RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470089.5

FBXO18-208, Transcript of F-box DNA helicase 1, human

TSL 5

Gene FBXO18, Length 979 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FBXO18-208	ENST00000470089	IFT74	Q96LB3	600 aa		32.39	■■■□□ 2.78
FBXO18-208	ENST00000470089	AK8	Q96MA6	479 aa		32.39	■■■□□ 2.78
FBXO18-208	ENST00000470089	MRPL9	Q9BYD2	267 aa	Known RBP	32.39	■■■□□ 2.78
FBXO18-208	ENST00000470089	NT5C3A	Q9H0P0	336 aa		32.39	■■■□□ 2.78
FBXO18-208	ENST00000470089	CSRNP2	Q9H175	543 aa		32.39	■■■□□ 2.78
FBXO18-208	ENST00000470089	BRWD1	Q9NSI6	2320 aa		32.38	■■■□□ 2.77
FBXO18-208	ENST00000470089	OFD1	O75665	1012 aa		32.38	■■■□□ 2.77
FBXO18-208	ENST00000470089	PPP2R5A	Q15172	486 aa		32.38	■■■□□ 2.77
FBXO18-208	ENST00000470089	PTPA	Q15257	358 aa		32.38	■■■□□ 2.77
FBXO18-208	ENST00000470089	NOMO2	Q5JPE7	1267 aa		32.38	■■■□□ 2.77
FBXO18-208	ENST00000470089	RINT1	Q6NUQ1	792 aa		32.38	■■■□□ 2.77
FBXO18-208	ENST00000470089	SMG8	Q8ND04	991 aa	Known RBP	32.38	■■■□□ 2.77
FBXO18-208	ENST00000470089	CCDC51	Q96ER9	411 aa		32.38	■■■□□ 2.77
FBXO18-208	ENST00000470089	ZNF558	Q96NG5	402 aa		32.38	■■■□□ 2.77
FBXO18-208	ENST00000470089	ASB2	Q96Q27	587 aa		32.38	■■■□□ 2.77
FBXO18-208	ENST00000470089	C2orf40	Q9H1Z8	148 aa		32.38	■■■□□ 2.77
FBXO18-208	ENST00000470089	PRMT7	Q9NVM4	692 aa	Predicted RBP	32.38	■■■□□ 2.77
FBXO18-208	ENST00000470089	COG5	Q9UP83	839 aa		32.38	■■■□□ 2.77
FBXO18-208	ENST00000470089	IPP	Q9Y573	584 aa		32.38	■■■□□ 2.77
FBXO18-208	ENST00000470089	MYH15	Q9Y2K3	1946 aa		32.38	■■■□□ 2.77
FBXO18-208	ENST00000470089	HIP1R	O75146	1068 aa		32.37	■■■□□ 2.77
FBXO18-208	ENST00000470089	NCL	P19338	710 aa	Known RBP	32.37	■■■□□ 2.77
FBXO18-208	ENST00000470089	MARCKS	P29966	332 aa	Predicted RBP	32.37	■■■□□ 2.77
FBXO18-208	ENST00000470089	IRS1	P35568	1242 aa		32.37	■■■□□ 2.77
FBXO18-208	ENST00000470089	UBA7	P41226	1012 aa		32.37	■■■□□ 2.77
FBXO18-208	ENST00000470089	TMEM119	Q4V9L6	283 aa		32.37	■■■□□ 2.77
FBXO18-208	ENST00000470089	TJAP1	Q5JTD0	557 aa		32.37	■■■□□ 2.77
FBXO18-208	ENST00000470089	SPRYD3	Q8NCJ5	442 aa		32.37	■■■□□ 2.77
FBXO18-208	ENST00000470089	RSAD1	Q9HA92	442 aa		32.37	■■■□□ 2.77
FBXO18-208	ENST00000470089	HES2	Q9Y543	173 aa		32.37	■■■□□ 2.77
FBXO18-208	ENST00000470089	TTLL13P	A6NNM8	815 aa		32.36	■■■□□ 2.77
FBXO18-208	ENST00000470089	CSPP1	Q1MSJ5	1256 aa		32.36	■■■□□ 2.77
