RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592483.5

CAPNS1-214, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 431 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-214ENST00000592483 STAT6P42226 847 aa26.2■■□□□ 1.78
CAPNS1-214ENST00000592483 SYKP43405 635 aa26.2■■□□□ 1.78
CAPNS1-214ENST00000592483 FAM160A1Q05DH4 1040 aa26.2■■□□□ 1.78
CAPNS1-214ENST00000592483 POTEGQ6S5H5 508 aa26.2■■□□□ 1.78
CAPNS1-214ENST00000592483 FRMD5Q7Z6J6 570 aa26.2■■□□□ 1.78
CAPNS1-214ENST00000592483 CKAP2LQ8IYA6 745 aa26.2■■□□□ 1.78
CAPNS1-214ENST00000592483 TMEM105Q8N8V8 129 aa26.2■■□□□ 1.78
CAPNS1-214ENST00000592483 CCDC34Q96HJ3 373 aa26.2■■□□□ 1.78
CAPNS1-214ENST00000592483 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.78
CAPNS1-214ENST00000592483 WDR81Q562E7 1941 aa26.2■■□□□ 1.78
CAPNS1-214ENST00000592483 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa26.2■■□□□ 1.78
CAPNS1-214ENST00000592483 FSD2A1L4K1 749 aa26.19■■□□□ 1.78
CAPNS1-214ENST00000592483 HBP1O60381 514 aa26.19■■□□□ 1.78
CAPNS1-214ENST00000592483 YWHABP31946 246 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
CAPNS1-214ENST00000592483 NDUFA8P51970 172 aa26.19■■□□□ 1.78
CAPNS1-214ENST00000592483 LPIN1Q14693 890 aa26.19■■□□□ 1.78
CAPNS1-214ENST00000592483 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
CAPNS1-214ENST00000592483 TRIM50Q86XT4 487 aa26.19■■□□□ 1.78
CAPNS1-214ENST00000592483 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP26.19■■□□□ 1.78
CAPNS1-214ENST00000592483 EPG5Q9HCE0 2579 aa26.19■■□□□ 1.78
CAPNS1-214ENST00000592483 COL1A2P08123 1366 aa26.19■■□□□ 1.78
CAPNS1-214ENST00000592483 MBD3O95983 291 aa26.18■■□□□ 1.78
CAPNS1-214ENST00000592483 PLCB4Q15147 1175 aa26.18■■□□□ 1.78
CAPNS1-214ENST00000592483 E2F4Q16254 413 aa26.18■■□□□ 1.78
CAPNS1-214ENST00000592483 ECM1Q16610 540 aa26.18■■□□□ 1.78
CAPNS1-214ENST00000592483 UBALD2Q8IYN6 164 aa26.18■■□□□ 1.78
CAPNS1-214ENST00000592483 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
CAPNS1-214ENST00000592483 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa26.18■■□□□ 1.78
CAPNS1-214ENST00000592483 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP26.17■■□□□ 1.78
CAPNS1-214ENST00000592483 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP26.17■■□□□ 1.78
CAPNS1-214ENST00000592483 ATP4AP20648 1035 aa26.17■■□□□ 1.78
CAPNS1-214ENST00000592483 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP26.17■■□□□ 1.78
CAPNS1-214ENST00000592483 CRIPAKQ8N1N5 446 aa26.17■■□□□ 1.78
CAPNS1-214ENST00000592483 KREMEN2Q8NCW0 462 aa26.17■■□□□ 1.78
CAPNS1-214ENST00000592483 LMBR1Q8WVP7 490 aa26.17■■□□□ 1.78
CAPNS1-214ENST00000592483 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP26.17■■□□□ 1.78
CAPNS1-214ENST00000592483 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP26.17■■□□□ 1.78
CAPNS1-214ENST00000592483 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa26.17■■□□□ 1.78
CAPNS1-214ENST00000592483 PER2O15055 1255 aa26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-214ENST00000592483 STBD1O95210 358 aa26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF484Q5JVG2 852 aa26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-214ENST00000592483 EXOC8Q8IYI6 725 aa26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-214ENST00000592483 PDILTQ8N807 584 aa26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-214ENST00000592483 ENGASEQ8NFI3 743 aa26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-214ENST00000592483 VN1R2Q8NFZ6 395 