RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545450.6

MSLN-202, Transcript of mesothelin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene MSLN, Length 2,162 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLN-202ENST00000545450 OTOP1Q7RTM1 612 aa20.35■□□□□ 0.85
MSLN-202ENST00000545450 TAX1BP1Q86VP1 789 aa20.35■□□□□ 0.85
MSLN-202ENST00000545450 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa20.35■□□□□ 0.85
MSLN-202ENST00000545450 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
MSLN-202ENST00000545450 ERMNQ8TAM6 284 aa20.35■□□□□ 0.85
MSLN-202ENST00000545450 P3H4Q92791 437 aa20.35■□□□□ 0.85
MSLN-202ENST00000545450 CDCA5Q96FF9 252 aa20.35■□□□□ 0.85
MSLN-202ENST00000545450 MXRA8Q9BRK3 442 aa20.35■□□□□ 0.85
MSLN-202ENST00000545450 RNF146Q9NTX7 359 aa20.35■□□□□ 0.85
MSLN-202ENST00000545450 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
MSLN-202ENST00000545450 AMACRQ9UHK6 382 aa20.35■□□□□ 0.85
MSLN-202ENST00000545450 MCM8Q9UJA3 840 aa20.35■□□□□ 0.85
MSLN-202ENST00000545450 CSADQ9Y600 493 aa20.35■□□□□ 0.85
MSLN-202ENST00000545450 DCDC2CA8MYV0 355 aa20.34■□□□□ 0.85
MSLN-202ENST00000545450 PLA2G4BP0C869 781 aa20.34■□□□□ 0.85
MSLN-202ENST00000545450 ITGA4P13612 1032 aa20.34■□□□□ 0.85
MSLN-202ENST00000545450 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
MSLN-202ENST00000545450 TMEM132BQ14DG7 1078 aa20.34■□□□□ 0.85
MSLN-202ENST00000545450 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
MSLN-202ENST00000545450 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
MSLN-202ENST00000545450 MOB2Q70IA6 237 aa20.34■□□□□ 0.85
MSLN-202ENST00000545450 CCDC50Q8IVM0 306 aa20.34■□□□□ 0.85
MSLN-202ENST00000545450 PARP9Q8IXQ6 854 aa20.34■□□□□ 0.85
MSLN-202ENST00000545450 CCDC26Q8TAB7 109 aa20.34■□□□□ 0.85
MSLN-202ENST00000545450 MAGEC3Q8TD91 643 aa20.34■□□□□ 0.85
MSLN-202ENST00000545450 LMBR1Q8WVP7 490 aa20.34■□□□□ 0.85
MSLN-202ENST00000545450 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
MSLN-202ENST00000545450 SGSM3Q96HU1 749 aa20.34■□□□□ 0.85
MSLN-202ENST00000545450 TAAR1Q96RJ0 339 aa20.34■□□□□ 0.85
MSLN-202ENST00000545450 PNMA2Q9UL42 364 aa20.34■□□□□ 0.85
MSLN-202ENST00000545450 FRMPD4Q14CM0 1322 aa20.34■□□□□ 0.85
MSLN-202ENST00000545450 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
MSLN-202ENST00000545450 GLTPD2A6NH11 291 aa20.34■□□□□ 0.85
MSLN-202ENST00000545450 F8VZ95 297 aa20.34■□□□□ 0.85
MSLN-202ENST00000545450 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP20.34■□□□□ 0.85
MSLN-202ENST00000545450 SLC9A1P19634 815 aa20.34■□□□□ 0.85
MSLN-202ENST00000545450 PSMC6P62333 389 aa20.34■□□□□ 0.85
MSLN-202ENST00000545450 CYP4A11Q02928 519 aa20.34■□□□□ 0.85
MSLN-202ENST00000545450 PEX26Q7Z412 305 aa20.34■□□□□ 0.85
MSLN-202ENST00000545450 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
MSLN-202ENST00000545450 SPAG5Q96R06 1193 aa20.34■□□□□ 0.85
MSLN-202ENST00000545450 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
MSLN-202ENST00000545450 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
MSLN-202ENST00000545450 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa20.34■□□□□ 0.85
MSLN-202ENST00000545450 FRMD3A2A2Y4 597 aa20.33■□□□□ 0.85
MSLN-202ENST00000545450 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
MSLN-202ENST00000545450 OAZ1P54368 228 aa20.33■□□□□ 0.85
MSLN-202ENST00000545450 PPP2R5CQ13362 524 aa20.33■□□□□ 0.85
