RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539589.5

PACSIN3-211, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene PACSIN3, Length 2,009 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-211ENST00000539589 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa22.06■■□□□ 1.12
PACSIN3-211ENST00000539589 SLC17A8Q8NDX2 589 aa22.06■■□□□ 1.12
PACSIN3-211ENST00000539589 SCFD2Q8WU76 684 aa22.06■■□□□ 1.12
PACSIN3-211ENST00000539589 SIX2Q9NPC8 291 aa22.06■■□□□ 1.12
PACSIN3-211ENST00000539589 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa22.06■■□□□ 1.12
PACSIN3-211ENST00000539589 PCNTO95613 3336 aa22.05■■□□□ 1.12
PACSIN3-211ENST00000539589 SLC15A5A6NIM6 579 aa22.05■■□□□ 1.12
PACSIN3-211ENST00000539589 OATP04181 439 aa22.05■■□□□ 1.12
PACSIN3-211ENST00000539589 FMO5P49326 533 aa22.05■■□□□ 1.12
PACSIN3-211ENST00000539589 TTLL4Q14679 1199 aa22.05■■□□□ 1.12
PACSIN3-211ENST00000539589 MTERF2Q49AM1 385 aa22.05■■□□□ 1.12
PACSIN3-211ENST00000539589 MORN1Q5T089 497 aa22.05■■□□□ 1.12
PACSIN3-211ENST00000539589 FAM102BQ5T8I3 360 aa22.05■■□□□ 1.12
PACSIN3-211ENST00000539589 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
PACSIN3-211ENST00000539589 AFAP1L1Q8TED9 768 aa22.05■■□□□ 1.12
PACSIN3-211ENST00000539589 TMEM174Q8WUU8 243 aa22.05■■□□□ 1.12
PACSIN3-211ENST00000539589 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa22.05■■□□□ 1.12
PACSIN3-211ENST00000539589 NOX5Q96PH1 765 aa22.05■■□□□ 1.12
PACSIN3-211ENST00000539589 CEP89Q96ST8 783 aa22.05■■□□□ 1.12
PACSIN3-211ENST00000539589 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa22.05■■□□□ 1.12
PACSIN3-211ENST00000539589 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
PACSIN3-211ENST00000539589 BRD3Q15059 726 aa22.04■■□□□ 1.12
PACSIN3-211ENST00000539589 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
PACSIN3-211ENST00000539589 MSANTD4Q8NCY6 345 aa22.04■■□□□ 1.12
PACSIN3-211ENST00000539589 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa22.04■■□□□ 1.12
PACSIN3-211ENST00000539589 VTA1Q9NP79 307 aa22.04■■□□□ 1.12
PACSIN3-211ENST00000539589 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa22.04■■□□□ 1.12
PACSIN3-211ENST00000539589 A0A087X0T9 212 aa22.04■■□□□ 1.12
PACSIN3-211ENST00000539589 SRGAP2O75044 1071 aa22.04■■□□□ 1.12
PACSIN3-211ENST00000539589 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP22.04■■□□□ 1.12
PACSIN3-211ENST00000539589 FAM228BP0C875 321 aa22.04■■□□□ 1.12
PACSIN3-211ENST00000539589 STAT5BP51692 787 aa22.04■■□□□ 1.12
PACSIN3-211ENST00000539589 GTF2BQ00403 316 aa22.04■■□□□ 1.12
PACSIN3-211ENST00000539589 CRHR2Q13324 411 aa22.04■■□□□ 1.12
PACSIN3-211ENST00000539589 C10orf76Q5T2E6 689 aa22.04■■□□□ 1.12
PACSIN3-211ENST00000539589 HAUS6Q7Z4H7 955 aa22.04■■□□□ 1.12
PACSIN3-211ENST00000539589 BSNDQ8WZ55 320 aa22.04■■□□□ 1.12
PACSIN3-211ENST00000539589 SPATA33Q96N06 139 aa22.04■■□□□ 1.12
PACSIN3-211ENST00000539589 MGAMO43451 1857 aa22.04■■□□□ 1.12
PACSIN3-211ENST00000539589 CCDC151A5D8V7 595 aa22.03■■□□□ 1.12
PACSIN3-211ENST00000539589 LGR5O75473 907 aa22.03■■□□□ 1.12
PACSIN3-211ENST00000539589 ANXA13P27216 316 aa22.03■■□□□ 1.12
PACSIN3-211ENST00000539589 PRKCIP41743 596 aa22.03■■□□□ 1.12
PACSIN3-211ENST00000539589 TM4SF4P48230 202 aa22.03■■□□□ 1.12
PACSIN3-211ENST00000539589 PEX3P56589 373 aa22.03■■□□□ 1.12
PACSIN3-211ENST00000539589 JAM2P57087 298 aa22.03■■□□□ 1.12
PACSIN3-211ENST00000539589 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
PACSIN3-211ENST00000539589 PTK2Q05397 1052 aa22.03■■□□□ 1.12
PACSIN3-211ENST00000539589 ARHGAP1Q07960 439 aa22.03■■□□□ 1.12
