RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	ABI1	Q8IZP0	508 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SKAP2-209	ENST00000497511	MRPS27	Q92552	414 aa	Known RBP	12.34	□□□□□ -0.43
SKAP2-209	ENST00000497511	CASP10	Q92851	521 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SKAP2-209	ENST00000497511	NKD2	Q969F2	451 aa	Predicted RBP	12.34	□□□□□ -0.43
SKAP2-209	ENST00000497511	NECTIN4	Q96NY8	510 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SKAP2-209	ENST00000497511	SPZ1	Q9BXG8	430 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SKAP2-209	ENST00000497511	NUCKS1	Q9H1E3	243 aa	Known RBP	12.34	□□□□□ -0.43
SKAP2-209	ENST00000497511	S1PR5	Q9H228	398 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SKAP2-209	ENST00000497511	RWDD1	Q9H446	243 aa	Predicted RBP	12.34	□□□□□ -0.43
SKAP2-209	ENST00000497511	NGRN	Q9NPE2	291 aa	Known RBP	12.34	□□□□□ -0.43
SKAP2-209	ENST00000497511	JADE2	Q9NQC1	790 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SKAP2-209	ENST00000497511	NOC2L	Q9Y3T9	749 aa	Known RBP	12.34	□□□□□ -0.43
SKAP2-209	ENST00000497511	UBIAD1	Q9Y5Z9	338 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SKAP2-209	ENST00000497511	KDM3A	Q9Y4C1	1321 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SKAP2-209	ENST00000497511	FSCN2	O14926	492 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	MGEA5	O60502	916 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	BRD1	O95696	1058 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	KLRC1	P26715	233 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	MSX1	P28360	303 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	PPM1A	P35813	382 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	ID4	P47928	161 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	GNAQ	P50148	359 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	ACTR2	P61160	394 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	BMS1	Q14692	1282 aa	Known RBP	12.33	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	UBE2S	Q16763	222 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	MCTP2	Q6DN12	878 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	SYCE2	Q6PIF2	218 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM184A	Q6ZMB5	413 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM43B	Q6ZT52	329 aa	Predicted RBP	12.33	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	PLPPR4	Q7Z2D5	763 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM105	Q8N8V8	129 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	TDRD5	Q8NAT2	981 aa	Known RBP	12.33	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	FLCN	Q8NFG4	579 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	PPP1R16B	Q96T49	567 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	PCYT2	Q99447	389 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	LZTS2	Q9BRK4	669 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	MYL10	Q9BUA6	226 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	ERVK-5	Q9HDB9	667 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	RGS18	Q9NS28	235 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	PCDHA6	Q9UN73	950 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	ST3GAL5	Q9UNP4	418 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	LZTS1	Q9Y250	596 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	PCDHA8	Q9Y5H6	950 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	BAZ2B	Q9UIF8	2168 aa	Known RBP	12.32	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	KMT2E	Q8IZD2	1858 aa		12.32	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	DOCK5	Q9H7D0	1870 aa		12.32	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	HIDE1	A8MVS5	230 aa		12.32	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	C2CD4D	B7Z1M9	353 aa		12.32	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	DDAH1	O94760	285 aa		12.32	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	NBL1	P41271	181 aa		12.32	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	SEC13	P55735	322 aa		12.32	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	ITIH3	Q06033	890 aa		12.32	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	EFHC2	Q5JST6	749 aa		12.32	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM160B1	Q5W0V3	765 aa		12.32	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	CASC1	Q6TDU7	716 aa		12.32	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	ERMP1	Q7Z2K6	904 aa		12.32	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	FRMD5	Q7Z6J6	570 aa		12.32	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	CKAP2L	Q8IYA6	745 aa		12.32	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF654	Q8IZM8	581 aa		12.32	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	ADSSL1	Q8N142	457 aa		12.32	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	RNF169	Q8NCN4	708 aa		12.32	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	RASGRP4	Q8TDF6	673 aa		12.32	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF558	Q96NG5	402 aa		12.32	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	POMK	Q9H5K3	350 aa		12.32	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	GPAM	Q9HCL2	828 aa		12.32	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	KCNH7	Q9NS40	1196 aa		12.32	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM161A	Q9NX61	479 aa		12.32	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	CDH22	Q9UJ99	828 aa		12.32	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	CFAP54	Q96N23	3096 aa		12.32	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	CCDC69	A6NI79	296 aa		12.31	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511		C9IYK1	514 aa		12.31	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511		E7EWF7	191 aa		12.31	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	DDX39A	O00148	427 aa	Known RBP	12.31	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	HBP1	O60381	514 aa		12.31	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	ASGR2	P07307	311 aa		12.31	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	CYP21A2	P08686	494 aa		12.31	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	PBX3	P40426	434 aa		12.31	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	MTHFR	P42898	656 aa		12.31	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC26A2	P50443	739 aa		12.31	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	EPHA4	P54764	986 aa		12.31	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	PLCB3	Q01970	1234 aa		12.31	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	SMC1A	Q14683	1233 aa	Known RBP	12.31	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	KIZ	Q2M2Z5	673 aa		12.31	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	KCNT2	Q6UVM3	1135 aa		12.31	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	HEATR3	Q7Z4Q2	680 aa		12.31	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	CMTR1	Q8N1G2	835 aa	Known RBP	12.31	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	LRRC43	Q8N309	656 aa		12.31	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	METTL13	Q8N6R0	699 aa		12.31	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	KCNG4	Q8TDN1	519 aa		12.31	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	RUFY2	Q8WXA3	655 aa		12.31	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	OSMR	Q99650	979 aa		12.31	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM117	Q9H0C3	514 aa		12.31	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	ADAM7	Q9H2U9	754 aa		12.31	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	CWH43	Q9H720	699 aa		12.31	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	ZDHHC3	Q9NYG2	299 aa		12.31	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	SPG21	Q9NZD8	308 aa		12.31	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	DBR1	Q9UK59	544 aa	Known RBP	12.31	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	HCFC2	Q9Y5Z7	792 aa		12.31	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	hCG_1642624	A0A1W2PR95	340 aa		12.3	□□□□□ -0.44
SKAP2-209	ENST00000497511	PLEKHA8P1	O95397	391 aa		12.3	□□□□□ -0.44

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