RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484841.5

ACTB-212, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-212ENST00000484841 JAK2O60674 1132 aa22.44■■□□□ 1.18
ACTB-212ENST00000484841 DGAT1O75907 488 aa22.44■■□□□ 1.18
ACTB-212ENST00000484841 GALTP07902 379 aa22.44■■□□□ 1.18
ACTB-212ENST00000484841 AXLP30530 894 aa22.44■■□□□ 1.18
ACTB-212ENST00000484841 KCNC3Q14003 757 aa22.44■■□□□ 1.18
ACTB-212ENST00000484841 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
ACTB-212ENST00000484841 SUSD6Q92537 303 aa22.44■■□□□ 1.18
ACTB-212ENST00000484841 IGSF21Q96ID5 467 aa22.44■■□□□ 1.18
ACTB-212ENST00000484841 SPDYE4A6NLX3 237 aa22.43■■□□□ 1.18
ACTB-212ENST00000484841 MEIS3P2A8K0S8 358 aa22.43■■□□□ 1.18
ACTB-212ENST00000484841 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa22.43■■□□□ 1.18
ACTB-212ENST00000484841 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
ACTB-212ENST00000484841 ALDH2P05091 517 aa22.43■■□□□ 1.18
ACTB-212ENST00000484841 ITGA4P13612 1032 aa22.43■■□□□ 1.18
ACTB-212ENST00000484841 ATP2B1P20020 1258 aa22.43■■□□□ 1.18
ACTB-212ENST00000484841 ITIH3Q06033 890 aa22.43■■□□□ 1.18
ACTB-212ENST00000484841 NOTUMQ6P988 496 aa22.43■■□□□ 1.18
ACTB-212ENST00000484841 SYCE2Q6PIF2 218 aa22.43■■□□□ 1.18
ACTB-212ENST00000484841 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
ACTB-212ENST00000484841 ZBTB33Q86T24 672 aa22.43■■□□□ 1.18
ACTB-212ENST00000484841 HACE1Q8IYU2 909 aa22.43■■□□□ 1.18
ACTB-212ENST00000484841 NECTIN4Q96NY8 510 aa22.43■■□□□ 1.18
ACTB-212ENST00000484841 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
ACTB-212ENST00000484841 ZBP1Q9H171 429 aa22.43■■□□□ 1.18
ACTB-212ENST00000484841 S1PR5Q9H228 398 aa22.43■■□□□ 1.18
ACTB-212ENST00000484841 MINDY3Q9H8M7 445 aa22.43■■□□□ 1.18
ACTB-212ENST00000484841 NR2E1Q9Y466 385 aa22.43■■□□□ 1.18
ACTB-212ENST00000484841 ZBTB39O15060 712 aa22.42■■□□□ 1.18
ACTB-212ENST00000484841 LYPLA2O95372 231 aa22.42■■□□□ 1.18
ACTB-212ENST00000484841 CTSAP10619 480 aa22.42■■□□□ 1.18
ACTB-212ENST00000484841 CCDC51Q96ER9 411 aa22.42■■□□□ 1.18
ACTB-212ENST00000484841 HSD17B14Q9BPX1 270 aa22.42■■□□□ 1.18
ACTB-212ENST00000484841 TMEM175Q9BSA9 504 aa22.42■■□□□ 1.18
ACTB-212ENST00000484841 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa22.42■■□□□ 1.18
ACTB-212ENST00000484841 FAN1Q9Y2M0 1017 aa22.42■■□□□ 1.18
ACTB-212ENST00000484841 POMCP01189 267 aa22.41■■□□□ 1.18
ACTB-212ENST00000484841 NCLP19338 710 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
ACTB-212ENST00000484841 SLC11A1P49279 550 aa22.41■■□□□ 1.18
ACTB-212ENST00000484841 PTENP60484 403 aa22.41■■□□□ 1.18
ACTB-212ENST00000484841 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
ACTB-212ENST00000484841 AGMOQ6ZNB7 445 aa22.41■■□□□ 1.18
ACTB-212ENST00000484841 HFE2Q6ZVN8 426 aa22.41■■□□□ 1.18
ACTB-212ENST00000484841 PPFIBP1Q86W92 1011 aa22.41■■□□□ 1.18
ACTB-212ENST00000484841 RIPOR3Q96MK2 946 aa22.41■■□□□ 1.18
ACTB-212ENST00000484841 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa22.41■■□□□ 1.18
ACTB-212ENST00000484841 KCNH6Q9H252 994 aa22.41■■□□□ 1.18
ACTB-212ENST00000484841 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa22.41■■□□□ 1.18
ACTB-212ENST00000484841 DZANK1Q9NVP4 752 aa22.41■■□□□ 1.18
ACTB-212ENST00000484841 DNAJB4Q9UDY4 337 aa22.41■■□□□ 1.18
ACTB-212ENST00000484841 NR1I2O75469 434 aa22.4■■□□□ 1.18
