RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607882.5

RABGEF1-209, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, human

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 2,654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RABGEF1-209	ENST00000607882	DENND3	A2RUS2	1198 aa		13.83	□□□□□ -0.2
RABGEF1-209	ENST00000607882	RARRES1	P49788	294 aa		13.83	□□□□□ -0.2
RABGEF1-209	ENST00000607882	FAM26D	Q5JW98	314 aa		13.83	□□□□□ -0.2
RABGEF1-209	ENST00000607882	ATL3	Q6DD88	541 aa		13.83	□□□□□ -0.2
RABGEF1-209	ENST00000607882	DTHD1	Q6ZMT9	781 aa		13.83	□□□□□ -0.2
RABGEF1-209	ENST00000607882	EXOC8	Q8IYI6	725 aa		13.83	□□□□□ -0.2
RABGEF1-209	ENST00000607882	ASAP3	Q8TDY4	903 aa		13.83	□□□□□ -0.2
RABGEF1-209	ENST00000607882	LPP	Q93052	612 aa		13.83	□□□□□ -0.2
RABGEF1-209	ENST00000607882	ABHD14A-ACY1	A0A1B0GW23	586 aa		13.82	□□□□□ -0.2
RABGEF1-209	ENST00000607882	MAF	O75444	373 aa	Predicted RBP	13.82	□□□□□ -0.2
RABGEF1-209	ENST00000607882	ZSCAN20	P17040	1043 aa	Predicted RBP	13.82	□□□□□ -0.2
RABGEF1-209	ENST00000607882	NDUFA8	P51970	172 aa		13.82	□□□□□ -0.2
RABGEF1-209	ENST00000607882	TAP1	Q03518	808 aa		13.82	□□□□□ -0.2
RABGEF1-209	ENST00000607882	RILPL1	Q5EBL4	403 aa		13.82	□□□□□ -0.2
RABGEF1-209	ENST00000607882	C4orf19	Q8IY42	314 aa		13.82	□□□□□ -0.2
RABGEF1-209	ENST00000607882	FMR1NB	Q8N0W7	255 aa	Predicted RBP	13.82	□□□□□ -0.2
RABGEF1-209	ENST00000607882	LINC01465	Q8N7H1	131 aa		13.82	□□□□□ -0.2
RABGEF1-209	ENST00000607882	NPHP3-ACAD11	A0A0J9YXS1	232 aa		13.82	□□□□□ -0.2
RABGEF1-209	ENST00000607882	EIF4B	P23588	611 aa	Known RBP	13.82	□□□□□ -0.2
RABGEF1-209	ENST00000607882	LAMTOR4	Q0VGL1	99 aa		13.82	□□□□□ -0.2
RABGEF1-209	ENST00000607882	STK38	Q15208	465 aa		13.82	□□□□□ -0.2
RABGEF1-209	ENST00000607882	CEP135	Q66GS9	1140 aa		13.82	□□□□□ -0.2
RABGEF1-209	ENST00000607882	RDM1	Q8NG50	284 aa		13.82	□□□□□ -0.2
RABGEF1-209	ENST00000607882	LRRC15	Q8TF66	581 aa		13.82	□□□□□ -0.2
RABGEF1-209	ENST00000607882	MMTAG2	Q9BU76	263 aa	Known RBP	13.82	□□□□□ -0.2
RABGEF1-209	ENST00000607882	TRMT1	Q9NXH9	659 aa	Known RBP	13.82	□□□□□ -0.2
RABGEF1-209	ENST00000607882	MICAL3	Q7RTP6	2002 aa		13.82	□□□□□ -0.2
RABGEF1-209	ENST00000607882	MAGEB2	O15479	319 aa		13.81	□□□□□ -0.2
RABGEF1-209	ENST00000607882	AMH	P03971	560 aa		13.81	□□□□□ -0.2
RABGEF1-209	ENST00000607882	FOSL2	P15408	326 aa		13.81	□□□□□ -0.2
RABGEF1-209	ENST00000607882	USP38	Q8NB14	1042 aa		13.81	□□□□□ -0.2
RABGEF1-209	ENST00000607882	CPB2	Q96IY4	423 aa		13.81	□□□□□ -0.2
RABGEF1-209	ENST00000607882	EPSTI1	Q96J88	318 aa		13.81	□□□□□ -0.2
RABGEF1-209	ENST00000607882	PAXBP1	Q9Y5B6	917 aa		13.81	□□□□□ -0.2
RABGEF1-209	ENST00000607882	COL4A3BP	Q9Y5P4	624 aa		13.81	□□□□□ -0.2
