RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552346.1

USP15-218, Transcript of ubiquitin specific peptidase 15, humanhuman

TSL 2

Gene USP15, Length 655 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15-218ENST00000552346 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa6.77□□□□□ -1.33
USP15-218ENST00000552346 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
USP15-218ENST00000552346 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
USP15-218ENST00000552346 KLHL33A6NCF5 533 aa6.76□□□□□ -1.33
USP15-218ENST00000552346 GOLGA8AA7E2F4 631 aa6.76□□□□□ -1.33
USP15-218ENST00000552346 GOLGA8BA8MQT2 603 aa6.76□□□□□ -1.33
USP15-218ENST00000552346 MAN2B1O00754 1011 aa6.76□□□□□ -1.33
USP15-218ENST00000552346 KRT37O76014 449 aa6.76□□□□□ -1.33
USP15-218ENST00000552346 CYP17A1P05093 508 aa6.76□□□□□ -1.33
USP15-218ENST00000552346 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
USP15-218ENST00000552346 KRT15P19012 456 aa6.76□□□□□ -1.33
USP15-218ENST00000552346 SCAND1P57086 179 aa6.76□□□□□ -1.33
USP15-218ENST00000552346 PURAQ00577 322 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
USP15-218ENST00000552346 FIGNQ5HY92 759 aa6.76□□□□□ -1.33
USP15-218ENST00000552346 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
USP15-218ENST00000552346 SLC4A10Q6U841 1118 aa6.76□□□□□ -1.33
USP15-218ENST00000552346 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa6.76□□□□□ -1.33
USP15-218ENST00000552346 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
USP15-218ENST00000552346 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
USP15-218ENST00000552346 ZZZ3Q8IYH5 903 aa6.76□□□□□ -1.33
USP15-218ENST00000552346 NLGN4XQ8N0W4 816 aa6.76□□□□□ -1.33
USP15-218ENST00000552346 SVIPQ8NHG7 77 aa6.76□□□□□ -1.33
USP15-218ENST00000552346 ORAI2Q96SN7 254 aa6.76□□□□□ -1.33
USP15-218ENST00000552346 PLA2G12BQ9BX93 195 aa6.76□□□□□ -1.33
USP15-218ENST00000552346 CHST12Q9NRB3 414 aa6.76□□□□□ -1.33
USP15-218ENST00000552346 TOMM22Q9NS69 142 aa6.76□□□□□ -1.33
USP15-218ENST00000552346 COMMD10Q9Y6G5 202 aa6.76□□□□□ -1.33
USP15-218ENST00000552346 FAM90A27PA6NNH2 459 aa6.75□□□□□ -1.33
USP15-218ENST00000552346 VSTM5A8MXK1 200 aa6.75□□□□□ -1.33
USP15-218ENST00000552346 HIP1RO75146 1068 aa6.75□□□□□ -1.33
USP15-218ENST00000552346 TRIM27P14373 513 aa6.75□□□□□ -1.33
USP15-218ENST00000552346 LPOP22079 712 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
USP15-218ENST00000552346 KIF11P52732 1056 aa6.75□□□□□ -1.33
USP15-218ENST00000552346 GBX1Q14549 363 aa6.75□□□□□ -1.33
USP15-218ENST00000552346 VPS72Q15906 364 aa6.75□□□□□ -1.33
USP15-218ENST00000552346 SYCP2LQ5T4T6 812 aa6.75□□□□□ -1.33
USP15-218ENST00000552346 PPP4R4Q6NUP7 873 aa6.75□□□□□ -1.33
USP15-218ENST00000552346 KSR2Q6VAB6 950 aa6.75□□□□□ -1.33
USP15-218ENST00000552346 FRMD7Q6ZUT3 714 aa6.75□□□□□ -1.33
USP15-218ENST00000552346 CMIPQ8IY22 773 aa6.75□□□□□ -1.33
USP15-218ENST00000552346 AMER2Q8N7J2 671 aa6.75□□□□□ -1.33
USP15-218ENST00000552346 CLIP3Q96DZ5 547 aa6.75□□□□□ -1.33
USP15-218ENST00000552346 HSPBAP1Q96EW2 488 aa6.75□□□□□ -1.33
USP15-218ENST00000552346 ZMAT4Q9H898 229 aa6.75□□□□□ -1.33
USP15-218ENST00000552346 SRPK3Q9UPE1 567 aa6.75□□□□□ -1.33
USP15-218ENST00000552346 MATN2O00339 956 aa6.74□□□□□ -1.33
USP15-218ENST00000552346 ERC2O15083 957 aa6.74□□□□□ -1.33
USP15-218ENST00000552346 ARHGAP6O43182 974 aa6.74□□□□□ -1.33
USP15-218ENST00000552346 HMGCRP04035 888 aa6.74□□□□□ -1.33
