RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527952.1

PTPRJ-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRJ, Length 626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-205ENST00000527952 CDKL5O76039 1030 aa26.85■■□□□ 1.89
PTPRJ-205ENST00000527952 BRD1O95696 1058 aa26.85■■□□□ 1.89
PTPRJ-205ENST00000527952 POMCP01189 267 aa26.85■■□□□ 1.89
PTPRJ-205ENST00000527952 ASGR2P07307 311 aa26.85■■□□□ 1.89
PTPRJ-205ENST00000527952 AVPR2P30518 371 aa26.85■■□□□ 1.89
PTPRJ-205ENST00000527952 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
PTPRJ-205ENST00000527952 MTHFRP42898 656 aa26.85■■□□□ 1.89
PTPRJ-205ENST00000527952 XKR9Q5GH70 373 aa26.85■■□□□ 1.89
PTPRJ-205ENST00000527952 TMC5Q6UXY8 1006 aa26.85■■□□□ 1.89
PTPRJ-205ENST00000527952 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
PTPRJ-205ENST00000527952 URGCPQ8TCY9 931 aa26.85■■□□□ 1.89
PTPRJ-205ENST00000527952 RIPOR3Q96MK2 946 aa26.85■■□□□ 1.89
PTPRJ-205ENST00000527952 NECTIN4Q96NY8 510 aa26.85■■□□□ 1.89
PTPRJ-205ENST00000527952 RSAD1Q9HA92 442 aa26.85■■□□□ 1.89
PTPRJ-205ENST00000527952 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP26.84■■□□□ 1.89
PTPRJ-205ENST00000527952 CTDNEP1O95476 244 aa26.84■■□□□ 1.89
PTPRJ-205ENST00000527952 YWHABP31946 246 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
PTPRJ-205ENST00000527952 EMC2Q15006 297 aa26.84■■□□□ 1.89
PTPRJ-205ENST00000527952 PTPN14Q15678 1187 aa26.84■■□□□ 1.89
PTPRJ-205ENST00000527952 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa26.84■■□□□ 1.89
PTPRJ-205ENST00000527952 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
PTPRJ-205ENST00000527952 RNF149Q8NC42 400 aa26.84■■□□□ 1.89
PTPRJ-205ENST00000527952 LIMD1Q9UGP4 676 aa26.84■■□□□ 1.89
PTPRJ-205ENST00000527952 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
PTPRJ-205ENST00000527952 PFKFB2O60825 505 aa26.83■■□□□ 1.89
PTPRJ-205ENST00000527952 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
PTPRJ-205ENST00000527952 XBP1P17861 261 aa26.83■■□□□ 1.89
PTPRJ-205ENST00000527952 RFC5P40937 340 aa26.83■■□□□ 1.89
PTPRJ-205ENST00000527952 NR5A1Q13285 461 aa26.83■■□□□ 1.89
PTPRJ-205ENST00000527952 ATAT1Q5SQI0 421 aa26.83■■□□□ 1.89
PTPRJ-205ENST00000527952 TPH2Q8IWU9 490 aa26.83■■□□□ 1.89
PTPRJ-205ENST00000527952 C4orf19Q8IY42 314 aa26.83■■□□□ 1.89
PTPRJ-205ENST00000527952 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.89
PTPRJ-205ENST00000527952 DZANK1Q9NVP4 752 aa26.83■■□□□ 1.89
PTPRJ-205ENST00000527952 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.89
PTPRJ-205ENST00000527952 IRAK3Q9Y616 596 aa26.83■■□□□ 1.89
PTPRJ-205ENST00000527952 STK36Q9NRP7 1315 aa26.83■■□□□ 1.89
PTPRJ-205ENST00000527952 FOSBP53539 338 aa26.82■■□□□ 1.88
PTPRJ-205ENST00000527952 KIAA1841Q6NSI8 718 aa26.82■■□□□ 1.88
PTPRJ-205ENST00000527952 FERMT3Q86UX7 667 aa26.82■■□□□ 1.88
PTPRJ-205ENST00000527952 CABP7Q86V35 215 aa26.82■■□□□ 1.88
PTPRJ-205ENST00000527952 KLHL5Q96PQ7 755 aa26.82■■□□□ 1.88
PTPRJ-205ENST00000527952 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
PTPRJ-205ENST00000527952 SORCS3Q9UPU3 1222 aa26.82■■□□□ 1.88
PTPRJ-205ENST00000527952 FAN1Q9Y2M0 1017 aa26.82■■□□□ 1.88
PTPRJ-205ENST00000527952 SPDYE4A6NLX3 237 aa26.81■■□□□ 1.88
PTPRJ-205ENST00000527952 C2CD2LO14523 706 aa26.81■■□□□ 1.88
PTPRJ-205ENST00000527952 NRP1O14786 923 aa26.81■■□□□ 1.88
PTPRJ-205ENST00000527952 MYBP10242 640 aa26.81■■□□□ 1.88
PTPRJ-205ENST00000527952 KLRC2P26717 231 aa26.81■■□□□ 1.88
