RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 ITGB1P05556 798 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-206ENST00000461017 STAG3L1P0CL83 205 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-206ENST00000461017 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-206ENST00000461017 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-206ENST00000461017 MUTP22033 750 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-206ENST00000461017 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-206ENST00000461017 CTNNB1P35222 781 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-206ENST00000461017 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-206ENST00000461017 IRS1P35568 1242 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-206ENST00000461017 PBX3P40426 434 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-206ENST00000461017 PHKA2P46019 1235 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC12A3P55017 1021 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-206ENST00000461017 TFF2Q03403 129 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-206ENST00000461017 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-206ENST00000461017 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM119Q4V9L6 283 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-206ENST00000461017 ARSHQ5FYA8 562 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-206ENST00000461017 ODR4Q5SWX8 454 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-206ENST00000461017 RINT1Q6NUQ1 792 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-206ENST00000461017 C1orf186Q6ZWK4 172 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-206ENST00000461017 TAS1R3Q7RTX0 852 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-206ENST00000461017 CATSPER4Q7RTX7 472 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-206ENST00000461017 BRAPQ7Z569 592 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-206ENST00000461017 KLHL23Q8NBE8 558 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-206ENST00000461017 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-206ENST00000461017 SPPL3Q8TCT6 385 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-206ENST00000461017 HELQQ8TDG4 1101 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-206ENST00000461017 TCP11Q8WWU5 503 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-206ENST00000461017 EPSTI1Q96J88 318 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-206ENST00000461017 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-206ENST00000461017 KIFC3Q9BVG8 833 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-206ENST00000461017 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM105AQ9NUU6 356 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-206ENST00000461017 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-206ENST00000461017 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-206ENST00000461017 LRFN2Q9ULH4 789 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-206ENST00000461017 PLAGL2Q9UPG8 496 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-206ENST00000461017 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-206ENST00000461017 HES2Q9Y543 173 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-206ENST00000461017 VWA8A3KMH1 1905 aa7.78□□□□□ -1.16
RABGEF1-206ENST00000461017 A0A087X0B3 334 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-206ENST00000461017 ARHGEF35A5YM69 484 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-206ENST00000461017 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-206ENST00000461017 LAD1O00515 517 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-206ENST00000461017 OFD1O75665 1012 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-206ENST00000461017 CDC42EP1Q00587 391 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-206ENST00000461017 POU5F1BQ06416 359 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-206ENST00000461017 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-206ENST00000461017 KARSQ15046 597 aaKnown RBP7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-206ENST00000461017 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-206ENST00000461017 NT5DC1Q5TFE4 455 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-206ENST00000461017 KRT79Q5XKE5 535 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-206ENST00000461017 EEF1DP3Q658K8 133 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-206ENST00000461017 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-206ENST00000461017 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-206ENST00000461017 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-206ENST00000461017 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-206ENST00000461017 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-206ENST00000461017 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-206ENST00000461017 CABP7Q86V35 215 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-206ENST00000461017 EXOC8Q8IYI6 725 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF710Q8N1W2 664 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-206ENST00000461017 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-206ENST00000461017 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-206ENST00000461017 RNF169Q8NCN4 708 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-206ENST00000461017 ERMNQ8TAM6 284 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-206ENST00000461017 TRAIPQ9BWF2 469 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-206ENST00000461017 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-206ENST00000461017 CCDC113Q9H0I3 377 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-206ENST00000461017 CSRNP2Q9H175 543 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-206ENST00000461017 FZD8Q9H461 694 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-206ENST00000461017 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-206ENST00000461017 CHST12Q9NRB3 414 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-206ENST00000461017 ZDHHC9Q9Y397 364 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-206ENST00000461017 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-206ENST00000461017 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-206ENST00000461017 PLXNA3P51805 1871 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGEF1-206ENST00000461017 MYO10Q9HD67 2058 aa7.76□□□□□ -1.17
RABGEF1-206ENST00000461017 LRRIQ4A6NIV6 560 aa7.76□□□□□ -1.17
RABGEF1-206ENST00000461017 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa7.76□□□□□ -1.17
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF623O75123 536 aa7.76□□□□□ -1.17
RABGEF1-206ENST00000461017 HIP1RO75146 1068 aa7.76□□□□□ -1.17
RABGEF1-206ENST00000461017 DDHD2O94830 711 aa7.76□□□□□ -1.17
RABGEF1-206ENST00000461017 EOMESO95936 686 aa7.76□□□□□ -1.17
RABGEF1-206ENST00000461017 RB1P06400 928 aa7.76□□□□□ -1.17
RABGEF1-206ENST00000461017 PLA2G4BP0C869 781 aa7.76□□□□□ -1.17
RABGEF1-206ENST00000461017 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP7.76□□□□□ -1.17
RABGEF1-206ENST00000461017 ERVFC1P60507 584 aa7.76□□□□□ -1.17
RABGEF1-206ENST00000461017 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa7.76□□□□□ -1.17
RABGEF1-206ENST00000461017 MCM6Q14566 821 aa7.76□□□□□ -1.17
RABGEF1-206ENST00000461017 TCEAL5Q5H9L2 206 aa7.76□□□□□ -1.17
RABGEF1-206ENST00000461017 HAUS3Q68CZ6 603 aa7.76□□□□□ -1.17
RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP7.76□□□□□ -1.17
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF280BQ86YH2 543 aa7.76□□□□□ -1.17
RABGEF1-206ENST00000461017 HSCBQ8IWL3 235 aa7.76□□□□□ -1.17
RABGEF1-206ENST00000461017 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP7.76□□□□□ -1.17
RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM130Q8N3G9 435 aa7.76□□□□□ -1.17
RABGEF1-206ENST00000461017 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP7.76□□□□□ -1.17
RABGEF1-206ENST00000461017 POF1BQ8WVV4 589 aa7.76□□□□□ -1.17
RABGEF1-206ENST00000461017 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP7.76□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.6 ms