RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 TPRNQ4KMQ1 711 aa23.39■■□□□ 1.33
LIMS1-208ENST00000428064 UBXN11Q5T124 520 aa23.39■■□□□ 1.33
LIMS1-208ENST00000428064 LLGL2Q6P1M3 1020 aa23.39■■□□□ 1.33
LIMS1-208ENST00000428064 HFE2Q6ZVN8 426 aa23.39■■□□□ 1.33
LIMS1-208ENST00000428064 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa23.39■■□□□ 1.33
LIMS1-208ENST00000428064 VPS52Q8N1B4 723 aa23.39■■□□□ 1.33
LIMS1-208ENST00000428064 CCDC51Q96ER9 411 aa23.39■■□□□ 1.33
LIMS1-208ENST00000428064 MTMR9Q96QG7 549 aa23.39■■□□□ 1.33
LIMS1-208ENST00000428064 NFKBIZQ9BYH8 718 aa23.39■■□□□ 1.33
LIMS1-208ENST00000428064 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
LIMS1-208ENST00000428064 RSAD1Q9HA92 442 aa23.39■■□□□ 1.33
LIMS1-208ENST00000428064 KANSL3Q9P2N6 904 aa23.39■■□□□ 1.33
LIMS1-208ENST00000428064 ZBTB39O15060 712 aa23.38■■□□□ 1.33
LIMS1-208ENST00000428064 JAK2O60674 1132 aa23.38■■□□□ 1.33
LIMS1-208ENST00000428064 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
LIMS1-208ENST00000428064 NCLP19338 710 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
LIMS1-208ENST00000428064 PTENP60484 403 aa23.38■■□□□ 1.33
LIMS1-208ENST00000428064 ITIH3Q06033 890 aa23.38■■□□□ 1.33
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM175Q9BSA9 504 aa23.38■■□□□ 1.33
LIMS1-208ENST00000428064 UBN1Q9NPG3 1134 aa23.38■■□□□ 1.33
LIMS1-208ENST00000428064 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
LIMS1-208ENST00000428064 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa23.38■■□□□ 1.33
LIMS1-208ENST00000428064 INPPL1O15357 1258 aa23.37■■□□□ 1.33
LIMS1-208ENST00000428064 ERLIN2O94905 339 aa23.37■■□□□ 1.33
LIMS1-208ENST00000428064 CXCL14O95715 111 aa23.37■■□□□ 1.33
LIMS1-208ENST00000428064 ST3GAL1Q11201 340 aa23.37■■□□□ 1.33
LIMS1-208ENST00000428064 TFDP1Q14186 410 aa23.37■■□□□ 1.33
LIMS1-208ENST00000428064 LONRF3Q496Y0 759 aa23.37■■□□□ 1.33
LIMS1-208ENST00000428064 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
LIMS1-208ENST00000428064 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa23.37■■□□□ 1.33
LIMS1-208ENST00000428064 MFSD14AQ96MC6 490 aa23.37■■□□□ 1.33
LIMS1-208ENST00000428064 NECTIN4Q96NY8 510 aa23.37■■□□□ 1.33
LIMS1-208ENST00000428064 DNAJB4Q9UDY4 337 aa23.37■■□□□ 1.33
LIMS1-208ENST00000428064 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
LIMS1-208ENST00000428064 WNT7AO00755 349 aa23.36■■□□□ 1.33
LIMS1-208ENST00000428064 TSPAN1O60635 241 aa23.36■■□□□ 1.33
LIMS1-208ENST00000428064 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP23.36■■□□□ 1.33
LIMS1-208ENST00000428064 SLC11A1P49279 550 aa23.36■■□□□ 1.33
LIMS1-208ENST00000428064 RARRES1P49788 294 aa23.36■■□□□ 1.33
LIMS1-208ENST00000428064 ZXDAP98168 799 aa23.36■■□□□ 1.33
LIMS1-208ENST00000428064 ADAM7Q9H2U9 754 aa23.36■■□□□ 1.33
LIMS1-208ENST00000428064 DZANK1Q9NVP4 752 aa23.36■■□□□ 1.33
LIMS1-208ENST00000428064 WDFY4Q6ZS81 3184 aa23.36■■□□□ 1.33
LIMS1-208ENST00000428064 TECTAO75443 2155 aa23.35■■□□□ 1.33
LIMS1-208ENST00000428064 B4GALT3O60512 393 aa23.35■■□□□ 1.33
LIMS1-208ENST00000428064 ARL2P36404 184 aa23.35■■□□□ 1.33
LIMS1-208ENST00000428064 TXKP42681 527 aa23.35■■□□□ 1.33
LIMS1-208ENST00000428064 CES5AQ6NT32 575 aa23.35■■□□□ 1.33
LIMS1-208ENST00000428064 NOTUMQ6P988 496 aa23.35■■□□□ 1.33
LIMS1-208ENST00000428064 TRIM67Q6ZTA4 783 aa23.35■■□□□ 1.33
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF280BQ86YH2 543 aa23.35■■□□□ 1.33
