RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 GAS2O43903 313 aaKnown RBP18.88■□□□□ 0.61
HERC3-211ENST00000513325 SLITRK3O94933 977 aa18.88■□□□□ 0.61
HERC3-211ENST00000513325 LARGE1O95461 756 aa18.88■□□□□ 0.61
HERC3-211ENST00000513325 CTSAP10619 480 aa18.88■□□□□ 0.61
HERC3-211ENST00000513325 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP18.88■□□□□ 0.61
HERC3-211ENST00000513325 NHLH1Q02575 133 aa18.88■□□□□ 0.61
HERC3-211ENST00000513325 ITIH3Q06033 890 aa18.88■□□□□ 0.61
HERC3-211ENST00000513325 UBXN11Q5T124 520 aa18.88■□□□□ 0.61
HERC3-211ENST00000513325 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP18.88■□□□□ 0.61
HERC3-211ENST00000513325 URGCPQ8TCY9 931 aa18.88■□□□□ 0.61
HERC3-211ENST00000513325 POMKQ9H5K3 350 aa18.88■□□□□ 0.61
HERC3-211ENST00000513325 RSAD1Q9HA92 442 aa18.88■□□□□ 0.61
HERC3-211ENST00000513325 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa18.88■□□□□ 0.61
HERC3-211ENST00000513325 IRAK3Q9Y616 596 aa18.88■□□□□ 0.61
HERC3-211ENST00000513325 ASAP2O43150 1006 aa18.87■□□□□ 0.61
HERC3-211ENST00000513325 DDHD2O94830 711 aa18.87■□□□□ 0.61
HERC3-211ENST00000513325 WEE2P0C1S8 567 aa18.87■□□□□ 0.61
HERC3-211ENST00000513325 EPCAMP16422 314 aa18.87■□□□□ 0.61
HERC3-211ENST00000513325 SIGLEC14Q08ET2 396 aa18.87■□□□□ 0.61
HERC3-211ENST00000513325 GIT2Q14161 759 aa18.87■□□□□ 0.61
HERC3-211ENST00000513325 PTPN21Q16825 1174 aa18.87■□□□□ 0.61
HERC3-211ENST00000513325 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP18.87■□□□□ 0.61
HERC3-211ENST00000513325 KANK3Q6NY19 840 aa18.87■□□□□ 0.61
HERC3-211ENST00000513325 GTF3C6Q969F1 213 aa18.87■□□□□ 0.61
HERC3-211ENST00000513325 NECTIN4Q96NY8 510 aa18.87■□□□□ 0.61
HERC3-211ENST00000513325 MTRQ99707 1265 aa18.87■□□□□ 0.61
HERC3-211ENST00000513325 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP18.87■□□□□ 0.61
HERC3-211ENST00000513325 VN1R3Q9BXE9 311 aa18.87■□□□□ 0.61
HERC3-211ENST00000513325 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa18.87■□□□□ 0.61
HERC3-211ENST00000513325 PCDHA12Q9UN75 941 aa18.87■□□□□ 0.61
HERC3-211ENST00000513325 NR2E1Q9Y466 385 aa18.87■□□□□ 0.61
HERC3-211ENST00000513325 TRIOO75962 3097 aa18.86■□□□□ 0.61
HERC3-211ENST00000513325 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa18.86■□□□□ 0.61
HERC3-211ENST00000513325 BTBD18B2RXH4 712 aa18.86■□□□□ 0.61
HERC3-211ENST00000513325 POMCP01189 267 aa18.86■□□□□ 0.61
HERC3-211ENST00000513325 FOSBP53539 338 aa18.86■□□□□ 0.61
HERC3-211ENST00000513325 CALCRLQ16602 461 aa18.86■□□□□ 0.61
HERC3-211ENST00000513325 ZBTB33Q86T24 672 aa18.86■□□□□ 0.61
HERC3-211ENST00000513325 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP18.86■□□□□ 0.61
HERC3-211ENST00000513325 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP18.86■□□□□ 0.61
HERC3-211ENST00000513325 SLC22A17Q8WUG5 538 aa18.86■□□□□ 0.61
HERC3-211ENST00000513325 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP18.86■□□□□ 0.61
HERC3-211ENST00000513325 HSD17B14Q9BPX1 270 aa18.86■□□□□ 0.61
HERC3-211ENST00000513325 KANSL3Q9P2N6 904 aa18.86■□□□□ 0.61
HERC3-211ENST00000513325 ZNF318Q5VUA4 2279 aa18.86■□□□□ 0.61
HERC3-211ENST00000513325 C2CD4DB7Z1M9 353 aa18.85■□□□□ 0.61
HERC3-211ENST00000513325 WNT7AO00755 349 aa18.85■□□□□ 0.61
HERC3-211ENST00000513325 ERLIN2O94905 339 aa18.85■□□□□ 0.61
HERC3-211ENST00000513325 ALDH2P05091 517 aa18.85■□□□□ 0.61
