RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495022.5

TRDMT1-211, Transcript of tRNA aspartic acid methyltransferase 1, humanhuman

TSL 2

Gene TRDMT1, Length 1,374 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDMT1-211ENST00000495022 EMC2Q15006 297 aa25.18■■□□□ 1.62
TRDMT1-211ENST00000495022 NCAPH2Q6IBW4 605 aa25.18■■□□□ 1.62
TRDMT1-211ENST00000495022 AGMOQ6ZNB7 445 aa25.18■■□□□ 1.62
TRDMT1-211ENST00000495022 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
TRDMT1-211ENST00000495022 RIPOR3Q96MK2 946 aa25.18■■□□□ 1.62
TRDMT1-211ENST00000495022 MINDY3Q9H8M7 445 aa25.18■■□□□ 1.62
TRDMT1-211ENST00000495022 RGL1Q9NZL6 768 aa25.18■■□□□ 1.62
TRDMT1-211ENST00000495022 KANSL3Q9P2N6 904 aa25.18■■□□□ 1.62
TRDMT1-211ENST00000495022 DNAJB4Q9UDY4 337 aa25.18■■□□□ 1.62
TRDMT1-211ENST00000495022 CDH22Q9UJ99 828 aa25.18■■□□□ 1.62
TRDMT1-211ENST00000495022 SLC11A1P49279 550 aa25.18■■□□□ 1.62
TRDMT1-211ENST00000495022 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP25.18■■□□□ 1.62
TRDMT1-211ENST00000495022 ZBTB33Q86T24 672 aa25.18■■□□□ 1.62
TRDMT1-211ENST00000495022 FERMT3Q86UX7 667 aa25.18■■□□□ 1.62
TRDMT1-211ENST00000495022 AUTS2Q8WXX7 1259 aa25.18■■□□□ 1.62
TRDMT1-211ENST00000495022 DYDC2Q96IM9 177 aa25.18■■□□□ 1.62
TRDMT1-211ENST00000495022 GBP3Q9H0R5 595 aa25.18■■□□□ 1.62
TRDMT1-211ENST00000495022 RSAD1Q9HA92 442 aa25.18■■□□□ 1.62
TRDMT1-211ENST00000495022 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa25.18■■□□□ 1.62
TRDMT1-211ENST00000495022 SP100P23497 879 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
TRDMT1-211ENST00000495022 KRT2P35908 639 aa25.17■■□□□ 1.62
TRDMT1-211ENST00000495022 XKR9Q5GH70 373 aa25.17■■□□□ 1.62
TRDMT1-211ENST00000495022 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
TRDMT1-211ENST00000495022 KIAA1841Q6NSI8 718 aa25.17■■□□□ 1.62
TRDMT1-211ENST00000495022 PPFIBP1Q86W92 1011 aa25.17■■□□□ 1.62
TRDMT1-211ENST00000495022 ZNF280BQ86YH2 543 aa25.17■■□□□ 1.62
TRDMT1-211ENST00000495022 RNF149Q8NC42 400 aa25.17■■□□□ 1.62
TRDMT1-211ENST00000495022 PRSS33Q8NF86 280 aa25.17■■□□□ 1.62
TRDMT1-211ENST00000495022 SLC22A17Q8WUG5 538 aa25.17■■□□□ 1.62
TRDMT1-211ENST00000495022 MTRQ99707 1265 aa25.17■■□□□ 1.62
TRDMT1-211ENST00000495022 VN1R3Q9BXE9 311 aa25.17■■□□□ 1.62
TRDMT1-211ENST00000495022 BRMS1Q9HCU9 246 aa25.17■■□□□ 1.62
TRDMT1-211ENST00000495022 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
TRDMT1-211ENST00000495022 B4GALT3O60512 393 aa25.16■■□□□ 1.62
TRDMT1-211ENST00000495022 PTPN5P54829 565 aa25.16■■□□□ 1.62
TRDMT1-211ENST00000495022 PTPN14Q15678 1187 aa25.16■■□□□ 1.62
TRDMT1-211ENST00000495022 UBXN11Q5T124 520 aa25.16■■□□□ 1.62
TRDMT1-211ENST00000495022 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
TRDMT1-211ENST00000495022 IER5LQ5T953 404 aa25.16■■□□□ 1.62
TRDMT1-211ENST00000495022 CNNM3Q8NE01 707 aa25.16■■□□□ 1.62
TRDMT1-211ENST00000495022 TNFRSF25Q93038 417 aa25.16■■□□□ 1.62
TRDMT1-211ENST00000495022 TMEM175Q9BSA9 504 aa25.16■■□□□ 1.62
TRDMT1-211ENST00000495022 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
TRDMT1-211ENST00000495022 C2CD4DB7Z1M9 353 aa25.15■■□□□ 1.62
TRDMT1-211ENST00000495022 EPCAMP16422 314 aa25.15■■□□□ 1.62
TRDMT1-211ENST00000495022 NCLP19338 710 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
TRDMT1-211ENST00000495022 AK2P54819 239 aa25.15■■□□□ 1.62
TRDMT1-211ENST00000495022 CYP4A11Q02928 519 aa25.15■■□□□ 1.62
TRDMT1-211ENST00000495022 NR5A1Q13285 461 aa25.15■■□□□ 1.62