PTPRJ-205ENST00000527952 SPIRE1Q08AE8 756 aa26.81■■□□□ 1.88
PTPRJ-205ENST00000527952 MTMR3Q13615 1198 aa26.81■■□□□ 1.88
PTPRJ-205ENST00000527952 NECAB1Q8N987 351 aa26.81■■□□□ 1.88
PTPRJ-205ENST00000527952 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
PTPRJ-205ENST00000527952 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
PTPRJ-205ENST00000527952 CPB2Q96IY4 423 aa26.81■■□□□ 1.88
PTPRJ-205ENST00000527952 MTRQ99707 1265 aa26.81■■□□□ 1.88
PTPRJ-205ENST00000527952 RNF39Q9H2S5 420 aa26.81■■□□□ 1.88
PTPRJ-205ENST00000527952 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
PTPRJ-205ENST00000527952 A0A087WWV3 80 aa26.8■■□□□ 1.88
PTPRJ-205ENST00000527952 TBX3O15119 743 aa26.8■■□□□ 1.88
PTPRJ-205ENST00000527952 ALDH2P05091 517 aa26.8■■□□□ 1.88
PTPRJ-205ENST00000527952 GIT2Q14161 759 aa26.8■■□□□ 1.88
PTPRJ-205ENST00000527952 OTUD6AQ7L8S5 288 aa26.8■■□□□ 1.88
PTPRJ-205ENST00000527952 TAS1R1Q7RTX1 841 aa26.8■■□□□ 1.88
PTPRJ-205ENST00000527952 TCP11Q8WWU5 503 aa26.8■■□□□ 1.88
PTPRJ-205ENST00000527952 RSPH1Q8WYR4 309 aa26.8■■□□□ 1.88
PTPRJ-205ENST00000527952 PRRX2Q99811 253 aa26.8■■□□□ 1.88
PTPRJ-205ENST00000527952 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa26.8■■□□□ 1.88
PTPRJ-205ENST00000527952 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa26.8■■□□□ 1.88
PTPRJ-205ENST00000527952 HES2Q9Y543 173 aa26.8■■□□□ 1.88
PTPRJ-205ENST00000527952 C2orf16Q68DN1 1984 aa26.8■■□□□ 1.88
PTPRJ-205ENST00000527952 SLITRK3O94933 977 aa26.79■■□□□ 1.88
PTPRJ-205ENST00000527952 CNPP09543 421 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
PTPRJ-205ENST00000527952 ITGA4P13612 1032 aa26.79■■□□□ 1.88
PTPRJ-205ENST00000527952 FDPSP14324 419 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
PTPRJ-205ENST00000527952 NCLP19338 710 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
PTPRJ-205ENST00000527952 EXOC8Q8IYI6 725 aa26.79■■□□□ 1.88
PTPRJ-205ENST00000527952 APOL6Q9BWW8 343 aa26.79■■□□□ 1.88
PTPRJ-205ENST00000527952 MIOSQ9NXC5 875 aa26.79■■□□□ 1.88
PTPRJ-205ENST00000527952 ASAP2O43150 1006 aa26.78■■□□□ 1.88
PTPRJ-205ENST00000527952 TSPAN1O60635 241 aa26.78■■□□□ 1.88
PTPRJ-205ENST00000527952 ERLIN2O94905 339 aa26.78■■□□□ 1.88
PTPRJ-205ENST00000527952 BAG4O95429 457 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
PTPRJ-205ENST00000527952 LARGE1O95461 756 aa26.78■■□□□ 1.88
PTPRJ-205ENST00000527952 KRT2P35908 639 aa26.78■■□□□ 1.88
PTPRJ-205ENST00000527952 OR1G1P47890 313 aa26.78■■□□□ 1.88
PTPRJ-205ENST00000527952 AK2P54819 239 aa26.78■■□□□ 1.88
PTPRJ-205ENST00000527952 ASAP3Q8TDY4 903 aa26.78■■□□□ 1.88
PTPRJ-205ENST00000527952 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
PTPRJ-205ENST00000527952 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
PTPRJ-205ENST00000527952 TMEM175Q9BSA9 504 aa26.78■■□□□ 1.88
PTPRJ-205ENST00000527952 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa26.78■■□□□ 1.88
PTPRJ-205ENST00000527952 PPME1Q9Y570 386 aa26.78■■□□□ 1.88
PTPRJ-205ENST00000527952 IPPQ9Y573 584 aa26.78■■□□□ 1.88
PTPRJ-205ENST00000527952 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa26.78■■□□□ 1.88
PTPRJ-205ENST00000527952 DENND4AQ7Z401 1863 aa26.78■■□□□ 1.88
PTPRJ-205ENST00000527952 PLXNA3P51805 1871 aa26.77■■□□□ 1.88
PTPRJ-205ENST00000527952 F8W810 466 aa26.77■■□□□ 1.88
PTPRJ-205ENST00000527952 H0Y858 1186 aa26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 453.7 ms