RABGEF1-209	ENST00000607882	COL1A2	P08123	1366 aa		13.81	□□□□□ -0.2
RABGEF1-209	ENST00000607882	TTLL13P	A6NNM8	815 aa		13.81	□□□□□ -0.2
RABGEF1-209	ENST00000607882	TRAPPC10	P48553	1259 aa		13.81	□□□□□ -0.2
RABGEF1-209	ENST00000607882	DNM2	P50570	870 aa		13.81	□□□□□ -0.2
RABGEF1-209	ENST00000607882	CCZ1B	P86790	482 aa		13.81	□□□□□ -0.2
RABGEF1-209	ENST00000607882	CCZ1	P86791	482 aa	Predicted RBP	13.81	□□□□□ -0.2
RABGEF1-209	ENST00000607882	DPCR1	Q3MIW9	517 aa		13.81	□□□□□ -0.2
RABGEF1-209	ENST00000607882	ADAL	Q6DHV7	355 aa		13.81	□□□□□ -0.2
RABGEF1-209	ENST00000607882	LINC00301	Q8NCQ3	95 aa		13.81	□□□□□ -0.2
RABGEF1-209	ENST00000607882	RASSF8	Q8NHQ8	419 aa		13.81	□□□□□ -0.2
RABGEF1-209	ENST00000607882	PIK3R5	Q8WYR1	880 aa		13.81	□□□□□ -0.2
RABGEF1-209	ENST00000607882	BSND	Q8WZ55	320 aa		13.81	□□□□□ -0.2
RABGEF1-209	ENST00000607882	TOP1MT	Q969P6	601 aa		13.81	□□□□□ -0.2
RABGEF1-209	ENST00000607882	POLR3F	Q9H1D9	316 aa	Predicted RBP	13.81	□□□□□ -0.2
RABGEF1-209	ENST00000607882	DHX33	Q9H6R0	707 aa	Known RBP	13.81	□□□□□ -0.2
RABGEF1-209	ENST00000607882	IFT122	Q9HBG6	1241 aa		13.81	□□□□□ -0.2
RABGEF1-209	ENST00000607882	PIN4	Q9Y237	131 aa	Known RBP	13.81	□□□□□ -0.2
RABGEF1-209	ENST00000607882	HES2	Q9Y543	173 aa		13.81	□□□□□ -0.2
RABGEF1-209	ENST00000607882	INO80B-WBP1	J3KQ70	363 aa		13.8	□□□□□ -0.2
RABGEF1-209	ENST00000607882	B4GALT5	O43286	388 aa		13.8	□□□□□ -0.2
RABGEF1-209	ENST00000607882	CRYBB1	P53674	252 aa	Predicted RBP	13.8	□□□□□ -0.2
RABGEF1-209	ENST00000607882	ATP2C1	P98194	919 aa	Predicted RBP	13.8	□□□□□ -0.2
RABGEF1-209	ENST00000607882	DMTN	Q08495	405 aa		13.8	□□□□□ -0.2
RABGEF1-209	ENST00000607882	KARS	Q15046	597 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
RABGEF1-209	ENST00000607882	OTUD6A	Q7L8S5	288 aa		13.8	□□□□□ -0.2
RABGEF1-209	ENST00000607882	SLC9A7	Q96T83	725 aa		13.8	□□□□□ -0.2
RABGEF1-209	ENST00000607882	MTR	Q99707	1265 aa		13.8	□□□□□ -0.2
RABGEF1-209	ENST00000607882	INO80B	Q9C086	356 aa	Predicted RBP	13.8	□□□□□ -0.2
RABGEF1-209	ENST00000607882	ERVK-5	Q9HDB9	667 aa		13.8	□□□□□ -0.2
RABGEF1-209	ENST00000607882	BDP1	A6H8Y1	2624 aa		13.8	□□□□□ -0.2
RABGEF1-209	ENST00000607882	TTC3	P53804	2025 aa		13.8	□□□□□ -0.2
RABGEF1-209	ENST00000607882	LINC01553	A4QN01	128 aa		13.8	□□□□□ -0.2
RABGEF1-209	ENST00000607882	LRRIQ4	A6NIV6	560 aa		13.8	□□□□□ -0.2
RABGEF1-209	ENST00000607882	BIN1	O00499	593 aa		13.8	□□□□□ -0.2
RABGEF1-209	ENST00000607882	BAIAP3	O94812	1187 aa		13.8	□□□□□ -0.2
RABGEF1-209	ENST00000607882	DARS	P14868	501 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
RABGEF1-209	ENST00000607882	AFF1	P51825	1210 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