USP15-218ENST00000552346 C1SP09871 688 aa6.74□□□□□ -1.33
USP15-218ENST00000552346 CD40P25942 277 aa6.74□□□□□ -1.33
USP15-218ENST00000552346 DUSP8Q13202 625 aa6.74□□□□□ -1.33
USP15-218ENST00000552346 NFYCQ13952 458 aa6.74□□□□□ -1.33
USP15-218ENST00000552346 PDCD1Q15116 288 aa6.74□□□□□ -1.33
USP15-218ENST00000552346 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
USP15-218ENST00000552346 TBR1Q16650 682 aa6.74□□□□□ -1.33
USP15-218ENST00000552346 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa6.74□□□□□ -1.33
USP15-218ENST00000552346 AMOTL1Q8IY63 956 aa6.74□□□□□ -1.33
USP15-218ENST00000552346 SSH1Q8WYL5 1049 aa6.74□□□□□ -1.33
USP15-218ENST00000552346 ACAP3Q96P50 834 aa6.74□□□□□ -1.33
USP15-218ENST00000552346 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa6.74□□□□□ -1.33
USP15-218ENST00000552346 PCIF1Q9H4Z3 704 aa6.74□□□□□ -1.33
USP15-218ENST00000552346 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
USP15-218ENST00000552346 RCAN3Q9UKA8 241 aa6.74□□□□□ -1.33
USP15-218ENST00000552346 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa6.74□□□□□ -1.33
USP15-218ENST00000552346 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
USP15-218ENST00000552346 PTGS1P23219 599 aa6.73□□□□□ -1.33
USP15-218ENST00000552346 AKAP5P24588 427 aa6.73□□□□□ -1.33
USP15-218ENST00000552346 ACRV1P26436 265 aa6.73□□□□□ -1.33
USP15-218ENST00000552346 RPS19P39019 145 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
USP15-218ENST00000552346 ADCY8P40145 1251 aa6.73□□□□□ -1.33
USP15-218ENST00000552346 KCNQ1P51787 676 aa6.73□□□□□ -1.33
USP15-218ENST00000552346 INHBEP58166 350 aa6.73□□□□□ -1.33
USP15-218ENST00000552346 IL13RA1P78552 427 aa6.73□□□□□ -1.33
USP15-218ENST00000552346 DPTQ07507 201 aa6.73□□□□□ -1.33
USP15-218ENST00000552346 KRTAP1-1Q07627 177 aa6.73□□□□□ -1.33
USP15-218ENST00000552346 FSTL4Q6MZW2 842 aa6.73□□□□□ -1.33
USP15-218ENST00000552346 EP400NLQ6ZTU2 488 aa6.73□□□□□ -1.33
USP15-218ENST00000552346 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
USP15-218ENST00000552346 IL17DQ8TAD2 202 aa6.73□□□□□ -1.33
USP15-218ENST00000552346 SARGQ9BW04 601 aa6.73□□□□□ -1.33
USP15-218ENST00000552346 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa6.73□□□□□ -1.33
USP15-218ENST00000552346 IKZF4Q9H2S9 585 aa6.73□□□□□ -1.33
USP15-218ENST00000552346 KCNH7Q9NS40 1196 aa6.73□□□□□ -1.33
USP15-218ENST00000552346 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
USP15-218ENST00000552346 FBXO10Q9UK96 956 aa6.73□□□□□ -1.33
USP15-218ENST00000552346 ATP23Q9Y6H3 246 aa6.73□□□□□ -1.33
USP15-218ENST00000552346 SCDO00767 359 aa6.72□□□□□ -1.33
USP15-218ENST00000552346 KCNK3O14649 394 aa6.72□□□□□ -1.33
USP15-218ENST00000552346 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
USP15-218ENST00000552346 SDHAP31040 664 aa6.72□□□□□ -1.33
USP15-218ENST00000552346 MOGSQ13724 837 aa6.72□□□□□ -1.33
USP15-218ENST00000552346 BRD3Q15059 726 aa6.72□□□□□ -1.33
USP15-218ENST00000552346 EPHA7Q15375 998 aa6.72□□□□□ -1.33
USP15-218ENST00000552346 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP6.72□□□□□ -1.33
USP15-218ENST00000552346 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
USP15-218ENST00000552346 C16orf92Q96LL3 132 aa6.72□□□□□ -1.33
USP15-218ENST00000552346 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
USP15-218ENST00000552346 INCENPQ9NQS7 918 aa6.72□□□□□ -1.33
USP15-218ENST00000552346 ANLNQ9NQW6 1124 aa6.72□□□□□ -1.33
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