RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466222.6

CAPN3-209, Transcript of calpain 3, humanhuman

TSL 2

Gene CAPN3, Length 1,934 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3-209ENST00000466222 MFAP3LO75121 409 aa20.35■□□□□ 0.85
CAPN3-209ENST00000466222 MAPTP10636 758 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
CAPN3-209ENST00000466222 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa20.35■□□□□ 0.85
CAPN3-209ENST00000466222 KRT31Q15323 416 aa20.35■□□□□ 0.85
CAPN3-209ENST00000466222 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
CAPN3-209ENST00000466222 TSG101Q99816 390 aa20.35■□□□□ 0.85
CAPN3-209ENST00000466222 CARD6Q9BX69 1037 aa20.35■□□□□ 0.85
CAPN3-209ENST00000466222 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
CAPN3-209ENST00000466222 TAB2Q9NYJ8 693 aa20.35■□□□□ 0.85
CAPN3-209ENST00000466222 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
CAPN3-209ENST00000466222 TBX20Q9UMR3 447 aa20.35■□□□□ 0.85
CAPN3-209ENST00000466222 MRFAP1Q9Y605 127 aa20.35■□□□□ 0.85
CAPN3-209ENST00000466222 PDXKO00764 312 aa20.35■□□□□ 0.85
CAPN3-209ENST00000466222 CLCN6P51797 869 aa20.35■□□□□ 0.85
CAPN3-209ENST00000466222 ADAM9Q13443 819 aa20.35■□□□□ 0.85
CAPN3-209ENST00000466222 ARHGEF6Q15052 776 aa20.35■□□□□ 0.85
CAPN3-209ENST00000466222 IER5Q5VY09 327 aa20.35■□□□□ 0.85
CAPN3-209ENST00000466222 SYCP3Q8IZU3 236 aa20.35■□□□□ 0.85
CAPN3-209ENST00000466222 SLAIN1Q8ND83 568 aa20.35■□□□□ 0.85
CAPN3-209ENST00000466222 VPS16Q9H269 839 aa20.35■□□□□ 0.85
CAPN3-209ENST00000466222 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa20.35■□□□□ 0.85
CAPN3-209ENST00000466222 THAP9Q9H5L6 903 aa20.35■□□□□ 0.85
CAPN3-209ENST00000466222 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
CAPN3-209ENST00000466222 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa20.35■□□□□ 0.85
CAPN3-209ENST00000466222 FANCGO15287 622 aa20.34■□□□□ 0.85
CAPN3-209ENST00000466222 TEX33O43247 280 aa20.34■□□□□ 0.85
CAPN3-209ENST00000466222 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
CAPN3-209ENST00000466222 VTNP04004 478 aa20.34■□□□□ 0.85
CAPN3-209ENST00000466222 EDN1P05305 212 aa20.34■□□□□ 0.85
CAPN3-209ENST00000466222 NR2F2P24468 414 aa20.34■□□□□ 0.85
CAPN3-209ENST00000466222 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
CAPN3-209ENST00000466222 KCNA10Q16322 511 aa20.34■□□□□ 0.85
CAPN3-209ENST00000466222 TMCO3Q6UWJ1 677 aa20.34■□□□□ 0.85
CAPN3-209ENST00000466222 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
CAPN3-209ENST00000466222 RNF149Q8NC42 400 aa20.34■□□□□ 0.85
CAPN3-209ENST00000466222 LRRN4CLQ8ND94 238 aa20.34■□□□□ 0.85
CAPN3-209ENST00000466222 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
CAPN3-209ENST00000466222 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
CAPN3-209ENST00000466222 NLRP4Q96MN2 994 aa20.34■□□□□ 0.85
CAPN3-209ENST00000466222 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa20.34■□□□□ 0.85
CAPN3-209ENST00000466222 PPME1Q9Y570 386 aa20.34■□□□□ 0.85
CAPN3-209ENST00000466222 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
CAPN3-209ENST00000466222 ANKRD63C9JTQ0 380 aa20.33■□□□□ 0.85
CAPN3-209ENST00000466222 NAMPTP43490 491 aa20.33■□□□□ 0.85
CAPN3-209ENST00000466222 CASP4P49662 377 aa20.33■□□□□ 0.85
CAPN3-209ENST00000466222 TUBB4BP68371 445 aa20.33■□□□□ 0.85
CAPN3-209ENST00000466222 RBL2Q08999 1139 aa20.33■□□□□ 0.85
CAPN3-209ENST00000466222 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa20.33■□□□□ 0.85
