RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446904.5

SH3BP4-206, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 829 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-206ENST00000446904 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
SH3BP4-206ENST00000446904 TPRNQ4KMQ1 711 aa11.5□□□□□ -0.57
SH3BP4-206ENST00000446904 UBXN11Q5T124 520 aa11.5□□□□□ -0.57
SH3BP4-206ENST00000446904 AGMOQ6ZNB7 445 aa11.5□□□□□ -0.57
SH3BP4-206ENST00000446904 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
SH3BP4-206ENST00000446904 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
SH3BP4-206ENST00000446904 FERMT3Q86UX7 667 aa11.5□□□□□ -0.57
SH3BP4-206ENST00000446904 ZNF280BQ86YH2 543 aa11.5□□□□□ -0.57
SH3BP4-206ENST00000446904 EXOC8Q8IYI6 725 aa11.5□□□□□ -0.57
SH3BP4-206ENST00000446904 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
SH3BP4-206ENST00000446904 RNF149Q8NC42 400 aa11.5□□□□□ -0.57
SH3BP4-206ENST00000446904 URGCPQ8TCY9 931 aa11.5□□□□□ -0.57
SH3BP4-206ENST00000446904 TCP11Q8WWU5 503 aa11.5□□□□□ -0.57
SH3BP4-206ENST00000446904 RSPH1Q8WYR4 309 aa11.5□□□□□ -0.57
SH3BP4-206ENST00000446904 TNFRSF25Q93038 417 aa11.5□□□□□ -0.57
SH3BP4-206ENST00000446904 GTF3C6Q969F1 213 aa11.5□□□□□ -0.57
SH3BP4-206ENST00000446904 PBXIP1Q96AQ6 731 aa11.5□□□□□ -0.57
SH3BP4-206ENST00000446904 PGBD4Q96DM1 585 aa11.5□□□□□ -0.57
SH3BP4-206ENST00000446904 VN1R3Q9BXE9 311 aa11.5□□□□□ -0.57
SH3BP4-206ENST00000446904 BRMS1Q9HCU9 246 aa11.5□□□□□ -0.57
SH3BP4-206ENST00000446904 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa11.5□□□□□ -0.57
SH3BP4-206ENST00000446904 ASAP2O43150 1006 aa11.49□□□□□ -0.57
SH3BP4-206ENST00000446904 JAK2O60674 1132 aa11.49□□□□□ -0.57
SH3BP4-206ENST00000446904 WEE2P0C1S8 567 aa11.49□□□□□ -0.57
SH3BP4-206ENST00000446904 EPCAMP16422 314 aa11.49□□□□□ -0.57
SH3BP4-206ENST00000446904 CALCRLQ16602 461 aa11.49□□□□□ -0.57
SH3BP4-206ENST00000446904 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
SH3BP4-206ENST00000446904 CES5AQ6NT32 575 aa11.49□□□□□ -0.57
SH3BP4-206ENST00000446904 KANK3Q6NY19 840 aa11.49□□□□□ -0.57
SH3BP4-206ENST00000446904 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
SH3BP4-206ENST00000446904 MTRQ99707 1265 aa11.49□□□□□ -0.57
SH3BP4-206ENST00000446904 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
SH3BP4-206ENST00000446904 ADAM7Q9H2U9 754 aa11.49□□□□□ -0.57
SH3BP4-206ENST00000446904 RSAD1Q9HA92 442 aa11.49□□□□□ -0.57
SH3BP4-206ENST00000446904 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa11.49□□□□□ -0.57
SH3BP4-206ENST00000446904 PPP4R2Q9NY27 417 aa11.49□□□□□ -0.57
SH3BP4-206ENST00000446904 A0A087WWV3 80 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP4-206ENST00000446904 BTBD18B2RXH4 712 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP4-206ENST00000446904 WNT7AO00755 349 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP4-206ENST00000446904 GAS2O43903 313 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
SH3BP4-206ENST00000446904 TSPAN1O60635 241 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP4-206ENST00000446904 DDHD2O94830 711 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP4-206ENST00000446904 ERLIN2O94905 339 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP4-206ENST00000446904 POMCP01189 267 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP4-206ENST00000446904 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP11.48□□□□□ -0.57