LIMS1-208ENST00000428064 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
LIMS1-208ENST00000428064 DDHD2O94830 711 aa23.34■■□□□ 1.33
LIMS1-208ENST00000428064 MBTD1Q05BQ5 628 aa23.34■■□□□ 1.33
LIMS1-208ENST00000428064 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
LIMS1-208ENST00000428064 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
LIMS1-208ENST00000428064 CAPSQ13938 189 aa23.34■■□□□ 1.33
LIMS1-208ENST00000428064 PTPN14Q15678 1187 aa23.34■■□□□ 1.33
LIMS1-208ENST00000428064 PPFIBP1Q86W92 1011 aa23.34■■□□□ 1.33
LIMS1-208ENST00000428064 VN1R3Q9BXE9 311 aa23.34■■□□□ 1.33
LIMS1-208ENST00000428064 GBP3Q9H0R5 595 aa23.34■■□□□ 1.33
LIMS1-208ENST00000428064 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa23.34■■□□□ 1.33
LIMS1-208ENST00000428064 NR2E1Q9Y466 385 aa23.34■■□□□ 1.33
LIMS1-208ENST00000428064 IPPQ9Y573 584 aa23.34■■□□□ 1.33
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF318Q5VUA4 2279 aa23.34■■□□□ 1.33
LIMS1-208ENST00000428064 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa23.33■■□□□ 1.33
LIMS1-208ENST00000428064 MTHFRP42898 656 aa23.33■■□□□ 1.33
LIMS1-208ENST00000428064 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
LIMS1-208ENST00000428064 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP23.33■■□□□ 1.33
LIMS1-208ENST00000428064 AMHR2Q16671 573 aa23.33■■□□□ 1.33
LIMS1-208ENST00000428064 ASAP3Q8TDY4 903 aa23.33■■□□□ 1.33
LIMS1-208ENST00000428064 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
LIMS1-208ENST00000428064 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
LIMS1-208ENST00000428064 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
LIMS1-208ENST00000428064 CSRNP2Q9H175 543 aa23.33■■□□□ 1.33
LIMS1-208ENST00000428064 TUFT1Q9NNX1 390 aa23.33■■□□□ 1.33
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM221A6NGB7 291 aa23.32■■□□□ 1.32
LIMS1-208ENST00000428064 POTEMA6NI47 508 aa23.32■■□□□ 1.32
LIMS1-208ENST00000428064 M0R296 226 aa23.32■■□□□ 1.32
LIMS1-208ENST00000428064 SEC24BO95487 1268 aa23.32■■□□□ 1.32
LIMS1-208ENST00000428064 ALDH2P05091 517 aa23.32■■□□□ 1.32
LIMS1-208ENST00000428064 ITGA4P13612 1032 aa23.32■■□□□ 1.32
LIMS1-208ENST00000428064 GLRA2P23416 452 aa23.32■■□□□ 1.32
LIMS1-208ENST00000428064 CA8P35219 290 aa23.32■■□□□ 1.32
LIMS1-208ENST00000428064 SIGLEC14Q08ET2 396 aa23.32■■□□□ 1.32
LIMS1-208ENST00000428064 PTPN21Q16825 1174 aa23.32■■□□□ 1.32
LIMS1-208ENST00000428064 KIAA1841Q6NSI8 718 aa23.32■■□□□ 1.32
LIMS1-208ENST00000428064 SLC22A17Q8WUG5 538 aa23.32■■□□□ 1.32
LIMS1-208ENST00000428064 AUTS2Q8WXX7 1259 aa23.32■■□□□ 1.32
LIMS1-208ENST00000428064 RIPOR3Q96MK2 946 aa23.32■■□□□ 1.32
LIMS1-208ENST00000428064 APOL5Q9BWW9 433 aa23.32■■□□□ 1.32
LIMS1-208ENST00000428064 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM60Q9H2L4 133 aa23.32■■□□□ 1.32
LIMS1-208ENST00000428064 FAN1Q9Y2M0 1017 aa23.32■■□□□ 1.32
LIMS1-208ENST00000428064 DENND4AQ7Z401 1863 aa23.31■■□□□ 1.32
LIMS1-208ENST00000428064 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa23.31■■□□□ 1.32
LIMS1-208ENST00000428064 NRP1O14786 923 aa23.31■■□□□ 1.32
LIMS1-208ENST00000428064 POMCP01189 267 aa23.31■■□□□ 1.32
LIMS1-208ENST00000428064 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa23.31■■□□□ 1.32
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM87AQ8NBN3 555 aa23.31■■□□□ 1.32
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