RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475319.1

ECHDC1-215, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, humanhuman

TSL 2

Gene ECHDC1, Length 1,543 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1-215ENST00000475319 INPP5AQ14642 412 aa6.5□□□□□ -1.37
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ECHDC1-215ENST00000475319 FAM182BQ5T319 152 aa6.5□□□□□ -1.37
ECHDC1-215ENST00000475319 FOXB2Q5VYV0 432 aa6.5□□□□□ -1.37
ECHDC1-215ENST00000475319 KIAA1211LQ6NV74 962 aa6.5□□□□□ -1.37
ECHDC1-215ENST00000475319 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
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ECHDC1-215ENST00000475319 SLC22A31A6NKX4 558 aa6.49□□□□□ -1.37
ECHDC1-215ENST00000475319 BECN2A8MW95 431 aa6.49□□□□□ -1.37
ECHDC1-215ENST00000475319 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
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ECHDC1-215ENST00000475319 UBE2HP62256 183 aa6.48□□□□□ -1.37
ECHDC1-215ENST00000475319 KLC1Q07866 573 aa6.48□□□□□ -1.37
ECHDC1-215ENST00000475319 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
ECHDC1-215ENST00000475319 XRCC4Q13426 336 aa6.48□□□□□ -1.37
ECHDC1-215ENST00000475319 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
ECHDC1-215ENST00000475319 C10orf76Q5T2E6 689 aa6.48□□□□□ -1.37
ECHDC1-215ENST00000475319 NCAPH2Q6IBW4 605 aa6.48□□□□□ -1.37
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