RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546248.5

TRDN-205, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,179 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-205ENST00000546248 NSMFQ6X4W1 530 aa6.44□□□□□ -1.38
TRDN-205ENST00000546248 CLEC17AQ6ZS10 378 aa6.44□□□□□ -1.38
TRDN-205ENST00000546248 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
TRDN-205ENST00000546248 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa6.44□□□□□ -1.38
TRDN-205ENST00000546248 USP33Q8TEY7 942 aa6.44□□□□□ -1.38
TRDN-205ENST00000546248 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP6.44□□□□□ -1.38
TRDN-205ENST00000546248 GPR20Q99678 358 aa6.44□□□□□ -1.38
TRDN-205ENST00000546248 GORASP1Q9BQQ3 440 aa6.44□□□□□ -1.38
TRDN-205ENST00000546248 FSD1Q9BTV5 496 aa6.44□□□□□ -1.38
TRDN-205ENST00000546248 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
TRDN-205ENST00000546248 GREM2Q9H772 168 aa6.44□□□□□ -1.38
TRDN-205ENST00000546248 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP6.44□□□□□ -1.38
TRDN-205ENST00000546248 CLEC1BQ9P126 229 aa6.44□□□□□ -1.38
TRDN-205ENST00000546248 ZDHHC9Q9Y397 364 aa6.44□□□□□ -1.38
TRDN-205ENST00000546248 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
TRDN-205ENST00000546248 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa6.44□□□□□ -1.38
TRDN-205ENST00000546248 CCDC171Q6TFL3 1326 aa6.44□□□□□ -1.38
TRDN-205ENST00000546248 ESYT3A0FGR9 886 aa6.43□□□□□ -1.38
TRDN-205ENST00000546248 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa6.43□□□□□ -1.38
TRDN-205ENST00000546248 SLC27A2O14975 620 aa6.43□□□□□ -1.38
TRDN-205ENST00000546248 DLX3O60479 287 aa6.43□□□□□ -1.38
TRDN-205ENST00000546248 NPHS1O60500 1241 aa6.43□□□□□ -1.38
TRDN-205ENST00000546248 FGFR1P11362 822 aa6.43□□□□□ -1.38
TRDN-205ENST00000546248 CPA1P15085 419 aa6.43□□□□□ -1.38
TRDN-205ENST00000546248 GFRA1P56159 465 aa6.43□□□□□ -1.38
TRDN-205ENST00000546248 ADAM17P78536 824 aa6.43□□□□□ -1.38
TRDN-205ENST00000546248 CYP4F3Q08477 520 aa6.43□□□□□ -1.38
TRDN-205ENST00000546248 LONRF2Q1L5Z9 754 aa6.43□□□□□ -1.38
TRDN-205ENST00000546248 PRSS53Q2L4Q9 553 aa6.43□□□□□ -1.38
TRDN-205ENST00000546248 PARP10Q53GL7 1025 aa6.43□□□□□ -1.38
TRDN-205ENST00000546248 CREB3L3Q68CJ9 461 aa6.43□□□□□ -1.38
TRDN-205ENST00000546248 TICAM2Q86XR7 235 aa6.43□□□□□ -1.38
TRDN-205ENST00000546248 SCUBE1Q8IWY4 988 aa6.43□□□□□ -1.38
TRDN-205ENST00000546248 VGLL2Q8N8G2 317 aa6.43□□□□□ -1.38
TRDN-205ENST00000546248 KBTBD3Q8NAB2 608 aa6.43□□□□□ -1.38
TRDN-205ENST00000546248 TMEM145Q8NBT3 493 aa6.43□□□□□ -1.38
TRDN-205ENST00000546248 PLEKHO2Q8TD55 490 aa6.43□□□□□ -1.38
TRDN-205ENST00000546248 DPF3Q92784 378 aa6.43□□□□□ -1.38
TRDN-205ENST00000546248 OSBP2Q969R2 916 aa6.43□□□□□ -1.38
TRDN-205ENST00000546248 CCDC140Q96MF4 163 aa6.43□□□□□ -1.38
TRDN-205ENST00000546248 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
TRDN-205ENST00000546248 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
TRDN-205ENST00000546248 TM6SF1Q9BZW5 370 aa6.43□□□□□ -1.38
TRDN-205ENST00000546248 MYRFQ9Y2G1 1151 aa6.43□□□□□ -1.38
TRDN-205ENST00000546248 MED23Q9ULK4 1368 aa6.43□□□□□ -1.38