SH3BP4-206ENST00000446904 CTSAP10619 480 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP4-206ENST00000446904 TXKP42681 527 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP4-206ENST00000446904 NEK4P51957 841 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP4-206ENST00000446904 NHLH1Q02575 133 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP4-206ENST00000446904 ITIH3Q06033 890 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP4-206ENST00000446904 SIGLEC14Q08ET2 396 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP4-206ENST00000446904 PTPN14Q15678 1187 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP4-206ENST00000446904 PTPN21Q16825 1174 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP4-206ENST00000446904 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP4-206ENST00000446904 ZBTB33Q86T24 672 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP4-206ENST00000446904 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
SH3BP4-206ENST00000446904 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
SH3BP4-206ENST00000446904 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
SH3BP4-206ENST00000446904 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
SH3BP4-206ENST00000446904 NECTIN4Q96NY8 510 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP4-206ENST00000446904 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
SH3BP4-206ENST00000446904 HSD17B14Q9BPX1 270 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP4-206ENST00000446904 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
SH3BP4-206ENST00000446904 POMKQ9H5K3 350 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP4-206ENST00000446904 DZANK1Q9NVP4 752 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP4-206ENST00000446904 PCDHA12Q9UN75 941 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP4-206ENST00000446904 NR2E1Q9Y466 385 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP4-206ENST00000446904 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP4-206ENST00000446904 CARNS1A5YM72 827 aa11.47□□□□□ -0.57
SH3BP4-206ENST00000446904 C2CD4DB7Z1M9 353 aa11.47□□□□□ -0.57
SH3BP4-206ENST00000446904 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa11.47□□□□□ -0.57
SH3BP4-206ENST00000446904 NEMFO60524 1076 aa11.47□□□□□ -0.57
SH3BP4-206ENST00000446904 LYPLA2O95372 231 aa11.47□□□□□ -0.57
SH3BP4-206ENST00000446904 ALDH2P05091 517 aa11.47□□□□□ -0.57
SH3BP4-206ENST00000446904 ITGA4P13612 1032 aa11.47□□□□□ -0.57
SH3BP4-206ENST00000446904 NCLP19338 710 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
SH3BP4-206ENST00000446904 ATP2B1P20020 1258 aa11.47□□□□□ -0.57
SH3BP4-206ENST00000446904 MTHFRP42898 656 aa11.47□□□□□ -0.57
SH3BP4-206ENST00000446904 PTENP60484 403 aa11.47□□□□□ -0.57
SH3BP4-206ENST00000446904 TRIM29Q14134 588 aa11.47□□□□□ -0.57
SH3BP4-206ENST00000446904 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
SH3BP4-206ENST00000446904 IER5LQ5T953 404 aa11.47□□□□□ -0.57
SH3BP4-206ENST00000446904 TMC5Q6UXY8 1006 aa11.47□□□□□ -0.57
SH3BP4-206ENST00000446904 FBXL6Q8N531 539 aa11.47□□□□□ -0.57
SH3BP4-206ENST00000446904 KREMEN2Q8NCW0 462 aa11.47□□□□□ -0.57
SH3BP4-206ENST00000446904 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
SH3BP4-206ENST00000446904 ASAP3Q8TDY4 903 aa11.47□□□□□ -0.57
SH3BP4-206ENST00000446904 SLC22A17Q8WUG5 538 aa11.47□□□□□ -0.57
SH3BP4-206ENST00000446904 CPB2Q96IY4 423 aa11.47□□□□□ -0.57
SH3BP4-206ENST00000446904 RIPOR3Q96MK2 946 aa11.47□□□□□ -0.57
SH3BP4-206ENST00000446904 TMEM175Q9BSA9 504 aa11.47□□□□□ -0.57
SH3BP4-206ENST00000446904 APOL6Q9BWW8 343 aa11.47□□□□□ -0.57
SH3BP4-206ENST00000446904 KCNH6Q9H252 994 aa11.47□□□□□ -0.57
SH3BP4-206ENST00000446904 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
SH3BP4-206ENST00000446904 KANSL3Q9P2N6 904 aa11.47□□□□□ -0.57
SH3BP4-206ENST00000446904 FAN1Q9Y2M0 1017 aa11.47□□□□□ -0.57
SH3BP4-206ENST00000446904 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
SH3BP4-206ENST00000446904 HES2Q9Y543 173 aa11.47□□□□□ -0.57
SH3BP4-206ENST00000446904 IPPQ9Y573 584 aa11.47□□□□□ -0.57
SH3BP4-206ENST00000446904 IRAK3Q9Y616 596 aa11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.7 ms