FBXO18-208	ENST00000470089	PPP4R3CP	Q6ZMV5	832 aa		32.36	■■■□□ 2.77
FBXO18-208	ENST00000470089	C1orf186	Q6ZWK4	172 aa		32.36	■■■□□ 2.77
FBXO18-208	ENST00000470089	DAW1	Q8N136	415 aa		32.36	■■■□□ 2.77
FBXO18-208	ENST00000470089	COL25A1	Q9BXS0	654 aa	Predicted RBP	32.36	■■■□□ 2.77
FBXO18-208	ENST00000470089	TRIM6	Q9C030	488 aa	Predicted RBP	32.36	■■■□□ 2.77
FBXO18-208	ENST00000470089	FZD8	Q9H461	694 aa		32.36	■■■□□ 2.77
FBXO18-208	ENST00000470089	TBC1D13	Q9NVG8	400 aa		32.36	■■■□□ 2.77
FBXO18-208	ENST00000470089	USP20	Q9Y2K6	914 aa		32.36	■■■□□ 2.77
FBXO18-208	ENST00000470089	PCDHGC5	Q9Y5F6	944 aa		32.36	■■■□□ 2.77
FBXO18-208	ENST00000470089	MYH11	P35749	1972 aa		32.36	■■■□□ 2.77
FBXO18-208	ENST00000470089	SPTBN5	Q9NRC6	3674 aa	Known RBP	32.36	■■■□□ 2.77
FBXO18-208	ENST00000470089	DLL1	O00548	723 aa		32.35	■■■□□ 2.77
FBXO18-208	ENST00000470089	NPTXR	O95502	500 aa		32.35	■■■□□ 2.77
FBXO18-208	ENST00000470089	PRKCB	P05771	671 aa		32.35	■■■□□ 2.77
FBXO18-208	ENST00000470089	ITGA4	P13612	1032 aa		32.35	■■■□□ 2.77
FBXO18-208	ENST00000470089	LONP1	P36776	959 aa	Known RBP	32.35	■■■□□ 2.77
FBXO18-208	ENST00000470089	AFF1	P51825	1210 aa	Known RBP	32.35	■■■□□ 2.77
FBXO18-208	ENST00000470089	RAD51AP2	Q09MP3	1159 aa		32.35	■■■□□ 2.77
FBXO18-208	ENST00000470089	FOXD4L5	Q5VV16	416 aa	Predicted RBP	32.35	■■■□□ 2.77
FBXO18-208	ENST00000470089	FOXD4L4	Q8WXT5	416 aa	Predicted RBP	32.35	■■■□□ 2.77
FBXO18-208	ENST00000470089	CALML4	Q96GE6	196 aa		32.35	■■■□□ 2.77
FBXO18-208	ENST00000470089	APOL6	Q9BWW8	343 aa		32.35	■■■□□ 2.77
FBXO18-208	ENST00000470089	CCDC113	Q9H0I3	377 aa		32.35	■■■□□ 2.77
FBXO18-208	ENST00000470089	RNF39	Q9H2S5	420 aa		32.35	■■■□□ 2.77
FBXO18-208	ENST00000470089	ZSCAN16	Q9H4T2	348 aa	Predicted RBP	32.35	■■■□□ 2.77
FBXO18-208	ENST00000470089	UBE2Z	Q9H832	354 aa	Predicted RBP	32.35	■■■□□ 2.77
FBXO18-208	ENST00000470089	TCF20	Q9UGU0	1960 aa	Known RBP	32.35	■■■□□ 2.77
FBXO18-208	ENST00000470089	VCAN	P13611	3396 aa		32.35	■■■□□ 2.77
FBXO18-208	ENST00000470089	NT5C1B-RDH14	C9J2C7	533 aa		32.34	■■■□□ 2.77
FBXO18-208	ENST00000470089	ZC3H11A	O75152	810 aa	Known RBP eCLIP	32.34	■■■□□ 2.77
FBXO18-208	ENST00000470089	PLA2G4B	P0C869	781 aa		32.34	■■■□□ 2.77
FBXO18-208	ENST00000470089	KCNQ1	P51787	676 aa		32.34	■■■□□ 2.77
FBXO18-208	ENST00000470089	PEX3	P56589	373 aa		32.34	■■■□□ 2.77
FBXO18-208	ENST00000470089	MAPK6	Q16659	721 aa		32.34	■■■□□ 2.77
