RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511663.5

SH3BP2-220, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 966 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-220ENST00000511663 PPFIBP1Q86W92 1011 aa21.49■■□□□ 1.03
SH3BP2-220ENST00000511663 PRRX2Q99811 253 aa21.49■■□□□ 1.03
SH3BP2-220ENST00000511663 ZBP1Q9H171 429 aa21.49■■□□□ 1.03
SH3BP2-220ENST00000511663 RSAD1Q9HA92 442 aa21.49■■□□□ 1.03
SH3BP2-220ENST00000511663 DZANK1Q9NVP4 752 aa21.49■■□□□ 1.03
SH3BP2-220ENST00000511663 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
SH3BP2-220ENST00000511663 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa21.49■■□□□ 1.03
SH3BP2-220ENST00000511663 SP100P23497 879 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
SH3BP2-220ENST00000511663 PTPN21Q16825 1174 aa21.48■■□□□ 1.03
SH3BP2-220ENST00000511663 ATAT1Q5SQI0 421 aa21.48■■□□□ 1.03
SH3BP2-220ENST00000511663 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
SH3BP2-220ENST00000511663 FERMT3Q86UX7 667 aa21.48■■□□□ 1.03
SH3BP2-220ENST00000511663 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa21.48■■□□□ 1.03
SH3BP2-220ENST00000511663 FAN1Q9Y2M0 1017 aa21.48■■□□□ 1.03
SH3BP2-220ENST00000511663 IRAK3Q9Y616 596 aa21.48■■□□□ 1.03
SH3BP2-220ENST00000511663 MEIS3P2A8K0S8 358 aa21.47■■□□□ 1.03
SH3BP2-220ENST00000511663 DTNBO60941 627 aa21.47■■□□□ 1.03
SH3BP2-220ENST00000511663 CTDNEP1O95476 244 aa21.47■■□□□ 1.03
SH3BP2-220ENST00000511663 AXLP30530 894 aa21.47■■□□□ 1.03
SH3BP2-220ENST00000511663 NHLH1Q02575 133 aa21.47■■□□□ 1.03
SH3BP2-220ENST00000511663 NR5A1Q13285 461 aa21.47■■□□□ 1.03
SH3BP2-220ENST00000511663 CALCRLQ16602 461 aa21.47■■□□□ 1.03
SH3BP2-220ENST00000511663 NECAB1Q8N987 351 aa21.47■■□□□ 1.03
SH3BP2-220ENST00000511663 DNAJB4Q9UDY4 337 aa21.47■■□□□ 1.03
SH3BP2-220ENST00000511663 SLITRK3O94933 977 aa21.46■■□□□ 1.03
SH3BP2-220ENST00000511663 ITGA4P13612 1032 aa21.46■■□□□ 1.03
SH3BP2-220ENST00000511663 SLC11A1P49279 550 aa21.46■■□□□ 1.03
SH3BP2-220ENST00000511663 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
SH3BP2-220ENST00000511663 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
SH3BP2-220ENST00000511663 AGMOQ6ZNB7 445 aa21.46■■□□□ 1.03
SH3BP2-220ENST00000511663 CABP7Q86V35 215 aa21.46■■□□□ 1.03
SH3BP2-220ENST00000511663 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF280BQ86YH2 543 aa21.46■■□□□ 1.03
SH3BP2-220ENST00000511663 FBXL6Q8N531 539 aa21.46■■□□□ 1.03
SH3BP2-220ENST00000511663 AUTS2Q8WXX7 1259 aa21.46■■□□□ 1.03
SH3BP2-220ENST00000511663 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
SH3BP2-220ENST00000511663 TMEM175Q9BSA9 504 aa21.46■■□□□ 1.03
SH3BP2-220ENST00000511663 MINDY3Q9H8M7 445 aa21.46■■□□□ 1.03
SH3BP2-220ENST00000511663 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
SH3BP2-220ENST00000511663 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa21.45■■□□□ 1.02
SH3BP2-220ENST00000511663 ZBTB39O15060 712 aa21.45■■□□□ 1.02
SH3BP2-220ENST00000511663 NR1I2O75469 434 aa21.45■■□□□ 1.02
SH3BP2-220ENST00000511663 NCLP19338 710 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
SH3BP2-220ENST00000511663 KLRC2P26717 231 aa21.45■■□□□ 1.02
SH3BP2-220ENST00000511663 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
SH3BP2-220ENST00000511663 ME3Q16798 604 aa21.45■■□□□ 1.02
SH3BP2-220ENST00000511663 NOTUMQ6P988 496 aa21.45■■□□□ 1.02
SH3BP2-220ENST00000511663 HACE1Q8IYU2 909 aa21.45■■□□□ 1.02
SH3BP2-220ENST00000511663 POMKQ9H5K3 350 aa21.45■■□□□ 1.02
