RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000405333.5

ODC1-202, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ODC1, Length 1,943 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-202ENST00000405333 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
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ODC1-202ENST00000405333 A0A087WZ62 844 aa22.03■■□□□ 1.12
ODC1-202ENST00000405333 TREHO43280 583 aa22.03■■□□□ 1.12
ODC1-202ENST00000405333 MSCO60682 206 aa22.03■■□□□ 1.12
ODC1-202ENST00000405333 GRK4P32298 578 aa22.03■■□□□ 1.12
ODC1-202ENST00000405333 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
ODC1-202ENST00000405333 ADAM17P78536 824 aa22.03■■□□□ 1.12
ODC1-202ENST00000405333 KCNA10Q16322 511 aa22.03■■□□□ 1.12
ODC1-202ENST00000405333 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
ODC1-202ENST00000405333 C12orf56Q8IXR9 622 aa22.03■■□□□ 1.12
ODC1-202ENST00000405333 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
ODC1-202ENST00000405333 TMEM134Q9H6X4 195 aa22.03■■□□□ 1.12
ODC1-202ENST00000405333 SPC25Q9HBM1 224 aa22.03■■□□□ 1.12
ODC1-202ENST00000405333 WBP1LQ9NX94 342 aa22.03■■□□□ 1.12
ODC1-202ENST00000405333 KCNG1Q9UIX4 513 aa22.03■■□□□ 1.12
ODC1-202ENST00000405333 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP22.03■■□□□ 1.12
ODC1-202ENST00000405333 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP22.03■■□□□ 1.12
ODC1-202ENST00000405333 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa22.03■■□□□ 1.12
ODC1-202ENST00000405333 RRN3P2A6NIE6 340 aa22.02■■□□□ 1.12
ODC1-202ENST00000405333 TPM2P07951 284 aa22.02■■□□□ 1.12
ODC1-202ENST00000405333 LIG4P49917 911 aa22.02■■□□□ 1.12
ODC1-202ENST00000405333 SYCP1Q15431 976 aa22.02■■□□□ 1.12
ODC1-202ENST00000405333 SLAIN1Q8ND83 568 aa22.02■■□□□ 1.12
ODC1-202ENST00000405333 KLHDC9Q8NEP7 349 aa22.02■■□□□ 1.12
ODC1-202ENST00000405333 CPLX3Q8WVH0 158 aa22.02■■□□□ 1.12
ODC1-202ENST00000405333 POMGNT1Q8WZA1 660 aa22.02■■□□□ 1.12
ODC1-202ENST00000405333 KCNN1Q92952 543 aa22.02■■□□□ 1.12
ODC1-202ENST00000405333 IMPACTQ9P2X3 320 aa22.02■■□□□ 1.12
ODC1-202ENST00000405333 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa22.02■■□□□ 1.12
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ODC1-202ENST00000405333 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.11
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ODC1-202ENST00000405333 TMOD1P28289 359 aa22.02■■□□□ 1.11
ODC1-202ENST00000405333 PTENP60484 403 aa22.02■■□□□ 1.11
ODC1-202ENST00000405333 NKX3-2P78367 333 aa22.02■■□□□ 1.11
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ODC1-202ENST00000405333 XXYLT1Q8NBI6 393 aa22.02■■□□□ 1.11
ODC1-202ENST00000405333 SLC35C1Q96A29 364 aa22.02■■□□□ 1.11
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ODC1-202ENST00000405333 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa22.01■■□□□ 1.11
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ODC1-202ENST00000405333 MBTD1Q05BQ5 628 aa22.01■■□□□ 1.11
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ODC1-202ENST00000405333 C7orf31Q8N865 590 aa22.01■■□□□ 1.11
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ODC1-202ENST00000405333 TFDP1Q14186 410 aa22■■□□□ 1.11
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ODC1-202ENST00000405333 KIZQ2M2Z5 673 aa22■■□□□ 1.11
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ODC1-202ENST00000405333 PLEKHO2Q8TD55 490 aa22■■□□□ 1.11
ODC1-202ENST00000405333 MKNK1Q9BUB5 465 aa22■■□□□ 1.11
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ODC1-202ENST00000405333 CYP2C9P11712 490 aa22■■□□□ 1.11
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ODC1-202ENST00000405333 HOXC8P31273 242 aa21.99■■□□□ 1.11
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ODC1-202ENST00000405333 APBA1Q02410 837 aa21.99■■□□□ 1.11
ODC1-202ENST00000405333 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa21.99■■□□□ 1.11
ODC1-202ENST00000405333 FKBP15Q5T1M5 1219 aa21.99■■□□□ 1.11
ODC1-202ENST00000405333 LHX8Q68G74 356 aa21.99■■□□□ 1.11
ODC1-202ENST00000405333 NLRP7Q8WX94 980 aa21.99■■□□□ 1.11
ODC1-202ENST00000405333 MMRN2Q9H8L6 949 aa21.99■■□□□ 1.11
ODC1-202ENST00000405333 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
ODC1-202ENST00000405333 SIK3Q9Y2K2 1263 aa21.99■■□□□ 1.11
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