HERC3-211ENST00000513325 NCLP19338 710 aaKnown RBP18.85■□□□□ 0.61
HERC3-211ENST00000513325 MTHFRP42898 656 aa18.85■□□□□ 0.61
HERC3-211ENST00000513325 PTENP60484 403 aa18.85■□□□□ 0.61
HERC3-211ENST00000513325 PTPN14Q15678 1187 aa18.85■□□□□ 0.61
HERC3-211ENST00000513325 IER5LQ5T953 404 aa18.85■□□□□ 0.61
HERC3-211ENST00000513325 FBXL6Q8N531 539 aa18.85■□□□□ 0.61
HERC3-211ENST00000513325 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP18.85■□□□□ 0.61
HERC3-211ENST00000513325 ASIC4Q96FT7 647 aa18.85■□□□□ 0.61
HERC3-211ENST00000513325 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP18.85■□□□□ 0.61
HERC3-211ENST00000513325 DZANK1Q9NVP4 752 aa18.85■□□□□ 0.61
HERC3-211ENST00000513325 FAN1Q9Y2M0 1017 aa18.85■□□□□ 0.61
HERC3-211ENST00000513325 TSPAN1O60635 241 aa18.84■□□□□ 0.61
HERC3-211ENST00000513325 JAK2O60674 1132 aa18.84■□□□□ 0.61
HERC3-211ENST00000513325 LYPLA2O95372 231 aa18.84■□□□□ 0.61
HERC3-211ENST00000513325 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP18.84■□□□□ 0.61
HERC3-211ENST00000513325 ITGA4P13612 1032 aa18.84■□□□□ 0.61
HERC3-211ENST00000513325 TXKP42681 527 aa18.84■□□□□ 0.61
HERC3-211ENST00000513325 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP18.84■□□□□ 0.61
HERC3-211ENST00000513325 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP18.84■□□□□ 0.61
HERC3-211ENST00000513325 CNNM3Q8NE01 707 aa18.84■□□□□ 0.61
HERC3-211ENST00000513325 CPB2Q96IY4 423 aa18.84■□□□□ 0.61
HERC3-211ENST00000513325 RIPOR3Q96MK2 946 aa18.84■□□□□ 0.61
HERC3-211ENST00000513325 TMEM175Q9BSA9 504 aa18.84■□□□□ 0.61
HERC3-211ENST00000513325 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP18.84■□□□□ 0.61
HERC3-211ENST00000513325 RNF39Q9H2S5 420 aa18.84■□□□□ 0.61
HERC3-211ENST00000513325 ANKEF1Q9NU02 776 aa18.84■□□□□ 0.61
HERC3-211ENST00000513325 PPP4R2Q9NY27 417 aa18.84■□□□□ 0.61
HERC3-211ENST00000513325 IPPQ9Y573 584 aa18.84■□□□□ 0.61
HERC3-211ENST00000513325 ARID2Q68CP9 1835 aa18.84■□□□□ 0.61
HERC3-211ENST00000513325 A0A087WWV3 80 aa18.83■□□□□ 0.6
HERC3-211ENST00000513325 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa18.83■□□□□ 0.6
HERC3-211ENST00000513325 NRP1O14786 923 aa18.83■□□□□ 0.6
HERC3-211ENST00000513325 NEMFO60524 1076 aa18.83■□□□□ 0.6
HERC3-211ENST00000513325 MRE11P49959 708 aa18.83■□□□□ 0.6
HERC3-211ENST00000513325 NEK4P51957 841 aa18.83■□□□□ 0.6
HERC3-211ENST00000513325 TFDP1Q14186 410 aa18.83■□□□□ 0.6
HERC3-211ENST00000513325 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP18.83■□□□□ 0.6
HERC3-211ENST00000513325 ATAT1Q5SQI0 421 aa18.83■□□□□ 0.6
HERC3-211ENST00000513325 PPFIBP1Q86W92 1011 aa18.83■□□□□ 0.6
HERC3-211ENST00000513325 KREMEN2Q8NCW0 462 aa18.83■□□□□ 0.6
HERC3-211ENST00000513325 PRSS33Q8NF86 280 aa18.83■□□□□ 0.6
HERC3-211ENST00000513325 ASAP3Q8TDY4 903 aa18.83■□□□□ 0.6
HERC3-211ENST00000513325 KLHL5Q96PQ7 755 aa18.83■□□□□ 0.6
HERC3-211ENST00000513325 DGAT1O75907 488 aa18.82■□□□□ 0.6
HERC3-211ENST00000513325 CNPP09543 421 aaKnown RBP18.82■□□□□ 0.6
HERC3-211ENST00000513325 AXLP30530 894 aa18.82■□□□□ 0.6
HERC3-211ENST00000513325 ARL2P36404 184 aa18.82■□□□□ 0.6
HERC3-211ENST00000513325 MBTD1Q05BQ5 628 aa18.82■□□□□ 0.6
HERC3-211ENST00000513325 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP18.82■□□□□ 0.6
HERC3-211ENST00000513325 CAPSQ13938 189 aa18.82■□□□□ 0.6
HERC3-211ENST00000513325 TRIM29Q14134 588 aa18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.4 ms