456	494 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	PDGFC	Q9NRA1	345 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	SLC9A2	Q9UBY0	812 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	MYO6	Q9UM54	1294 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	GOLGA8S	H3BPF8	625 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	TACC1	O75410	805 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	PALM	O75781	387 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CTCFL-222	ENST00000609232	CCNE2	O96020	404 aa		10.62	□□□□□ -0.71

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