aa26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-214ENST00000592483 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-214ENST00000592483 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-214ENST00000592483 RAD54LQ92698 747 aa26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-214ENST00000592483 TIGD1Q96MW7 591 aa26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-214ENST00000592483 LRRC27Q9C0I9 530 aa26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-214ENST00000592483 S1PR5Q9H228 398 aa26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-214ENST00000592483 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-214ENST00000592483 A0A087X0B3 334 aa26.15■■□□□ 1.78
CAPNS1-214ENST00000592483 RRN3P2A6NIE6 340 aa26.15■■□□□ 1.78
CAPNS1-214ENST00000592483 MARK3P27448 753 aa26.15■■□□□ 1.78
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CAPNS1-214ENST00000592483 TAF2Q6P1X5 1199 aa26.15■■□□□ 1.78
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CAPNS1-214ENST00000592483 CEP57L1Q8IYX8 460 aa26.15■■□□□ 1.78
CAPNS1-214ENST00000592483 DHX58Q96C10 678 aa26.15■■□□□ 1.78
CAPNS1-214ENST00000592483 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa26.15■■□□□ 1.78
CAPNS1-214ENST00000592483 KCND2Q9NZV8 630 aa26.15■■□□□ 1.78
CAPNS1-214ENST00000592483 SORCS3Q9UPU3 1222 aa26.15■■□□□ 1.78
CAPNS1-214ENST00000592483 KIAA1671Q9BY89 1806 aa26.15■■□□□ 1.78
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CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF202O95125 648 aa26.14■■□□□ 1.78
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CAPNS1-214ENST00000592483 MGAT3Q09327 533 aa26.14■■□□□ 1.78
CAPNS1-214ENST00000592483 DUSP6Q16828 381 aa26.14■■□□□ 1.78
CAPNS1-214ENST00000592483 FBXO47Q5MNV8 452 aa26.14■■□□□ 1.78
CAPNS1-214ENST00000592483 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.78
CAPNS1-214ENST00000592483 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa26.14■■□□□ 1.78
CAPNS1-214ENST00000592483 NPAS4Q8IUM7 802 aa26.14■■□□□ 1.78
CAPNS1-214ENST00000592483 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.78
CAPNS1-214ENST00000592483 PIGOQ8TEQ8 1089 aa26.14■■□□□ 1.78
CAPNS1-214ENST00000592483 PLIN2Q99541 437 aa26.14■■□□□ 1.78
CAPNS1-214ENST00000592483 TNMDQ9H2S6 317 aa26.14■■□□□ 1.78
CAPNS1-214ENST00000592483 ARHGEF35A5YM69 484 aa26.13■■□□□ 1.77
CAPNS1-214ENST00000592483 E9PMD0 336 aa26.13■■□□□ 1.77
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CAPNS1-214ENST00000592483 LIG1P18858 919 aa26.13■■□□□ 1.77
CAPNS1-214ENST00000592483 RARRES1P49788 294 aa26.13■■□□□ 1.77
CAPNS1-214ENST00000592483 AMPD3Q01432 767 aa26.13■■□□□ 1.77
CAPNS1-214ENST00000592483 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
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CAPNS1-214ENST00000592483 KCNK18Q7Z418 384 aa26.13■■□□□ 1.77
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CAPNS1-214ENST00000592483 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
CAPNS1-214ENST00000592483 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
CAPNS1-214ENST00000592483 PANK2Q9BZ23 570 aa26.13■■□□□ 1.77
CAPNS1-214ENST00000592483 BHMT2Q9H2M3 363 aa26.13■■□□□ 1.77
CAPNS1-214ENST00000592483 CYP26B1Q9NR63 512 aa26.13■■□□□ 1.77
CAPNS1-214ENST00000592483 NR2E1Q9Y466 385 aa26.13■■□□□ 1.77
CAPNS1-214ENST00000592483 DNAH14Q0VDD8 3507 aa26.13■■□□□ 1.77
CAPNS1-214ENST00000592483 MYO10Q9HD67 2058 aa26.13■■□□□ 1.77
CAPNS1-214ENST00000592483 NCOR2Q9Y618 2525 aa26.13■■□□□ 1.77
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