SH3BP2-220ENST00000511663 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
SH3BP2-220ENST00000511663 ANKEF1Q9NU02 776 aa21.45■■□□□ 1.02
SH3BP2-220ENST00000511663 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa21.45■■□□□ 1.02
SH3BP2-220ENST00000511663 DGAT1O75907 488 aa21.44■■□□□ 1.02
SH3BP2-220ENST00000511663 DDHD2O94830 711 aa21.44■■□□□ 1.02
SH3BP2-220ENST00000511663 POMCP01189 267 aa21.44■■□□□ 1.02
SH3BP2-220ENST00000511663 FDPSP14324 419 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
SH3BP2-220ENST00000511663 TXKP42681 527 aa21.44■■□□□ 1.02
SH3BP2-220ENST00000511663 POU5F1BQ06416 359 aa21.44■■□□□ 1.02
SH3BP2-220ENST00000511663 SPIRE1Q08AE8 756 aa21.44■■□□□ 1.02
SH3BP2-220ENST00000511663 PLCD3Q8N3E9 789 aa21.44■■□□□ 1.02
SH3BP2-220ENST00000511663 GTF3C6Q969F1 213 aa21.44■■□□□ 1.02
SH3BP2-220ENST00000511663 CCDC51Q96ER9 411 aa21.44■■□□□ 1.02
SH3BP2-220ENST00000511663 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
SH3BP2-220ENST00000511663 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
SH3BP2-220ENST00000511663 PPP4R2Q9NY27 417 aa21.44■■□□□ 1.02
SH3BP2-220ENST00000511663 FAM205CA6NFA0 338 aa21.43■■□□□ 1.02
SH3BP2-220ENST00000511663 BTBD18B2RXH4 712 aa21.43■■□□□ 1.02
SH3BP2-220ENST00000511663 NRP1O14786 923 aa21.43■■□□□ 1.02
SH3BP2-220ENST00000511663 NEMFO60524 1076 aa21.43■■□□□ 1.02
SH3BP2-220ENST00000511663 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP21.43■■□□□ 1.02
SH3BP2-220ENST00000511663 MRE11P49959 708 aa21.43■■□□□ 1.02
SH3BP2-220ENST00000511663 NEK4P51957 841 aa21.43■■□□□ 1.02
SH3BP2-220ENST00000511663 PTPN5P54829 565 aa21.43■■□□□ 1.02
SH3BP2-220ENST00000511663 PTENP60484 403 aa21.43■■□□□ 1.02
SH3BP2-220ENST00000511663 MTMR3Q13615 1198 aa21.43■■□□□ 1.02
SH3BP2-220ENST00000511663 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP21.43■■□□□ 1.02
SH3BP2-220ENST00000511663 UBXN11Q5T124 520 aa21.43■■□□□ 1.02
SH3BP2-220ENST00000511663 UBALD2Q8IYN6 164 aa21.43■■□□□ 1.02
SH3BP2-220ENST00000511663 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
SH3BP2-220ENST00000511663 KREMEN2Q8NCW0 462 aa21.43■■□□□ 1.02
SH3BP2-220ENST00000511663 HSD17B14Q9BPX1 270 aa21.43■■□□□ 1.02
SH3BP2-220ENST00000511663 SORCS3Q9UPU3 1222 aa21.43■■□□□ 1.02
SH3BP2-220ENST00000511663 LYPLA2O95372 231 aa21.42■■□□□ 1.02
SH3BP2-220ENST00000511663 WEE2P0C1S8 567 aa21.42■■□□□ 1.02
SH3BP2-220ENST00000511663 EPCAMP16422 314 aa21.42■■□□□ 1.02
SH3BP2-220ENST00000511663 OR1G1P47890 313 aa21.42■■□□□ 1.02
SH3BP2-220ENST00000511663 KIAA1841Q6NSI8 718 aa21.42■■□□□ 1.02
SH3BP2-220ENST00000511663 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa21.42■■□□□ 1.02
SH3BP2-220ENST00000511663 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
SH3BP2-220ENST00000511663 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
SH3BP2-220ENST00000511663 SLC22A17Q8WUG5 538 aa21.42■■□□□ 1.02
SH3BP2-220ENST00000511663 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
SH3BP2-220ENST00000511663 TNFRSF25Q93038 417 aa21.42■■□□□ 1.02
SH3BP2-220ENST00000511663 KLHL5Q96PQ7 755 aa21.42■■□□□ 1.02
SH3BP2-220ENST00000511663 IPPQ9Y573 584 aa21.42■■□□□ 1.02
SH3BP2-220ENST00000511663 C2CD4DB7Z1M9 353 aa21.41■■□□□ 1.02
SH3BP2-220ENST00000511663 TSPAN1O60635 241 aa21.41■■□□□ 1.02
SH3BP2-220ENST00000511663 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP21.41■■□□□ 1.02
SH3BP2-220ENST00000511663 FOSBP53539 338 aa21.41■■□□□ 1.02
SH3BP2-220ENST00000511663 PTPN14Q15678 1187 aa21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.6 ms