RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588374.1

EFTUD2-211, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 524 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-211ENST00000588374 GIT2Q14161 759 aa7.51□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 PPP2R5AQ15172 486 aa7.51□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 SV2BQ7L1I2 683 aa7.51□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 DYMQ7RTS9 669 aa7.51□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 TMEM192Q8IY95 271 aa7.51□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 MYCT1Q8N699 235 aa7.51□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 HELQQ8TDG4 1101 aa7.51□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 KCNG4Q8TDN1 519 aa7.51□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 PPM1EQ8WY54 764 aa7.51□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 STAMQ92783 540 aa7.51□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 SPATA32Q96LK8 384 aa7.51□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 DRC1Q96MC2 740 aa7.51□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 KIFC3Q9BVG8 833 aa7.51□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 C2orf40Q9H1Z8 148 aa7.51□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 FZD8Q9H461 694 aa7.51□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 KMT5AQ9NQR1 393 aa7.51□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa7.51□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 FAM105AQ9NUU6 356 aa7.51□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa7.51□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa7.51□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 EPOPA6NHQ4 379 aa7.5□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 MEIS3P2A8K0S8 358 aa7.5□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF623O75123 536 aa7.5□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 NPTXRO95502 500 aa7.5□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 PRKCBP05771 671 aa7.5□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 SKIP12755 728 aa7.5□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 ITGA4P13612 1032 aa7.5□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 PLS3P13797 630 aa7.5□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 BMPR1AP36894 532 aa7.5□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 STAT6P42226 847 aa7.5□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 SMTNP53814 917 aa7.5□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 NUCB2P80303 420 aa7.5□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 GPM6BQ13491 265 aa7.5□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 MAPK6Q16659 721 aa7.5□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 AMHR2Q16671 573 aa7.5□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 EPC2Q52LR7 807 aa7.5□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 NAALADL2Q58DX5 795 aa7.5□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 UBXN11Q5T124 520 aa7.5□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 NT5DC1Q5TFE4 455 aa7.5□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 NOTUMQ6P988 496 aa7.5□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 SHC4Q6S5L8 630 aa7.5□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa7.5□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 ABI1Q8IZP0 508 aa7.5□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 FBXO22Q8NEZ5 403 aa7.5□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 PGBD4Q96DM1 585 aa7.5□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 CASD1Q96PB1 797 aa7.5□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 REEP2Q9BRK0 252 aa7.5□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 TIPINQ9BVW5 301 aa7.5□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 APOL6Q9BWW8 343 aa7.5□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 NFKBIZQ9BYH8 718 aa7.5□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 GDPD2Q9HCC8 539 aa7.5□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 RNF19AQ9NV58 838 aa7.5□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 FAM13BQ9NYF5 915 aa7.5□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 KCND2Q9NZV8 630 aa7.5□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 STK17AQ9UEE5 414 aa7.5□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa7.5□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa7.5□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 A0A1B0GUA9 196 aa7.49□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 A0A1B0GVL5 298 aa7.49□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 MYMKA6NI61 221 aa7.49□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 ACKR2O00590 384 aa7.49□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 HOXA2O43364 376 aa7.49□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 OFD1O75665 1012 aa7.49□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 FAM13AO94988 1023 aa7.49□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 EDN1P05305 212 aa7.49□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 FOSL2P15408 326 aa7.49□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 AKAP5P24588 427 aa7.49□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 CTNNB1P35222 781 aa7.49□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 RAB27AP51159 221 aa7.49□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 EFNA5P52803 228 aa7.49□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 ADGRE1Q14246 886 aa7.49□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP7.49□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 FAM187BQ17R55 369 aa7.49□□□□□ -1.21
EFTUD2-211ENST00000588374 CLLU1OSQ5K130 101 aa7.49□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.4 ms