PACSIN3-211ENST00000539589 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa22.03■■□□□ 1.12
PACSIN3-211ENST00000539589 CYP4F22Q6NT55 531 aa22.03■■□□□ 1.12
PACSIN3-211ENST00000539589 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
PACSIN3-211ENST00000539589 TRIM50Q86XT4 487 aa22.03■■□□□ 1.12
PACSIN3-211ENST00000539589 C12orf56Q8IXR9 622 aa22.03■■□□□ 1.12
PACSIN3-211ENST00000539589 TINF2Q9BSI4 451 aa22.03■■□□□ 1.12
PACSIN3-211ENST00000539589 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
PACSIN3-211ENST00000539589 ARFGAP3Q9NP61 516 aa22.03■■□□□ 1.12
PACSIN3-211ENST00000539589 FAM53CQ9NYF3 392 aa22.03■■□□□ 1.12
PACSIN3-211ENST00000539589 SNX12Q9UMY4 172 aa22.03■■□□□ 1.12
PACSIN3-211ENST00000539589 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa22.02■■□□□ 1.12
PACSIN3-211ENST00000539589 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
PACSIN3-211ENST00000539589 ATP8B1O43520 1251 aa22.02■■□□□ 1.12
PACSIN3-211ENST00000539589 DGAT1O75907 488 aa22.02■■□□□ 1.12
PACSIN3-211ENST00000539589 TUBBP07437 444 aa22.02■■□□□ 1.12
PACSIN3-211ENST00000539589 KRT13P13646 458 aa22.02■■□□□ 1.12
PACSIN3-211ENST00000539589 PRLRP16471 622 aa22.02■■□□□ 1.12
PACSIN3-211ENST00000539589 ADCYAP1R1P41586 468 aa22.02■■□□□ 1.12
PACSIN3-211ENST00000539589 BFSP1Q12934 665 aa22.02■■□□□ 1.12
PACSIN3-211ENST00000539589 GRM1Q13255 1194 aa22.02■■□□□ 1.12
PACSIN3-211ENST00000539589 HHIPL1Q96JK4 782 aa22.02■■□□□ 1.12
PACSIN3-211ENST00000539589 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
PACSIN3-211ENST00000539589 SREBF2Q12772 1141 aa22.02■■□□□ 1.12
PACSIN3-211ENST00000539589 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
PACSIN3-211ENST00000539589 FAM160B1Q5W0V3 765 aa22.02■■□□□ 1.12
PACSIN3-211ENST00000539589 IQCEQ6IPM2 695 aa22.02■■□□□ 1.12
PACSIN3-211ENST00000539589 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
PACSIN3-211ENST00000539589 KRT222Q8N1A0 295 aa22.02■■□□□ 1.12
PACSIN3-211ENST00000539589 CAGE1Q8TC20 777 aa22.02■■□□□ 1.12
PACSIN3-211ENST00000539589 CAPZA3Q96KX2 299 aa22.02■■□□□ 1.12
PACSIN3-211ENST00000539589 MMS19Q96T76 1030 aa22.02■■□□□ 1.12
PACSIN3-211ENST00000539589 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa22.02■■□□□ 1.12
PACSIN3-211ENST00000539589 SALL4Q9UJQ4 1053 aa22.02■■□□□ 1.12
PACSIN3-211ENST00000539589 SMTNP53814 917 aa22.01■■□□□ 1.11
PACSIN3-211ENST00000539589 NCKAP1LP55160 1127 aa22.01■■□□□ 1.11
PACSIN3-211ENST00000539589 NAB2Q15742 525 aa22.01■■□□□ 1.11
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
PACSIN3-211ENST00000539589 RAB21Q9UL25 225 aa22.01■■□□□ 1.11
PACSIN3-211ENST00000539589 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa22.01■■□□□ 1.11
PACSIN3-211ENST00000539589 NOP56O00567 594 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
PACSIN3-211ENST00000539589 SLC16A4O15374 487 aa22.01■■□□□ 1.11
PACSIN3-211ENST00000539589 TOMM70O94826 608 aa22.01■■□□□ 1.11
PACSIN3-211ENST00000539589 RHOXF2BP0C7M4 288 aa22.01■■□□□ 1.11
PACSIN3-211ENST00000539589 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
PACSIN3-211ENST00000539589 FERP16591 822 aa22.01■■□□□ 1.11
PACSIN3-211ENST00000539589 CTGFP29279 349 aa22.01■■□□□ 1.11
PACSIN3-211ENST00000539589 STAT1P42224 750 aa22.01■■□□□ 1.11
PACSIN3-211ENST00000539589 MAP2K5Q13163 448 aa22.01■■□□□ 1.11
PACSIN3-211ENST00000539589 KIAA0753Q2KHM9 967 aa22.01■■□□□ 1.11
PACSIN3-211ENST00000539589 VPS36Q86VN1 386 aa22.01■■□□□ 1.11
PACSIN3-211ENST00000539589 RDH13Q8NBN7 331 aa22.01■■□□□ 1.11
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