RABGEF1-209	ENST00000607882	PTPN14	Q15678	1187 aa		13.8	□□□□□ -0.2
RABGEF1-209	ENST00000607882	PADI6	Q6TGC4	694 aa		13.8	□□□□□ -0.2
RABGEF1-209	ENST00000607882	CATSPER4	Q7RTX7	472 aa		13.8	□□□□□ -0.2
RABGEF1-209	ENST00000607882	RPAIN	Q86UA6	219 aa		13.8	□□□□□ -0.2
RABGEF1-209	ENST00000607882	APOL6	Q9BWW8	343 aa		13.8	□□□□□ -0.2
RABGEF1-209	ENST00000607882	NAT10	Q9H0A0	1025 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
RABGEF1-209	ENST00000607882	IGKV6-21	A0A0C4DH24	114 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RABGEF1-209	ENST00000607882	ARHGEF35	A5YM69	484 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RABGEF1-209	ENST00000607882	NME8	Q8N427	588 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RABGEF1-209	ENST00000607882	IGSF22	Q8N9C0	903 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RABGEF1-209	ENST00000607882	PSPC1	Q8WXF1	523 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
RABGEF1-209	ENST00000607882	RAD9A	Q99638	391 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RABGEF1-209	ENST00000607882	RUSC1	Q9BVN2	902 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RABGEF1-209	ENST00000607882	RPA1	P27694	616 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RABGEF1-209	ENST00000607882	CAPS	Q13938	189 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RABGEF1-209	ENST00000607882	RAB30	Q15771	203 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RABGEF1-209	ENST00000607882	KRT79	Q5XKE5	535 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RABGEF1-209	ENST00000607882	TWF2	Q6IBS0	349 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
RABGEF1-209	ENST00000607882	PDILT	Q8N807	584 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RABGEF1-209	ENST00000607882	ERMN	Q8TAM6	284 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RABGEF1-209	ENST00000607882	INPP5F	Q9Y2H2	1132 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RABGEF1-209	ENST00000607882	PCDHA11	Q9Y5I1	949 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RABGEF1-209	ENST00000607882	SPTLC2	O15270	562 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RABGEF1-209	ENST00000607882	GLRA2	P23416	452 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RABGEF1-209	ENST00000607882	FXR2	P51116	673 aa	Known RBP eCLIP	13.78	□□□□□ -0.2
RABGEF1-209	ENST00000607882	BTG3	Q14201	252 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
RABGEF1-209	ENST00000607882	NYAP1	Q6ZVC0	841 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RABGEF1-209	ENST00000607882	STAM	Q92783	540 aa		13.78	□□□□□ -0.2

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