CAPN3-209ENST00000466222 LINC01465Q8N7H1 131 aa20.33■□□□□ 0.85
CAPN3-209ENST00000466222 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa20.33■□□□□ 0.85
CAPN3-209ENST00000466222 GBP3Q9H0R5 595 aa20.33■□□□□ 0.85
CAPN3-209ENST00000466222 SPC25Q9HBM1 224 aa20.33■□□□□ 0.85
CAPN3-209ENST00000466222 ZNF446Q9NWS9 450 aa20.33■□□□□ 0.85
CAPN3-209ENST00000466222 HDAC6Q9UBN7 1215 aa20.33■□□□□ 0.85
CAPN3-209ENST00000466222 TTLL13PA6NNM8 815 aa20.33■□□□□ 0.84
CAPN3-209ENST00000466222 NR3C1P04150 777 aa20.33■□□□□ 0.84
CAPN3-209ENST00000466222 ASGR1P07306 291 aa20.33■□□□□ 0.84
CAPN3-209ENST00000466222 PPP2R3AQ06190 1150 aa20.33■□□□□ 0.84
CAPN3-209ENST00000466222 LHX8Q68G74 356 aa20.33■□□□□ 0.84
CAPN3-209ENST00000466222 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.84
CAPN3-209ENST00000466222 KLHDC9Q8NEP7 349 aa20.33■□□□□ 0.84
CAPN3-209ENST00000466222 DEPTORQ8TB45 409 aa20.33■□□□□ 0.84
CAPN3-209ENST00000466222 ACCSQ96QU6 501 aa20.33■□□□□ 0.84
CAPN3-209ENST00000466222 PCIF1Q9H4Z3 704 aa20.33■□□□□ 0.84
CAPN3-209ENST00000466222 PTPN22Q9Y2R2 807 aa20.33■□□□□ 0.84
CAPN3-209ENST00000466222 ADGRG1Q9Y653 693 aa20.33■□□□□ 0.84
CAPN3-209ENST00000466222 TREHO43280 583 aa20.32■□□□□ 0.84
CAPN3-209ENST00000466222 AKAP3O75969 853 aa20.32■□□□□ 0.84
CAPN3-209ENST00000466222 EDRF1Q3B7T1 1238 aa20.32■□□□□ 0.84
CAPN3-209ENST00000466222 NFRKBQ6P4R8 1299 aa20.32■□□□□ 0.84
CAPN3-209ENST00000466222 RUFY4Q6ZNE9 571 aa20.32■□□□□ 0.84
CAPN3-209ENST00000466222 TMTC1Q8IUR5 882 aa20.32■□□□□ 0.84
CAPN3-209ENST00000466222 MAP4K3Q8IVH8 894 aa20.32■□□□□ 0.84
CAPN3-209ENST00000466222 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa20.32■□□□□ 0.84
CAPN3-209ENST00000466222 WDR24Q96S15 920 aa20.32■□□□□ 0.84
CAPN3-209ENST00000466222 CBWD1Q9BRT8 395 aa20.32■□□□□ 0.84
CAPN3-209ENST00000466222 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
CAPN3-209ENST00000466222 CALUO43852 315 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
CAPN3-209ENST00000466222 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP20.31■□□□□ 0.84
CAPN3-209ENST00000466222 ADSSP30520 456 aa20.31■□□□□ 0.84
CAPN3-209ENST00000466222 CYP2J2P51589 502 aa20.31■□□□□ 0.84
CAPN3-209ENST00000466222 TMEM62Q0P6H9 643 aa20.31■□□□□ 0.84
CAPN3-209ENST00000466222 SLC39A4Q6P5W5 647 aa20.31■□□□□ 0.84
CAPN3-209ENST00000466222 RETREG2Q8NC44 543 aa20.31■□□□□ 0.84
CAPN3-209ENST00000466222 TCP11Q8WWU5 503 aa20.31■□□□□ 0.84
CAPN3-209ENST00000466222 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
CAPN3-209ENST00000466222 MINDY3Q9H8M7 445 aa20.31■□□□□ 0.84
CAPN3-209ENST00000466222 AKT3Q9Y243 479 aa20.31■□□□□ 0.84
CAPN3-209ENST00000466222 NRCAMQ92823 1304 aa20.31■□□□□ 0.84
CAPN3-209ENST00000466222 MAGEB2O15479 319 aa20.31■□□□□ 0.84
CAPN3-209ENST00000466222 KIF5CO60282 957 aa20.31■□□□□ 0.84
CAPN3-209ENST00000466222 DNM2P50570 870 aa20.31■□□□□ 0.84
CAPN3-209ENST00000466222 PRMT2P55345 433 aa20.31■□□□□ 0.84
CAPN3-209ENST00000466222 NKX3-2P78367 333 aa20.31■□□□□ 0.84
CAPN3-209ENST00000466222 ADAM17P78536 824 aa20.31■□□□□ 0.84
CAPN3-209ENST00000466222 MTFR1Q15390 333 aa20.31■□□□□ 0.84
CAPN3-209ENST00000466222 NBPF20Q3BBV1 942 aa20.31■□□□□ 0.84
CAPN3-209ENST00000466222 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
CAPN3-209ENST00000466222 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
CAPN3-209ENST00000466222 RABGGTAQ92696 567 aa20.31■□□□□ 0.84
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