FBXO18-208	ENST00000470089	FAM187B	Q17R55	369 aa		32.34	■■■□□ 2.77
FBXO18-208	ENST00000470089	SLC27A1	Q6PCB7	646 aa		32.34	■■■□□ 2.77
FBXO18-208	ENST00000470089	SYT2	Q8N9I0	419 aa	Predicted RBP	32.34	■■■□□ 2.77
FBXO18-208	ENST00000470089	CNNM3	Q8NE01	707 aa		32.34	■■■□□ 2.77
FBXO18-208	ENST00000470089	PRIMPOL	Q96LW4	560 aa		32.34	■■■□□ 2.77
FBXO18-208	ENST00000470089	USP28	Q96RU2	1077 aa		32.34	■■■□□ 2.77
FBXO18-208	ENST00000470089	GBP3	Q9H0R5	595 aa		32.34	■■■□□ 2.77
FBXO18-208	ENST00000470089	NXF3	Q9H4D5	531 aa	Known RBP	32.34	■■■□□ 2.77
FBXO18-208	ENST00000470089	CNTNAP2	Q9UHC6	1331 aa		32.33	■■■□□ 2.77
FBXO18-208	ENST00000470089		A0A1B0GUA9	196 aa		32.33	■■■□□ 2.77
FBXO18-208	ENST00000470089	CCDC169	A6NNP5	214 aa		32.33	■■■□□ 2.77
FBXO18-208	ENST00000470089	EDN1	P05305	212 aa		32.33	■■■□□ 2.77
FBXO18-208	ENST00000470089	SLC12A3	P55017	1021 aa		32.33	■■■□□ 2.77
FBXO18-208	ENST00000470089	BCAR1	P56945	870 aa		32.33	■■■□□ 2.77
FBXO18-208	ENST00000470089	RNASEL	Q05823	741 aa	Known RBP	32.33	■■■□□ 2.77
FBXO18-208	ENST00000470089	MAPK7	Q13164	816 aa		32.33	■■■□□ 2.77
FBXO18-208	ENST00000470089	PRPF4B	Q13523	1007 aa	Known RBP	32.33	■■■□□ 2.77
FBXO18-208	ENST00000470089	KARS	Q15046	597 aa	Known RBP	32.33	■■■□□ 2.77
FBXO18-208	ENST00000470089	TMEM132A	Q24JP5	1023 aa		32.33	■■■□□ 2.77
FBXO18-208	ENST00000470089	SPECC1	Q5M775	1068 aa		32.33	■■■□□ 2.77
FBXO18-208	ENST00000470089	EP400NL	Q6ZTU2	488 aa		32.33	■■■□□ 2.77
FBXO18-208	ENST00000470089	URGCP	Q8TCY9	931 aa		32.33	■■■□□ 2.77
FBXO18-208	ENST00000470089	LRRC15	Q8TF66	581 aa		32.33	■■■□□ 2.77
FBXO18-208	ENST00000470089	NRDE2	Q9H7Z3	1164 aa		32.33	■■■□□ 2.77
FBXO18-208	ENST00000470089	SPG21	Q9NZD8	308 aa		32.33	■■■□□ 2.77
FBXO18-208	ENST00000470089	SFI1	A8K8P3	1242 aa		32.32	■■■□□ 2.76
FBXO18-208	ENST00000470089	GTF2F1	P35269	517 aa	Known RBP eCLIP	32.32	■■■□□ 2.76	1e-9	■■■■■ 27.4
FBXO18-208	ENST00000470089	UBE3A	Q05086	875 aa		32.32	■■■□□ 2.76
FBXO18-208	ENST00000470089	HYAL1	Q12794	435 aa		32.32	■■■□□ 2.76
FBXO18-208	ENST00000470089	ADGRD2	Q7Z7M1	963 aa		32.32	■■■□□ 2.76
FBXO18-208	ENST00000470089	KCTD17	Q8N5Z5	321 aa		32.32	■■■□□ 2.76
FBXO18-208	ENST00000470089	RASSF8	Q8NHQ8	419 aa		32.32	■■■□□ 2.76
FBXO18-208	ENST00000470089	MICAL1	Q8TDZ2	1067 aa		32.32	■■■□□ 2.76
FBXO18-208	ENST00000470089	RSPH1	Q8WYR4	309 aa		32.32	■■■□□ 2.76

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.2 ms