TRDMT1-211ENST00000495022 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
TRDMT1-211ENST00000495022 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
TRDMT1-211ENST00000495022 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
TRDMT1-211ENST00000495022 UBN1Q9NPG3 1134 aa25.15■■□□□ 1.62
TRDMT1-211ENST00000495022 FAM205CA6NFA0 338 aa25.14■■□□□ 1.61
TRDMT1-211ENST00000495022 DDHD2O94830 711 aa25.14■■□□□ 1.61
TRDMT1-211ENST00000495022 ERLIN2O94905 339 aa25.14■■□□□ 1.61
TRDMT1-211ENST00000495022 FDPSP14324 419 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.61
TRDMT1-211ENST00000495022 AXLP30530 894 aa25.14■■□□□ 1.61
TRDMT1-211ENST00000495022 ATAT1Q5SQI0 421 aa25.14■■□□□ 1.61
TRDMT1-211ENST00000495022 TPH2Q8IWU9 490 aa25.14■■□□□ 1.61
TRDMT1-211ENST00000495022 UBALD2Q8IYN6 164 aa25.14■■□□□ 1.61
TRDMT1-211ENST00000495022 KREMEN2Q8NCW0 462 aa25.14■■□□□ 1.61
TRDMT1-211ENST00000495022 CCDC51Q96ER9 411 aa25.14■■□□□ 1.61
TRDMT1-211ENST00000495022 SORCS3Q9UPU3 1222 aa25.14■■□□□ 1.61
TRDMT1-211ENST00000495022 PLXNA3P51805 1871 aa25.13■■□□□ 1.61
TRDMT1-211ENST00000495022 ZBTB39O15060 712 aa25.13■■□□□ 1.61
TRDMT1-211ENST00000495022 DTNBO60941 627 aa25.13■■□□□ 1.61
TRDMT1-211ENST00000495022 SLITRK3O94933 977 aa25.13■■□□□ 1.61
TRDMT1-211ENST00000495022 LYPLA2O95372 231 aa25.13■■□□□ 1.61
TRDMT1-211ENST00000495022 ALDH2P05091 517 aa25.13■■□□□ 1.61
TRDMT1-211ENST00000495022 PTENP60484 403 aa25.13■■□□□ 1.61
TRDMT1-211ENST00000495022 POU5F1BQ06416 359 aa25.13■■□□□ 1.61
TRDMT1-211ENST00000495022 MTMR3Q13615 1198 aa25.13■■□□□ 1.61
TRDMT1-211ENST00000495022 CABP7Q86V35 215 aa25.13■■□□□ 1.61
TRDMT1-211ENST00000495022 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
TRDMT1-211ENST00000495022 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
TRDMT1-211ENST00000495022 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa25.13■■□□□ 1.61
TRDMT1-211ENST00000495022 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa25.13■■□□□ 1.61
TRDMT1-211ENST00000495022 PCDHA12Q9UN75 941 aa25.13■■□□□ 1.61
TRDMT1-211ENST00000495022 USTQ9Y2C2 406 aa25.13■■□□□ 1.61
TRDMT1-211ENST00000495022 FAN1Q9Y2M0 1017 aa25.13■■□□□ 1.61
TRDMT1-211ENST00000495022 INPPL1O15357 1258 aa25.12■■□□□ 1.61
TRDMT1-211ENST00000495022 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
TRDMT1-211ENST00000495022 NOTUMQ6P988 496 aa25.12■■□□□ 1.61
TRDMT1-211ENST00000495022 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
TRDMT1-211ENST00000495022 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa25.12■■□□□ 1.61
TRDMT1-211ENST00000495022 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
TRDMT1-211ENST00000495022 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
TRDMT1-211ENST00000495022 GTF3C6Q969F1 213 aa25.12■■□□□ 1.61
TRDMT1-211ENST00000495022 HSD17B14Q9BPX1 270 aa25.12■■□□□ 1.61
TRDMT1-211ENST00000495022 SFXN1Q9H9B4 322 aa25.12■■□□□ 1.61
TRDMT1-211ENST00000495022 TSPAN1O60635 241 aa25.11■■□□□ 1.61
TRDMT1-211ENST00000495022 POMCP01189 267 aa25.11■■□□□ 1.61
TRDMT1-211ENST00000495022 WEE2P0C1S8 567 aa25.11■■□□□ 1.61
TRDMT1-211ENST00000495022 ITGA4P13612 1032 aa25.11■■□□□ 1.61
TRDMT1-211ENST00000495022 TFDP1Q14186 410 aa25.11■■□□□ 1.61
TRDMT1-211ENST00000495022 CALCRLQ16602 461 aa25.11■■□□□ 1.61
TRDMT1-211ENST00000495022 PLCD3Q8N3E9 789 aa25.11■■□□□ 1.61
TRDMT1-211ENST00000495022 ANKEF1Q9NU02 776 aa25.11■■□□□ 1.61
TRDMT1-211ENST00000495022 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
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