RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429504.6

CERS1-201, Transcript of ceramide synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CERS1, Length 2,094 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CERS1-201ENST00000429504 ALS2CLQ60I27 953 aa29.94■■■□□ 2.38
CERS1-201ENST00000429504 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa29.94■■■□□ 2.38
CERS1-201ENST00000429504 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP29.94■■■□□ 2.38
CERS1-201ENST00000429504 KIFAP3Q92845 792 aa29.94■■■□□ 2.38
CERS1-201ENST00000429504 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP29.94■■■□□ 2.38
CERS1-201ENST00000429504 AGPAT1Q99943 283 aa29.94■■■□□ 2.38
CERS1-201ENST00000429504 NPTX2P47972 431 aa29.93■■■□□ 2.38
CERS1-201ENST00000429504 CARSP49589 748 aaKnown RBP29.93■■■□□ 2.38
CERS1-201ENST00000429504 PPATQ06203 517 aa29.93■■■□□ 2.38
CERS1-201ENST00000429504 TAF3Q5VWG9 929 aa29.93■■■□□ 2.38
CERS1-201ENST00000429504 OTUD6AQ7L8S5 288 aa29.93■■■□□ 2.38
CERS1-201ENST00000429504 ARHGEF19Q8IW93 802 aa29.93■■■□□ 2.38
CERS1-201ENST00000429504 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa29.93■■■□□ 2.38
CERS1-201ENST00000429504 AFAP1L1Q8TED9 768 aa29.93■■■□□ 2.38
CERS1-201ENST00000429504 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP29.93■■■□□ 2.38
CERS1-201ENST00000429504 OSGEPQ9NPF4 335 aa29.93■■■□□ 2.38
CERS1-201ENST00000429504 AMFRQ9UKV5 643 aa29.93■■■□□ 2.38
CERS1-201ENST00000429504 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP29.93■■■□□ 2.38
CERS1-201ENST00000429504 C19orf81C9J6K1 198 aa29.92■■■□□ 2.38
CERS1-201ENST00000429504 RAD51CO43502 376 aa29.92■■■□□ 2.38
CERS1-201ENST00000429504 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP29.92■■■□□ 2.38
CERS1-201ENST00000429504 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP29.92■■■□□ 2.38
CERS1-201ENST00000429504 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP29.92■■■□□ 2.38
CERS1-201ENST00000429504 SPIRE2Q8WWL2 714 aa29.92■■■□□ 2.38
CERS1-201ENST00000429504 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP29.92■■■□□ 2.38
CERS1-201ENST00000429504 ATP6V0A1Q93050 837 aa29.92■■■□□ 2.38
CERS1-201ENST00000429504 TMEM117Q9H0C3 514 aa29.92■■■□□ 2.38
CERS1-201ENST00000429504 LOC285556D6RIA3 1793 aa29.92■■■□□ 2.38
CERS1-201ENST00000429504 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa29.92■■■□□ 2.38
CERS1-201ENST00000429504 CCDC188H7C350 402 aa29.92■■■□□ 2.38
CERS1-201ENST00000429504 ATP2A1O14983 1001 aa29.92■■■□□ 2.38
CERS1-201ENST00000429504 ADRB2P07550 413 aa29.92■■■□□ 2.38
CERS1-201ENST00000429504 KCNA2P16389 499 aa29.92■■■□□ 2.38
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CERS1-201ENST00000429504 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP29.92■■■□□ 2.38
CERS1-201ENST00000429504 SH3GL2Q99962 352 aa29.92■■■□□ 2.38
CERS1-201ENST00000429504 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP29.92■■■□□ 2.38
CERS1-201ENST00000429504 NFU1Q9UMS0 254 aa29.92■■■□□ 2.38
CERS1-201ENST00000429504 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP29.91■■■□□ 2.38
CERS1-201ENST00000429504 CCDC169A6NNP5 214 aa29.91■■■□□ 2.38
CERS1-201ENST00000429504 ADSSP30520 456 aa29.91■■■□□ 2.38
CERS1-201ENST00000429504 HMGCS2P54868 508 aa29.91■■■□□ 2.38
CERS1-201ENST00000429504 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa29.91■■■□□ 2.38
CERS1-201ENST00000429504 NFASCO94856 1347 aa29.91■■■□□ 2.38
CERS1-201ENST00000429504 ABCB4P21439 1286 aa29.91■■■□□ 2.38
CERS1-201ENST00000429504 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP29.91■■■□□ 2.38