TRDN-205ENST00000546248 PHLPP1O60346 1717 aa6.42□□□□□ -1.38
TRDN-205ENST00000546248 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa6.42□□□□□ -1.38
TRDN-205ENST00000546248 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa6.42□□□□□ -1.38
TRDN-205ENST00000546248 GOLIM4O00461 696 aa6.42□□□□□ -1.38
TRDN-205ENST00000546248 NTSR2O95665 410 aa6.42□□□□□ -1.38
TRDN-205ENST00000546248 THBDP07204 575 aa6.42□□□□□ -1.38
TRDN-205ENST00000546248 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
TRDN-205ENST00000546248 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
TRDN-205ENST00000546248 CYP2C8P10632 490 aa6.42□□□□□ -1.38
TRDN-205ENST00000546248 FGFR2P21802 821 aa6.42□□□□□ -1.38
TRDN-205ENST00000546248 HSPA1LP34931 641 aa6.42□□□□□ -1.38
TRDN-205ENST00000546248 AK2P54819 239 aa6.42□□□□□ -1.38
TRDN-205ENST00000546248 NUCB2P80303 420 aa6.42□□□□□ -1.38
TRDN-205ENST00000546248 PKP1Q13835 747 aa6.42□□□□□ -1.38
TRDN-205ENST00000546248 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa6.42□□□□□ -1.38
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TRDN-205ENST00000546248 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa6.42□□□□□ -1.38
TRDN-205ENST00000546248 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa6.42□□□□□ -1.38
TRDN-205ENST00000546248 SMIM5Q71RC9 77 aa6.42□□□□□ -1.38
TRDN-205ENST00000546248 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
TRDN-205ENST00000546248 RUFY3Q7L099 469 aa6.42□□□□□ -1.38
TRDN-205ENST00000546248 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa6.42□□□□□ -1.38
TRDN-205ENST00000546248 KCTD13Q8WZ19 329 aa6.42□□□□□ -1.38
TRDN-205ENST00000546248 COPS5Q92905 334 aa6.42□□□□□ -1.38
TRDN-205ENST00000546248 EXOC2Q96KP1 924 aa6.42□□□□□ -1.38
TRDN-205ENST00000546248 DHRS4Q9BTZ2 278 aa6.42□□□□□ -1.38
TRDN-205ENST00000546248 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
TRDN-205ENST00000546248 HELLSQ9NRZ9 838 aa6.42□□□□□ -1.38
TRDN-205ENST00000546248 FANCLQ9NW38 375 aa6.42□□□□□ -1.38
TRDN-205ENST00000546248 PAG1Q9NWQ8 432 aa6.42□□□□□ -1.38
TRDN-205ENST00000546248 RFX7Q2KHR2 1363 aa6.42□□□□□ -1.38
TRDN-205ENST00000546248 LAMB4A4D0S4 1761 aa6.41□□□□□ -1.38
TRDN-205ENST00000546248 BLACEA4D250 179 aa6.41□□□□□ -1.38
TRDN-205ENST00000546248 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
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TRDN-205ENST00000546248 METTL24Q5JXM2 366 aa6.41□□□□□ -1.38
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TRDN-205ENST00000546248 SLC10A5Q5PT55 438 aa6.41□□□□□ -1.38
TRDN-205ENST00000546248 VPS53Q5VIR6 699 aa6.41□□□□□ -1.38
TRDN-205ENST00000546248 DENND5AQ6IQ26 1287 aa6.41□□□□□ -1.38
TRDN-205ENST00000546248 CLEC4GQ6UXB4 293 aa6.41□□□□□ -1.38
TRDN-205ENST00000546248 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
TRDN-205ENST00000546248 FAM26EQ8N5C1 309 aa6.41□□□□□ -1.38
TRDN-205ENST00000546248 FRS2Q8WU20 508 aa6.41□□□□□ -1.38
TRDN-205ENST00000546248 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
TRDN-205ENST00000546248 MMP19Q99542 508 aa6.41□□□□□ -1.38
TRDN-205ENST00000546248 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
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