MSLN-202ENST00000545450 SNCBQ16143 134 aa20.33■□□□□ 0.85
MSLN-202ENST00000545450 SPDYCQ5MJ68 293 aa20.33■□□□□ 0.85
MSLN-202ENST00000545450 TREML2Q5T2D2 321 aa20.33■□□□□ 0.85
MSLN-202ENST00000545450 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
MSLN-202ENST00000545450 NSMFQ6X4W1 530 aa20.33■□□□□ 0.85
MSLN-202ENST00000545450 RNF207Q6ZRF8 634 aa20.33■□□□□ 0.85
MSLN-202ENST00000545450 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
MSLN-202ENST00000545450 TLCD1Q96CP7 247 aa20.33■□□□□ 0.85
MSLN-202ENST00000545450 CLMNQ96JQ2 1002 aa20.33■□□□□ 0.85
MSLN-202ENST00000545450 ZNF577Q9BSK1 485 aa20.33■□□□□ 0.85
MSLN-202ENST00000545450 FAM114A2Q9NRY5 505 aa20.33■□□□□ 0.85
MSLN-202ENST00000545450 TMCO5BA8MYB1 307 aa20.32■□□□□ 0.84
MSLN-202ENST00000545450 TTI1O43156 1089 aa20.32■□□□□ 0.84
MSLN-202ENST00000545450 DRD4P21917 467 aa20.32■□□□□ 0.84
MSLN-202ENST00000545450 PON1P27169 355 aa20.32■□□□□ 0.84
MSLN-202ENST00000545450 SCTRP47872 440 aa20.32■□□□□ 0.84
MSLN-202ENST00000545450 IREB2P48200 963 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
MSLN-202ENST00000545450 SLC12A3P55017 1021 aa20.32■□□□□ 0.84
MSLN-202ENST00000545450 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
MSLN-202ENST00000545450 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
MSLN-202ENST00000545450 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
MSLN-202ENST00000545450 FRMD5Q7Z6J6 570 aa20.32■□□□□ 0.84
MSLN-202ENST00000545450 DNAAF5Q86Y56 855 aa20.32■□□□□ 0.84
MSLN-202ENST00000545450 SAMD3Q8N6K7 520 aa20.32■□□□□ 0.84
MSLN-202ENST00000545450 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
MSLN-202ENST00000545450 ELP3Q9H9T3 547 aa20.32■□□□□ 0.84
MSLN-202ENST00000545450 RGL1Q9NZL6 768 aa20.32■□□□□ 0.84
MSLN-202ENST00000545450 LCTP09848 1927 aa20.32■□□□□ 0.84
MSLN-202ENST00000545450 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa20.32■□□□□ 0.84
MSLN-202ENST00000545450 CHMP2AO43633 222 aa20.32■□□□□ 0.84
MSLN-202ENST00000545450 GAS7O60861 476 aa20.32■□□□□ 0.84
MSLN-202ENST00000545450 CYP11B2P19099 503 aa20.32■□□□□ 0.84
MSLN-202ENST00000545450 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
MSLN-202ENST00000545450 NR2F2P24468 414 aa20.32■□□□□ 0.84
MSLN-202ENST00000545450 NPEPPSP55786 919 aa20.32■□□□□ 0.84
MSLN-202ENST00000545450 PPARDQ03181 441 aa20.32■□□□□ 0.84
MSLN-202ENST00000545450 XRCC4Q13426 336 aa20.32■□□□□ 0.84
MSLN-202ENST00000545450 PTPROQ16827 1216 aa20.32■□□□□ 0.84
MSLN-202ENST00000545450 PCNX4Q63HM2 1172 aa20.32■□□□□ 0.84
MSLN-202ENST00000545450 NT5DC3Q86UY8 548 aa20.32■□□□□ 0.84
MSLN-202ENST00000545450 FAM228AQ86W67 206 aa20.32■□□□□ 0.84
MSLN-202ENST00000545450 GPBP1Q86WP2 473 aa20.32■□□□□ 0.84
MSLN-202ENST00000545450 CCT6BQ92526 530 aa20.32■□□□□ 0.84
MSLN-202ENST00000545450 CENPTQ96BT3 561 aa20.32■□□□□ 0.84
MSLN-202ENST00000545450 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
MSLN-202ENST00000545450 TXLNGYQ9BZA5 131 aa20.32■□□□□ 0.84
MSLN-202ENST00000545450 WDR11Q9BZH6 1224 aa20.32■□□□□ 0.84
MSLN-202ENST00000545450 INTUQ9ULD6 942 aa20.32■□□□□ 0.84
MSLN-202ENST00000545450 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
MSLN-202ENST00000545450 STK24Q9Y6E0 443 aa20.32■□□□□ 0.84
MSLN-202ENST00000545450 A0A0G2JMZ2 1700 aa20.32■□□□□ 0.84
MSLN-202ENST00000545450 GHRP10912 638 aa20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 74.5 ms