CERS1-201ENST00000429504 PALB2Q86YC2 1186 aa29.91■■■□□ 2.38
CERS1-201ENST00000429504 MREGQ8N565 214 aa29.91■■■□□ 2.38
CERS1-201ENST00000429504 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP29.91■■■□□ 2.38
CERS1-201ENST00000429504 MAF1Q9H063 256 aa29.91■■■□□ 2.38
CERS1-201ENST00000429504 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP29.91■■■□□ 2.38
CERS1-201ENST00000429504 TAS2R14Q9NYV8 317 aa29.91■■■□□ 2.38
CERS1-201ENST00000429504 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP29.91■■■□□ 2.38
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CERS1-201ENST00000429504 PTPROQ16827 1216 aa29.9■■■□□ 2.38
CERS1-201ENST00000429504 KLHL7Q8IXQ5 586 aa29.9■■■□□ 2.38
CERS1-201ENST00000429504 WHAMMQ8TF30 809 aa29.9■■■□□ 2.38
CERS1-201ENST00000429504 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa29.9■■■□□ 2.38
CERS1-201ENST00000429504 CDHR1Q96JP9 859 aa29.9■■■□□ 2.38
CERS1-201ENST00000429504 KMT5AQ9NQR1 393 aa29.9■■■□□ 2.38
CERS1-201ENST00000429504 GABBR1Q9UBS5 961 aa29.9■■■□□ 2.38
CERS1-201ENST00000429504 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP29.9■■■□□ 2.38
CERS1-201ENST00000429504 LCTP09848 1927 aa29.9■■■□□ 2.38
CERS1-201ENST00000429504 ESYT3A0FGR9 886 aa29.89■■■□□ 2.38
CERS1-201ENST00000429504 CAPN2P17655 700 aa29.89■■■□□ 2.38
CERS1-201ENST00000429504 CNGA1P29973 690 aa29.89■■■□□ 2.38
CERS1-201ENST00000429504 RHOT2Q8IXI1 618 aa29.89■■■□□ 2.38
CERS1-201ENST00000429504 THAP2Q9H0W7 228 aa29.89■■■□□ 2.38
CERS1-201ENST00000429504 BCS1LQ9Y276 419 aa29.89■■■□□ 2.38
CERS1-201ENST00000429504 DENND3A2RUS2 1198 aa29.89■■■□□ 2.37
CERS1-201ENST00000429504 ANKRD63C9JTQ0 380 aa29.89■■■□□ 2.37
CERS1-201ENST00000429504 ZNF862O60290 1169 aa29.89■■■□□ 2.37
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CERS1-201ENST00000429504 STAM2O75886 525 aa29.89■■■□□ 2.37
CERS1-201ENST00000429504 RGS20O76081 388 aa29.89■■■□□ 2.37
CERS1-201ENST00000429504 STBD1O95210 358 aa29.89■■■□□ 2.37
CERS1-201ENST00000429504 ACTN2P35609 894 aa29.89■■■□□ 2.37
CERS1-201ENST00000429504 CBWD2Q8IUF1 395 aa29.89■■■□□ 2.37
CERS1-201ENST00000429504 IFT81Q8WYA0 676 aa29.89■■■□□ 2.37
CERS1-201ENST00000429504 ARHGEF26Q96DR7 871 aa29.89■■■□□ 2.37
CERS1-201ENST00000429504 CEP170P1Q96L14 293 aa29.89■■■□□ 2.37
CERS1-201ENST00000429504 TEX13BQ9BXU2 312 aa29.89■■■□□ 2.37
CERS1-201ENST00000429504 HSF2BPO75031 334 aa29.88■■■□□ 2.37
CERS1-201ENST00000429504 PSAPP07602 524 aa29.88■■■□□ 2.37
CERS1-201ENST00000429504 TMEM132BQ14DG7 1078 aa29.88■■■□□ 2.37
CERS1-201ENST00000429504 TCEAL1Q15170 157 aa29.88■■■□□ 2.37
CERS1-201ENST00000429504 SLC20A1Q8WUM9 679 aa29.88■■■□□ 2.37
CERS1-201ENST00000429504 ISCUQ9H1K1 167 aa29.88■■■□□ 2.37
CERS1-201ENST00000429504 GOLGA8IPA6NC78 632 aa29.87■■■□□ 2.37
CERS1-201ENST00000429504 GOLGA8JA6NMD2 632 aa29.87■■■□□ 2.37
CERS1-201ENST00000429504 RTP1P59025 263 aa29.87■■■□□ 2.37
CERS1-201ENST00000429504 MCPH1Q8NEM0 835 aa29.87■■■□□ 2.37
CERS1-201ENST00000429504 BSNDQ8WZ55 320 aa29.87■■■□□ 2.37
CERS1-201ENST00000429504 FBXL18Q96ME1 805 aa29.87■■■□□ 2.37
CERS1-201ENST00000429504 KIFC3Q9BVG8 833 aa29.87■■■□□ 2.37
CERS1-201ENST00000429504 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP29.87■■■□□ 2.37
CERS1-201ENST00000429504 CYP39A1Q9NYL5 469 aa29.87■■■□□ 2.37
CERS1-201ENST00000429504 COQ4Q9Y3A0 265 aa29.87■■■□□ 2.37
CERS1-201ENST00000429504 PFASO15067 1338 aa29.87■■■□□ 2.37
CERS1-201ENST00000429504 GOLGA8KD6RF30 607 aa29.87■■■□□ 2.37
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