ACTB-212ENST00000484841 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP22.4■■□□□ 1.184e-22■□□□□ 8.8
ACTB-212ENST00000484841 MCM7P33993 719 aa22.4■■□□□ 1.18
ACTB-212ENST00000484841 MTHFRP42898 656 aa22.4■■□□□ 1.18
ACTB-212ENST00000484841 ZXDAP98168 799 aa22.4■■□□□ 1.18
ACTB-212ENST00000484841 GUCY1B3Q02153 619 aa22.4■■□□□ 1.18
ACTB-212ENST00000484841 POU5F1BQ06416 359 aa22.4■■□□□ 1.18
ACTB-212ENST00000484841 TRIM67Q6ZTA4 783 aa22.4■■□□□ 1.18
ACTB-212ENST00000484841 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
ACTB-212ENST00000484841 ZNF280BQ86YH2 543 aa22.4■■□□□ 1.18
ACTB-212ENST00000484841 ERMNQ8TAM6 284 aa22.4■■□□□ 1.18
ACTB-212ENST00000484841 AUTS2Q8WXX7 1259 aa22.4■■□□□ 1.18
ACTB-212ENST00000484841 C8orf76Q96K31 380 aa22.4■■□□□ 1.18
ACTB-212ENST00000484841 ADAM7Q9H2U9 754 aa22.4■■□□□ 1.18
ACTB-212ENST00000484841 IRAK3Q9Y616 596 aa22.4■■□□□ 1.18
ACTB-212ENST00000484841 TSPAN1O60635 241 aa22.39■■□□□ 1.17
ACTB-212ENST00000484841 SP100P23497 879 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
ACTB-212ENST00000484841 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
ACTB-212ENST00000484841 RARRES1P49788 294 aa22.39■■□□□ 1.17
ACTB-212ENST00000484841 UBXN11Q5T124 520 aa22.39■■□□□ 1.17
ACTB-212ENST00000484841 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
ACTB-212ENST00000484841 FAM184AQ8NB25 1140 aa22.39■■□□□ 1.17
ACTB-212ENST00000484841 PBXIP1Q96AQ6 731 aa22.39■■□□□ 1.17
ACTB-212ENST00000484841 MTMR9Q96QG7 549 aa22.39■■□□□ 1.17
ACTB-212ENST00000484841 CSRNP2Q9H175 543 aa22.39■■□□□ 1.17
ACTB-212ENST00000484841 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa22.39■■□□□ 1.17
ACTB-212ENST00000484841 IPPQ9Y573 584 aa22.39■■□□□ 1.17
ACTB-212ENST00000484841 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
ACTB-212ENST00000484841 TMEM221A6NGB7 291 aa22.38■■□□□ 1.17
ACTB-212ENST00000484841 POTEMA6NI47 508 aa22.38■■□□□ 1.17
ACTB-212ENST00000484841 M0R296 226 aa22.38■■□□□ 1.17
ACTB-212ENST00000484841 DDHD2O94830 711 aa22.38■■□□□ 1.17
ACTB-212ENST00000484841 ATAT1Q5SQI0 421 aa22.38■■□□□ 1.17
ACTB-212ENST00000484841 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
ACTB-212ENST00000484841 CCDC83Q8IWF9 413 aa22.38■■□□□ 1.17
ACTB-212ENST00000484841 PIGOQ8TEQ8 1089 aa22.38■■□□□ 1.17
ACTB-212ENST00000484841 CPB2Q96IY4 423 aa22.38■■□□□ 1.17
ACTB-212ENST00000484841 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
ACTB-212ENST00000484841 APOL6Q9BWW8 343 aa22.38■■□□□ 1.17
ACTB-212ENST00000484841 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
ACTB-212ENST00000484841 TUFT1Q9NNX1 390 aa22.38■■□□□ 1.17
ACTB-212ENST00000484841 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
ACTB-212ENST00000484841 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa22.38■■□□□ 1.17
ACTB-212ENST00000484841 USO1O60763 962 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
ACTB-212ENST00000484841 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP22.37■■□□□ 1.17
ACTB-212ENST00000484841 KLRC2P26717 231 aa22.37■■□□□ 1.17
ACTB-212ENST00000484841 ARL2P36404 184 aa22.37■■□□□ 1.17
ACTB-212ENST00000484841 OR1G1P47890 313 aa22.37■■□□□ 1.17
ACTB-212ENST00000484841 CAPSQ13938 189 aa22.37■■□□□ 1.17
ACTB-212ENST00000484841 TMEM132AQ24JP5 1023 aa22.37■■□□□ 1.17
ACTB-212ENST00000484841 MAEAQ7L5Y9 396 aa22.37■■□□□ 1.17
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