RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520677.1

MRPL13-204, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L13, human

TSL 3

Gene MRPL13, Length 500 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL13-204	ENST00000520677	GPRASP2	Q96D09	838 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRPL13-204	ENST00000520677	ZNF764	Q96H86	408 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MRPL13-204	ENST00000520677	PANK3	Q9H999	370 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRPL13-204	ENST00000520677	PARPBP	Q9NWS1	579 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRPL13-204	ENST00000520677	PUF60	Q9UHX1	559 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MRPL13-204	ENST00000520677	GIT1	Q9Y2X7	761 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRPL13-204	ENST00000520677	NSD3	Q9BZ95	1437 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRPL13-204	ENST00000520677	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRPL13-204	ENST00000520677	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRPL13-204	ENST00000520677	MYOM1	P52179	1685 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRPL13-204	ENST00000520677	PHKG2	P15735	406 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRPL13-204	ENST00000520677	GRIA2	P42262	883 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRPL13-204	ENST00000520677	NASP	P49321	788 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MRPL13-204	ENST00000520677	KRTAP10-7	P60409	375 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MRPL13-204	ENST00000520677	HGFAC	Q04756	655 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRPL13-204	ENST00000520677	DBP	Q10586	325 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MRPL13-204	ENST00000520677	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MRPL13-204	ENST00000520677	RRP1B	Q14684	758 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MRPL13-204	ENST00000520677	NCAPD2	Q15021	1401 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRPL13-204	ENST00000520677	SMIM5	Q71RC9	77 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRPL13-204	ENST00000520677	ADGRE4P	Q86SQ3	457 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRPL13-204	ENST00000520677	SMG6	Q86US8	1419 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MRPL13-204	ENST00000520677	ZNF654	Q8IZM8	581 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRPL13-204	ENST00000520677	POLR3GL	Q9BT43	218 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRPL13-204	ENST00000520677	AGO3	Q9H9G7	860 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MRPL13-204	ENST00000520677	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRPL13-204	ENST00000520677	PALLD	Q8WX93	1383 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRPL13-204	ENST00000520677	LY75	O60449	1722 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRPL13-204	ENST00000520677	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRPL13-204	ENST00000520677	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MRPL13-204	ENST00000520677	GJA8	P48165	433 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRPL13-204	ENST00000520677	ITPK1	Q13572	414 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRPL13-204	ENST00000520677	GRM7	Q14831	915 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRPL13-204	ENST00000520677	TRIM68	Q6AZZ1	485 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRPL13-204	ENST00000520677	USP30	Q70CQ3	517 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRPL13-204	ENST00000520677	SGMS1	Q86VZ5	419 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRPL13-204	ENST00000520677	NELFA	Q9H3P2	528 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRPL13-204	ENST00000520677	CD2AP	Q9Y5K6	639 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRPL13-204	ENST00000520677	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRPL13-204	ENST00000520677	TMEM191C	A6NGB0	347 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRPL13-204	ENST00000520677	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRPL13-204	ENST00000520677	LMNA	P02545	664 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MRPL13-204	ENST00000520677	IL13RA1	P78552	427 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRPL13-204	ENST00000520677	MRPS21	P82921	87 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MRPL13-204	ENST00000520677	FSTL1	Q12841	308 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRPL13-204	ENST00000520677	MAP4K2	Q12851	820 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRPL13-204	ENST00000520677	EIF4H	Q15056	248 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MRPL13-204	ENST00000520677	SV2C	Q496J9	727 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRPL13-204	ENST00000520677	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MRPL13-204	ENST00000520677	KCTD1	Q719H9	257 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRPL13-204	ENST00000520677	BHLHA9	Q7RTU4	235 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRPL13-204	ENST00000520677	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRPL13-204	ENST00000520677	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRPL13-204	ENST00000520677	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRPL13-204	ENST00000520677	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
MRPL13-204	ENST00000520677	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MRPL13-204	ENST00000520677	PMS2P1	A4D2B8	440 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRPL13-204	ENST00000520677	CAPN14	A8MX76	684 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRPL13-204	ENST00000520677		B2RBV5	119 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRPL13-204	ENST00000520677	SUSD5	O60279	629 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRPL13-204	ENST00000520677	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MRPL13-204	ENST00000520677	C1QTNF8	P60827	252 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRPL13-204	ENST00000520677	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRPL13-204	ENST00000520677	MRM1	Q6IN84	353 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MRPL13-204	ENST00000520677	C6orf15	Q6UXA7	325 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MRPL13-204	ENST00000520677	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MRPL13-204	ENST00000520677	MRGPRE	Q86SM8	312 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRPL13-204	ENST00000520677	MORC1	Q86VD1	984 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRPL13-204	ENST00000520677	METTL16	Q86W50	562 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MRPL13-204	ENST00000520677	SH3RF2	Q8TEC5	729 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRPL13-204	ENST00000520677	DSE	Q9UL01	958 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRPL13-204	ENST00000520677	KIF20B	Q96Q89	1820 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRPL13-204	ENST00000520677	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRPL13-204	ENST00000520677	LOC107983988	A0A1B0GUW6	1196 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MRPL13-204	ENST00000520677	TCRBV5S4A2T	A0A5A2	114 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRPL13-204	ENST00000520677	INO80B-WBP1	J3KQ70	363 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRPL13-204	ENST00000520677	HMGCR	P04035	888 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRPL13-204	ENST00000520677	ZNF16	P17020	682 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MRPL13-204	ENST00000520677	GRK2	P25098	689 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRPL13-204	ENST00000520677	GRK3	P35626	688 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRPL13-204	ENST00000520677	MTHFS	P49914	203 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRPL13-204	ENST00000520677	KCNQ1	P51787	676 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRPL13-204	ENST00000520677	C21orf58	P58505	322 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRPL13-204	ENST00000520677	STIL	Q15468	1287 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRPL13-204	ENST00000520677	MBNL2	Q5VZF2	373 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MRPL13-204	ENST00000520677	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRPL13-204	ENST00000520677	RSPO2	Q6UXX9	243 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MRPL13-204	ENST00000520677	D2HGDH	Q8N465	521 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRPL13-204	ENST00000520677	BBC3	Q96PG8	261 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MRPL13-204	ENST00000520677	PHF20	Q9BVI0	1012 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRPL13-204	ENST00000520677	INO80B	Q9C086	356 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MRPL13-204	ENST00000520677	LRP2BP	Q9P2M1	347 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRPL13-204	ENST00000520677	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRPL13-204	ENST00000520677	CHD4	Q14839	1912 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRPL13-204	ENST00000520677	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRPL13-204	ENST00000520677	ITGB4	P16144	1822 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPL13-204	ENST00000520677	RPS6KA4	O75676	772 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPL13-204	ENST00000520677	HHEX	Q03014	270 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPL13-204	ENST00000520677	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MRPL13-204	ENST00000520677	WDR72	Q3MJ13	1102 aa		4.88	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13 ms